PDB-8ifj: Crystal structure of pyrrolysyl-tRNA synthetase from methanogenic...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 8ifj

タイトル

Crystal structure of pyrrolysyl-tRNA synthetase from methanogenic archaeon ISO4-G1

要素

Pyrrolysyl-tRNA synthetase PylS

キーワード

TRANSLATION / non-canonical amino acids / genetic code expansion / tRNA

機能・相同性

機能・相同性情報

aminoacyl-tRNA ligase activity / tRNA aminoacylation / tRNA binding / ATP binding
類似検索 - 分子機能

生物種

methanogenic archaeon mixed culture ISO4-G1 (環境試料)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.78 Å

データ登録者

Yanagisawa, T. / Tanabe, H. / Yokoyama, S.

資金援助

日本, 4件

組織	認可番号	国
Japan Agency for Medical Research and Development (AMED)	JP17am0101081	日本
Japan Agency for Medical Research and Development (AMED)	JP19gm0010001	日本
Japan Society for the Promotion of Science (JSPS)	16K05859	日本
Japan Society for the Promotion of Science (JSPS)	24550203	日本

引用

ジャーナル: Int J Mol Sci / 年: 2023
タイトル: Crystal Structure of Pyrrolysyl-tRNA Synthetase from a Methanogenic Archaeon ISO4-G1 and Its Structure-Based Engineering for Highly-Productive Cell-Free Genetic Code Expansion with Non- ...
著者: Yanagisawa, T. / Seki, E. / Tanabe, H. / Fujii, Y. / Sakamoto, K. / Yokoyama, S.

履歴

登録	2023年2月18日	登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2023年3月15日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2023年4月26日	Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year
改定 1.2	2024年5月29日	Group: Data collection / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	8ifj.cif.gz	1.1 MB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb8ifj.ent.gz	922.3 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	8ifj.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/if/8ifj ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/if/8ifj	HTTPS FTP

-
関連構造データ

類似構造データ	類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#16 - 2001年4月アミノアシル転移RNA合成酵素 (Aminoacyl-tRNA Synthetases) 類似性 (5)

登録構造単位

A: Pyrrolysyl-tRNA synthetase PylS

B: Pyrrolysyl-tRNA synthetase PylS

C: Pyrrolysyl-tRNA synthetase PylS

D: Pyrrolysyl-tRNA synthetase PylS

E: Pyrrolysyl-tRNA synthetase PylS

F: Pyrrolysyl-tRNA synthetase PylS

G: Pyrrolysyl-tRNA synthetase PylS

H: Pyrrolysyl-tRNA synthetase PylS

I: Pyrrolysyl-tRNA synthetase PylS

J: Pyrrolysyl-tRNA synthetase PylS

313 kDa, 10 ポリマー
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1

A: Pyrrolysyl-tRNA synthetase PylS

B: Pyrrolysyl-tRNA synthetase PylS

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: gel filtration
62.5 kDa, 2 ポリマー
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2

C: Pyrrolysyl-tRNA synthetase PylS

G: Pyrrolysyl-tRNA synthetase PylS

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
62.5 kDa, 2 ポリマー
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3

D: Pyrrolysyl-tRNA synthetase PylS

F: Pyrrolysyl-tRNA synthetase PylS

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
62.5 kDa, 2 ポリマー
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4

E: Pyrrolysyl-tRNA synthetase PylS

H: Pyrrolysyl-tRNA synthetase PylS

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
62.5 kDa, 2 ポリマー
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5

I: Pyrrolysyl-tRNA synthetase PylS

J: Pyrrolysyl-tRNA synthetase PylS

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
62.5 kDa, 2 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	98.510, 102.680, 349.860
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

#1: タンパク質	Pyrrolysyl-tRNA synthetase PylS 分子量: 31256.469 Da / 分子数: 10 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) methanogenic archaeon mixed culture ISO4-G1 (環境試料) 遺伝子: AUP07_0651 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: A0A126QV54
#2: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 49 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.83 Å³/Da / 溶媒含有率: 56.54 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法 / pH: 7.2 / 詳細: HEPES, PEG 3350, KCl

