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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8alq | ||||||
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タイトル | The Solution Structure of the Triple Mutant Methyl-CpG-Binding Domain from MeCP2 that Binds to Asymmetrically Modified DNA | ||||||
![]() | Methyl-CpG-binding protein 2 | ||||||
![]() | DNA BINDING PROTEIN / hmC-mC complex / gene regulation / methyl-CpG-binding domain (MBD) of MeCP2 | ||||||
機能・相同性 | ![]() double-stranded methylated DNA binding / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / nucleus 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
![]() | Singh, H. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Epigenetic CpG duplex marks probed by an evolved DNA reader via a well-tempered conformational plasticity. 著者: Singh, H. / Das, C.K. / Buchmuller, B.C. / Schafer, L.V. / Summerer, D. / Linser, R. #1: ![]() タイトル: Epigenetic CpG Duplex Marks Probed by an Evolved DNA Reader via a Well-Tempered Conformational Plasticity 著者: Singh, H. / Das, C.K. / Buchmuller, B.C. / Eppmann, S. / Schafer, L.V. / Summerer, D. / Linser, R. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 369.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 312.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 408.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 467.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 18.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 29.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8ajrC C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 11905.288 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 100 mM / Label: conditions_1 / pH: 6 pH* / 圧: 1 atm / 温度: 305 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 800 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | |||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | |||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |