分子量: 13716.472 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 詳細: Authors only can superimpose a part of the structure with good rmsd. 由来: (組換発現) Toxoplasma gondii GT1 (トキソプラズマ) 遺伝子: TGGT1_207690 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: A0A125YJ71
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実験情報
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実験
実験
手法: 溶液NMR
NMR実験
Conditions-ID
Experiment-ID
Solution-ID
Sample state
Spectrometer-ID
タイプ
1
1
1
anisotropic
1
3D HN(CA)CB
1
2
1
anisotropic
1
3DCBCA(CO)NH
1
3
1
anisotropic
1
3D HNCA
1
4
1
anisotropic
1
3D HNCO
1
5
1
anisotropic
1
2D 1H-15N HSQC
1
6
1
anisotropic
1
3D 1H-13C NOESY
1
7
1
anisotropic
1
3D 1H-15N NOESY
-
試料調製
詳細
タイプ: solution 内容: 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Protein, 25 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 10 mM sodium azide, 1 mM PMSF, 90% H2O/10% D2O 詳細: The purified protein was concentrated to 0.1-0.5 mM in buffer 25 mM sodium phosphate, 100 mM NaCl, 10 mM sodium azide and 1mM PMSF with pH 4.5 for NMR. Label: 15N_sample, 13C_sample / 溶媒系: 90% H2O/10% D2O
試料
濃度 (mg/ml)
構成要素
Isotopic labeling
Solution-ID
0.5mM
Protein
[U-100% 13C; U-100% 15N]
1
25mM
sodiumphosphate
naturalabundance
1
100mM
sodiumchloride
naturalabundance
1
10mM
sodiumazide
naturalabundance
1
1mM
PMSF
naturalabundance
1
試料状態
詳細: The purified protein was concentrated to 0.1-0.5 mM in buffer 25 mM sodium phosphate, 100 mM NaCl, 10 mM sodium azide and 1mM PMSF with pH 4.5 for NMR. イオン強度: 125 mM / Label: 1 / pH: 4.5 / 圧: 1 atm / 温度: 310 K
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NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ: Bruker AVANCE / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 850 MHz
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解析
NMR software
名称
開発者
分類
CYANA
Guntert, MumenthalerandWuthrich
精密化
CYANA
Guntert, MumenthalerandWuthrich
structurecalculation
Sparky
Goddard
chemicalshiftassignment
Sparky
Goddard
peakpicking
精密化
手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1
代表構造
選択基準: lowest energy
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100000 / 登録したコンフォーマーの数: 20