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

SPring-8

/ ビームライン: BL32XU / 波長: 1 Å

検出器

タイプ: DECTRIS EIGER X 9M / 検出器: PIXEL / 日付: 2019年6月28日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 1 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2.78→49.867 Å / Num. obs: 172270 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 5.988 % / B_iso Wilson estimate: 78.526 Å² / CC_1/2: 0.998 / R_merge(I) obs: 0.145 / R_rim(I) all: 0.159 / Χ²: 1.125 / Net I/σ(I): 9.77 / Num. measured all: 1031551 / Scaling rejects: 7

反射シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Mean I/σ(I) obs	Num. measured obs	Num. possible	Num. unique obs	CC_1/2	R_rim(I) all	% possible all
2.78-2.85	6.066	1.866	1.01	77389	12770	12757	0.692	2.042	99.9
2.85-2.93	6.094	1.515	1.27	75597	12425	12405	0.768	1.657	99.8
2.93-3.02	5.994	1.121	1.74	72317	12076	12064	0.863	1.229	99.9
3.02-3.11	5.914	0.925	2.12	69522	11769	11755	0.895	1.015	99.9
3.11-3.21	5.786	0.684	2.88	65988	11413	11405	0.935	0.752	99.9
3.21-3.32	5.579	0.512	3.79	61211	10982	10971	0.954	0.564	99.9
3.32-3.45	5.103	0.417	4.61	54150	10629	10611	0.95	0.464	99.8
3.45-3.59	5.219	0.303	6.23	53052	10197	10166	0.982	0.337	99.7
3.59-3.75	5.773	0.259	8.17	56821	9851	9842	0.986	0.285	99.9
3.75-3.93	5.485	0.205	10.17	51397	9380	9370	0.992	0.226	99.9
3.93-4.14	5.496	0.152	12.74	48950	8907	8906	0.995	0.167	100
4.14-4.4	6.366	0.138	15.94	53510	8409	8405	0.997	0.15	100
4.4-4.7	6.474	0.121	18.7	51226	7913	7913	0.997	0.131	100
4.7-5.08	6.431	0.1	21.08	47612	7404	7404	0.997	0.109	100
5.08-5.56	6.646	0.112	19.63	44912	6760	6758	0.997	0.122	100
5.56-6.22	6.693	0.106	21.49	41077	6137	6137	0.997	0.115	100
6.22-7.18	6.921	0.102	23.53	37465	5415	5413	0.997	0.11	100
7.18-8.79	7.148	0.085	27.83	32660	4569	4569	0.997	0.092	100
8.79-12.43	6.881	0.055	32.51	24214	3519	3519	0.998	0.06	100
12.43-49.867	6.569	0.052	32.57	12481	1935	1900	0.998	0.056	98.2

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
XSCALE		データスケーリング
PHENIX	1.16_3549	精密化
PDB_EXTRACT	3.27	データ抽出
XDS		データ削減
MOLREP		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 2.78→49.867 Å / SU ML: 0.48 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 34.72 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2962	3798	2.21 %
R_work	0.2326	168163	-
obs	0.234	171961	99.72 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 223.18 Å² / B_iso mean: 100.0042 Å² / B_iso min: 27.71 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 2.78→49.867 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	21566	0	0	49	21615
B_iso mean	-	-	-	57.18	-
残基数	-	-	-	-	2712

