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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8io3 | ||||||
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タイトル | Cryo-EM structure of human HCN3 channel with cilobradine | ||||||
![]() | Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3 | ||||||
![]() | MEMBRANE PROTEIN / human HCN3 channel | ||||||
機能・相同性 | ![]() cone cell pedicle / HCN channels / HCN channel complex / regulation of membrane depolarization / cellular response to dopamine / voltage-gated sodium channel activity / voltage-gated potassium channel activity / sodium ion transmembrane transport / cAMP binding / potassium ion transmembrane transport ...cone cell pedicle / HCN channels / HCN channel complex / regulation of membrane depolarization / cellular response to dopamine / voltage-gated sodium channel activity / voltage-gated potassium channel activity / sodium ion transmembrane transport / cAMP binding / potassium ion transmembrane transport / regulation of membrane potential / axon / neuronal cell body / dendrite / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.02 Å | ||||||
![]() | Yu, B. / Lu, Q.Y. / Li, J. / Zhang, J. | ||||||
資金援助 | 1件
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![]() | ![]() タイトル: Cryo-EM structure of human HCN3 channel with cilobradine 著者: Yu, B. / Lu, Q.Y. / Li, J. / Zhang, J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 323.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 252.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 35606MC M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 86142.922 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() 発現宿主: Mammalian expression vector EGFP-MCS-pcDNA3.1 (その他) 参照: UniProt: Q9P1Z3 #2: 化合物 | ChemComp-VXI / 分子量: 482.612 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C28H38N2O5 / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION 研究の焦点であるリガンドがあるか | Y | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
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試料調製
構成要素 | 名称: otassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3 タイプ: COMPLEX / Entity ID: #1 / 由来: RECOMBINANT |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
由来(組換発現) | 生物種: Mammalian expression vector BsrGI-MCS-pcDNA3.1 (その他) |
緩衝液 | pH: 7.5 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2200 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 1800 nm |
撮影 | 電子線照射量: 40 e/Å2 / フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) |
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解析
CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION | ||||||||||||||||||||||||
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3次元再構成 | 解像度: 3.02 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 121387 / 対称性のタイプ: POINT | ||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
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