登録情報 | データベース: PDB / ID: 8dnd |
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タイトル | Crystal structure of Bothrops pirajai Piratoxin-I (PrTX-I) and synthetic inhibitor Varespladib (LY315920) |
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要素 | Basic phospholipase A2 homolog piratoxin-1 |
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キーワード | TOXIN/ANTITOXIN / PrTX-I / varespladib / Bothrops pirajai / PLA2-like toxin / TOXIN / TOXIN-ANTITOXIN complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
calcium-dependent phospholipase A2 activity / arachidonate secretion / phospholipid metabolic process / lipid catabolic process / negative regulation of T cell proliferation / phospholipid binding / toxin activity / calcium ion binding / extracellular region類似検索 - 分子機能 Phospholipase A2, aspartic acid active site / Phospholipase A2 aspartic acid active site. / Phospholipase A2 / Phospholipase A2, histidine active site / Phospholipase A2 histidine active site. / Phospholipase A2 / Phospholipase A2 domain / Phospholipase A2 / Phospholipase A2 domain superfamily類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-VRD / Basic phospholipase A2 homolog piratoxin-1類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Bothrops pirajai (ヘビ) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.018 Å |
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データ登録者 | Salvador, G.H.M. / Fontes, M.R.M. |
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資金援助 | ブラジル, 2件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Sao Paulo Research Foundation (FAPESP) | 2020/10143-7 | ブラジル | Brazilian National Council for Scientific and Technological Development (CNPq) | | ブラジル |
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引用 | ジャーナル: Biochimie / 年: 2023 タイトル: Structural basis of the myotoxic inhibition of the Bothrops pirajai PrTX-I by the synthetic varespladib. 著者: Salvador, G.H.M. / Pinto, E.K.R. / Ortolani, P.L. / Fortes-Dias, C.L. / Cavalcante, W.L.G. / Soares, A.M. / Lomonte, B. / Lewin, M.R. / Fontes, M.R.M. |
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履歴 | 登録 | 2022年7月11日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2023年8月2日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2023年8月9日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year |
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