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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7zmm | |||||||||
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タイトル | Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G2-001 | |||||||||
要素 |
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キーワード | HYDROLASE / Helicase / Apo form / Nanobody complex | |||||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 mitotic DNA-templated DNA replication / chromosome separation / cellular response to camptothecin / four-way junction helicase activity / replication-born double-strand break repair via sister chromatid exchange / DNA 3'-5' helicase / transcription preinitiation complex / DNA metabolic process / negative regulation of transcription elongation by RNA polymerase II / DNA unwinding involved in DNA replication ...mitotic DNA-templated DNA replication / chromosome separation / cellular response to camptothecin / four-way junction helicase activity / replication-born double-strand break repair via sister chromatid exchange / DNA 3'-5' helicase / transcription preinitiation complex / DNA metabolic process / negative regulation of transcription elongation by RNA polymerase II / DNA unwinding involved in DNA replication / RNA polymerase II complex binding / 3'-5' DNA helicase activity / negative regulation of double-strand break repair via homologous recombination / DNA helicase activity / isomerase activity / helicase activity / replication fork / double-strand break repair via homologous recombination / cellular response to xenobiotic stimulus / chromosome / mitotic cell cycle / DNA replication / cell division / DNA repair / ATP hydrolysis activity / DNA binding / nucleoplasm / ATP binding / identical protein binding / nucleus / metal ion binding / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) Lama glama (ラマ) | |||||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.5 Å | |||||||||
データ登録者 | Ye, M. / Makola, M. / Newman, J.A. / Fairhead, M. / MacLean, E. / Krojer, T. / Aitkenhead, H. / Bountra, C. / Gileadi, O. / von Delft, F. | |||||||||
資金援助 | 中国, 1件
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引用 | ジャーナル: To Be Published タイトル: Gluebodies improve crystal reliability and diversity through transferable nanobody mutations that introduce constitutive crystal contacts 著者: Ye, M. / Makola, M. / Newman, J.A. / Fairhead, M. / MacLean, E. / Krojer, T. / Wright, N.D. / Koekemoer, L. / Thompson, A. / Bezerra, G.A. / Yi, G. / Li, H. / Rangel, V.L. / Mamalis, D. / ...著者: Ye, M. / Makola, M. / Newman, J.A. / Fairhead, M. / MacLean, E. / Krojer, T. / Wright, N.D. / Koekemoer, L. / Thompson, A. / Bezerra, G.A. / Yi, G. / Li, H. / Rangel, V.L. / Mamalis, D. / Aitkenhead, H. / Gilbert, R.J.C. / Duerr, K. / Davis, B.G. / Bountra, C. / Gileadi, O. / von Delft, F. | |||||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 7zmm.cif.gz | 459.6 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb7zmm.ent.gz | 362.9 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 7zmm.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 7zmm_validation.pdf.gz | 493.4 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 7zmm_full_validation.pdf.gz | 522.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | 7zmm_validation.xml.gz | 75 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 7zmm_validation.cif.gz | 102.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/zm/7zmm ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/zm/7zmm | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | 7zmlC 7zmnC 7zmoC 7zmpC 7zmqC 7zmrC 7zmsC 7zmtC 7zmvC 5lb5S S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献) |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索 |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCSドメイン:
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