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / R_factor R_free error: 0

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	% reflection obs (%)
2.78-2.8152	0.4103	132	0.405	6224	100
2.8152-2.8522	0.442	133	0.3986	6247	100
2.8522-2.8913	0.5284	158	0.3903	6183	100
2.8913-2.9326	0.3335	148	0.3763	6214	100
2.9326-2.9763	0.401	124	0.3424	6233	99
2.9763-3.0228	0.3565	147	0.3145	6229	100
3.0228-3.0724	0.3178	141	0.3155	6213	100
3.0724-3.1254	0.3676	140	0.3044	6199	100
3.1254-3.1822	0.3906	118	0.3048	6242	100
3.1822-3.2434	0.35	152	0.3076	6237	100
3.2434-3.3096	0.4284	146	0.3034	6258	100
3.3096-3.3815	0.3528	153	0.3105	6162	100
3.3815-3.4602	0.2923	126	0.2851	6232	100
3.4602-3.5467	0.3633	136	0.2687	6243	100
3.5467-3.6425	0.3659	155	0.2557	6249	100
3.6425-3.7497	0.301	131	0.2468	6219	100
3.7497-3.8707	0.2695	136	0.2386	6185	100
3.8707-4.009	0.2596	147	0.2239	6232	100
4.009-4.1694	0.2821	140	0.2173	6257	100
4.1694-4.359	0.2652	131	0.2081	6261	100
4.359-4.5887	0.2472	141	0.1935	6219	100
4.5887-4.876	0.2172	139	0.1811	6286	100
4.876-5.2521	0.2425	148	0.1785	6210	100
5.2521-5.7799	0.2721	146	0.2152	6234	100
5.7799-6.6146	0.2971	138	0.2132	6261	100
6.6146-8.3274	0.2824	150	0.2159	6237	100
8.3274-49.867	0.2809	142	0.1764	6197	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.8801	0.4851	-1.7897	1.1623	-2.2853	8.4127	-0.3127	0.3712	-0.0192	-0.3593	0.1954	0.1552	1.0903	-0.9304	0.1281	0.5136	-0.0577	-0.0236	0.7557	0.0908	0.6244	38.2987	7.7712	-60.7771
2	8.2725	-0.4207	-5.1436	2.6439	-0.9684	6.8967	-0.1969	-0.2074	-0.5719	0.189	-0.06	-0.0541	0.8577	0.1636	0.2171	0.4422	-0.0063	-0.1364	0.3048	0.0075	0.495	46.4049	-2.1635	-29.5995
3	2.3256	1.7475	-0.8095	4.3311	-3.4921	7.8712	-0.0656	0.1433	-0.2144	-0.5075	0.4921	0.3195	1.5673	-1.2976	-0.4284	0.6447	-0.1456	-0.0861	0.6372	0.0622	0.5494	34.1217	-5.1617	-37.4941
4	1.3788	0.3612	1.1533	0.4496	-0.581	6.2554	0.0848	0.4025	0.6611	0.7487	-0.3893	-0.7132	-1.409	-0.2048	0.1502	1.5782	0.0352	-0.2598	0.6939	0.003	0.9115	49.6782	17.1163	-0.0891
5	1.0775	-0.0414	0.489	2.0016	-1.4534	6.5657	-0.1046	0.1026	0.1225	0.3962	0.1224	-0.1487	-0.6047	-0.2795	0.0199	0.3602	0.0332	-0.052	0.275	0.0053	0.5202	46.8209	15.9521	-30.3237
6	2.1715	-0.2718	-1.6854	3.7236	-1.9747	7.071	-0.1024	-0.2521	0.3119	0.2574	0.1156	-0.2628	-0.5547	0.1154	0.1676	0.4338	0.0035	0.0398	0.337	-0.06	0.6242	49.7215	19.1232	-33.8843
7	2.1441	-0.1601	-0.4029	4.4674	-1.3001	6.9585	-0.0559	-0.3861	1.0499	0.6036	0.1841	0.0007	-1.9951	-0.0203	-0.1533	1.1212	0.104	-0.0253	0.6221	-0.0445	0.87	44.1189	33.4474	-33.9968
8	5.2688	-0.3384	-4.0113	4.3685	-1.5136	3.7421	0.0409	-1.3539	0.6539	0.5652	0.394	-0.1934	-1.9293	1.6595	-0.0796	0.9737	-0.1487	-0.0333	0.6748	-0.0027	0.8301	52.6727	32.6661	-37.3138
9	0.9051	-0.0207	-0.1587	4.8093	-2.0706	7.0469	-0.0163	0.0653	0.4231	0.6771	0.2628	-0.0624	-0.8878	-0.2225	-0.0969	0.4019	0.0654	0.0132	0.4005	0.0273	0.5771	45.2134	19.5319	-27.0492
10	2.0633	0.3291	-0.2536	1.6145	-0.7174	4.8525	0.3728	0.1211	-0.1184	0.0229	-0.2569	-0.1224	0.3247	0.7728	-0.0908	0.6152	0.0249	-0.0354	0.6953	0.0075	0.5532	2.9969	53.7286	-26.4983
11	3.0408	2.1441	-1.0299	4.6763	-2.4025	6.475	0.3692	0.3048	0.2893	0.2603	-0.3361	-0.4425	-0.3416	1.203	-0.0552	0.5947	-0.0635	0.03	0.8279	0.0353	0.5854	8.1003	62.4519	-31.7939
12	2.9137	-1.0144	-1.2787	3.2646	0.8257	8.9605	0.0031	0.2377	-0.6082	-0.6503	0.3445	0.0154	1.213	-0.0174	-0.0958	1.544	0.3573	-0.2754	1.0092	-0.0689	0.8458	34.2413	49.5372	-36.4355
13	1.944	-0.8949	-0.2686	1.461	-1.2573	6.3114	0.0902	0.129	-0.2804	-0.2704	0.0257	0.2001	0.7697	-0.1013	-0.1528	0.8829	0.0086	-0.1371	0.2767	0.079	0.7701	35.9776	52.1513	-9.3058
14	1.2755	-0.1198	-0.5006	1.4141	-0.9814	5.3667	-0.0275	-0.6955	-0.5322	0.2891	0.0555	0.5465	1.0443	-0.0599	0.2297	0.883	0.0235	-0.1218	0.4758	0.1588	0.9627	37.9586	45.1101	9.7434
15	4.2444	2.3306	-0.3672	5.9671	-1.9212	4.6524	-0.052	1.3508	-1.0703	-0.2678	0.3301	0.0022	1.316	-1.0035	0.0628	1.2781	-0.2259	-0.2877	0.5061	-0.0445	0.9484	32.2875	40.9165	-1.504
16	2.5493	0.2512	-1.6731	3.5285	0.4471	1.8109	0.3634	0.1866	-0.7975	-1.7019	0.0373	0.0894	2.1074	0.5717	0.0337	2.0825	-0.2752	-0.231	1.1765	-0.1763	1.3812	29.6709	31.5493	-6.2965
17	0.8339	1.4653	0.6406	2.6011	0.5438	7.2468	0.7482	-0.173	-1.7116	0.3368	0.7605	-0.1618	2.712	0.8991	0.5125	2.2817	0.24	-0.1434	0.7322	0.2089	1.1929	40.4692	32.4681	11.2484
18	2.3984	1.2522	-1.2973	3.269	-1.2133	3.5334	0.0876	0.7491	-0.6792	-0.8957	0.5599	0.3093	1.7715	-0.2548	-0.2366	1.4092	-0.0102	-0.4475	0.5525	0.0785	0.9237	32.0724	50.9874	-13.1264
19	2.3654	-0.1006	-0.1513	1.1301	-0.3324	4.7437	0.0754	0.2712	-0.1341	0.312	0.0971	-0.0511	0.2931	0.9245	-0.2015	0.6021	0.0629	-0.0671	0.9086	0.0155	0.6641	2.5609	3.0848	-54.8892
20	3.4235	1.932	-4.2736	7.5772	-3.5402	6.9265	-0.1979	0.3651	0.2183	-0.1253	0.3153	-0.5464	0.6003	1.3238	0.1493	0.4293	0.0241	-0.0576	1.5439	-0.0731	0.6498	7.2163	4.5191	-74.9786
21	3.3406	0.3031	-0.8533	1.2235	0.3029	3.1418	-0.079	0.5017	0.343	0.1038	0.2894	-0.3468	-0.1416	1.8103	-0.2006	0.5199	-0.0755	-0.0225	1.5522	-0.0017	0.61	10.3912	12.5926	-66.7589
22	1.4837	-0.0578	0.0242	2.0465	-1.494	7.0299	-0.014	-0.2005	0.0489	0.5825	0.0327	0.059	-0.5588	0.2535	-0.0578	0.9433	-0.0025	0.0216	0.3361	0.068	0.7264	40.976	62.7306	13.6939
23	0.8295	-0.9214	0.3648	4.7499	-3.0845	4.3947	-0.0199	-0.046	0.2092	0.9502	0.1124	0.1213	-1.1901	0.0106	-0.0502	1.2036	0.0917	0.0403	0.5586	0.0673	0.6585	35.6503	73.0397	1.0026
24	5.3056	0.4731	-2.9425	9.9402	6.1391	6.4152	-0.4777	0.1439	-0.7133	0.4246	0.2752	0.0451	0.6917	-1.0592	0.2125	1.1801	-0.0482	-0.2112	1.5814	0.0783	0.7713	-8.7851	43.0621	-70.2225
25	2.9632	0.174	-0.6497	1.0666	0.0033	3.9592	0.401	0.6731	-0.3968	-0.1715	-0.0542	0.0802	0.8531	-0.2128	-0.2256	0.791	-0.0245	-0.1771	0.5853	-0.0773	0.5614	-8.198	45.2814	-39.7575
26	8.1683	0.0744	-1.8348	3.2834	-2.9802	3.0404	0.5532	0.2217	-0.6306	-0.8591	-0.3501	0.2407	0.7948	0.0399	-0.153	0.892	-0.063	-0.3167	0.5861	0.0111	0.6979	-10.1069	41.2356	-36.2304
27	5.1021	1.3466	0.0916	1.7004	-1.096	4.427	0.2691	0.6862	-0.5498	-0.2105	0.1822	0.2616	1.4261	-1.1067	-0.3676	1.0959	-0.2747	-0.2075	0.8942	0.0337	0.7333	-19.769	42.6677	-38.337
28	3.9152	1.4628	4.1443	1.5491	1.8415	4.5577	0.1729	0.8362	-0.4241	0.2636	-0.0035	0.6112	0.5591	-0.0505	-0.1612	1.3439	-0.381	-0.0137	2.0684	0.0877	0.8202	-10.4977	-4.8654	-102.9183
29	2.6617	0.3845	-0.4631	2.1378	-0.1967	6.9739	0.0399	0.6504	-0.1525	0.1132	0.0076	0.0715	0.9445	-0.0973	0.001	0.4012	-0.0817	-0.0795	0.9327	0.0635	0.5374	-10.0503	-1.5831	-72.8722
30	5.1298	-1.3433	-2.5272	3.9283	1.153	4.7524	0.1292	0.3122	-0.3663	-0.4467	-0.2276	0.5303	-0.0706	0.1587	0.1155	0.576	-0.0814	-0.1458	1.0926	0.1966	0.697	-12.8993	-4.7894	-69.6122
31	5.1472	0.2352	-0.969	2.2337	1.0435	6.5047	-0.0617	0.7869	-0.3309	0.0113	-0.1697	0.4868	0.4814	-0.8859	0.0558	0.5244	-0.1284	-0.0583	1.0833	0.1171	0.6662	-21.9903	-0.7091	-71.764
32	2.8473	-0.4938	-0.4408	1.1232	-0.0679	6.1995	-0.0505	-0.5674	-0.174	0.2769	0.1265	0.3313	0.1907	-0.3976	-0.0968	0.3951	-0.0502	0.1425	0.7569	0.0329	0.689	41.1667	66.8495	-81.3356
33	3.7179	-0.8525	-0.5472	1.612	-0.4498	5.6231	-0.2905	-0.5721	-0.1275	0.5251	0.3267	0.7914	-0.1997	-1.671	0.0869	0.6032	0.0861	0.2197	1.2999	0.0764	0.8004	32.956	72.3477	-73.2115
34	7.9524	-2.1057	6.447	6.3348	-3.6204	5.8324	-0.4362	0.7021	-1.7817	0.2002	1.6516	0.1857	-2.2066	-1.3879	-0.9342	1.5615	0.3479	0.2262	2.2357	-0.0294	1.0185	52.9053	61.33	-37.7175
35	2.6379	0.6285	0.18	2.2001	-0.0136	4.7347	-0.0715	-0.8663	-0.0931	0.5951	0.2466	0.0257	0.3562	0.4793	-0.0275	0.5605	0.1416	0.0324	1.0631	-0.045	0.5149	54.4807	64.5605	-66.2621
36	7.9405	3.8256	-3.7173	7.4144	-3.7393	3.0245	-0.0293	-0.9034	-0.5358	1.1814	0.2772	-0.0825	-0.4139	0.4855	0.0893	0.7756	0.0322	-0.0087	1.2531	-0.0878	0.6152	58.0274	61.9357	-69.1934
37	5.1167	-0.9295	1.4215	2.4378	0.0215	2.7368	0.0176	-0.521	0.3927	0.3213	0.0685	-0.444	0.0482	1.8287	-0.1733	0.7485	0.0293	-0.0039	1.895	-0.2036	0.7259	71.6781	67.7072	-71.7189
38	5.0446	-0.3338	2.0904	1.5455	-0.3073	2.7517	0.0721	-2.5355	0.1717	0.5434	0.3389	0.0582	-0.1128	1.2056	-0.2417	0.8872	0.2375	0.0692	1.8684	-0.1603	0.6651	54.9124	67.7264	-56.9913

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 2 through 75 )	A	2 - 75
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 76 through 159 )	A	76 - 159
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 160 through 273 )	A	160 - 273
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'B' and (resid 2 through 28 )	B	2 - 28
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'B' and (resid 29 through 134 )	B	29 - 134
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'B' and (resid 135 through 159 )	B	135 - 159
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resid 160 through 214 )	B	160 - 214
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 215 through 228 )	B	215 - 228
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 229 through 273 )	B	229 - 273
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'C' and (resid 2 through 148 )	C	2 - 148
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'C' and (resid 149 through 273 )	C	149 - 273
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'D' and (resid 1 through 28 )	D	1 - 28
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'D' and (resid 29 through 113 )	D	29 - 113
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'D' and (resid 114 through 148 )	D	114 - 148
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'D' and (resid 149 through 189 )	D	149 - 189
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'D' and (resid 190 through 219 )	D	190 - 219
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'D' and (resid 220 through 236 )	D	220 - 236
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'D' and (resid 237 through 273 )	D	237 - 273
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'E' and (resid 1 through 120 )	E	1 - 120
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'E' and (resid 121 through 159 )	E	121 - 159
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'E' and (resid 160 through 273 )	E	160 - 273
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'F' and (resid 1 through 120 )	F	1 - 120
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'F' and (resid 121 through 273 )	F	121 - 273
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'G' and (resid 2 through 28 )	G	2 - 28
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'G' and (resid 29 through 134 )	G	29 - 134
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'G' and (resid 135 through 159 )	G	135 - 159
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'G' and (resid 160 through 273 )	G	160 - 273
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'H' and (resid 3 through 30 )	H	3 - 30
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'H' and (resid 31 through 134 )	H	31 - 134
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'H' and (resid 135 through 159 )	H	135 - 159
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'H' and (resid 160 through 273 )	H	160 - 273
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'I' and (resid 1 through 134 )	I	1 - 134
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'I' and (resid 135 through 273 )	I	135 - 273
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'J' and (resid 5 through 30 )	J	5 - 30
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'J' and (resid 31 through 134 )	J	31 - 134
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'J' and (resid 135 through 159 )	J	135 - 159
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'J' and (resid 160 through 236 )	J	160 - 236
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'J' and (resid 237 through 273 )	J	237 - 273

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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新型コロナ情報

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