+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 7ypv | ||||||
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Title | Crystal structure of OrE-ST-F | ||||||
Components | Acetyltransferase | ||||||
Keywords | TRANSFERASE / acetyltransferase streptothricin F | ||||||
Function / homology | peptide-alanine-alpha-N-acetyltransferase activity / : / Acetyltransferase (GNAT) family / Gcn5-related N-acetyltransferase (GNAT) domain profile. / GNAT domain / Acyl-CoA N-acyltransferase / Streptothricin F / Acetyltransferase Function and homology information | ||||||
Biological species | Streptomyces lavendulae subsp. lavendulae (bacteria) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.415 Å | ||||||
Authors | Wang, Y.L. / Li, T.L. | ||||||
Funding support | Taiwan, 1items
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Citation | Journal: Nat Commun / Year: 2023 Title: N-Formimidoylation/-iminoacetylation modification in aminoglycosides requires FAD-dependent and ligand-protein NOS bridge dual chemistry. Authors: Wang, Y.L. / Chang, C.Y. / Hsu, N.S. / Lo, I.W. / Lin, K.H. / Chen, C.L. / Chang, C.F. / Wang, Z.C. / Ogasawara, Y. / Dairi, T. / Maruyama, C. / Hamano, Y. / Li, T.L. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 7ypv.cif.gz | 294 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb7ypv.ent.gz | 229.5 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 7ypv.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 7ypv_validation.pdf.gz | 3.2 MB | Display | wwPDB validaton report |
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Full document | 7ypv_full_validation.pdf.gz | 3.2 MB | Display | |
Data in XML | 7ypv_validation.xml.gz | 56 KB | Display | |
Data in CIF | 7ypv_validation.cif.gz | 73.9 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/yp/7ypv ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/yp/7ypv | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | 7xqaC 7xx0C 7xxcC 7xxdC 7xxmC 7xxpC 7xxrC 7xyeC 7xylC 7y0xC 7ypuC 8griC 3pp9S S: Starting model for refinement C: citing same article (ref.) |
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Similar structure data | Similarity search - Function & homologyF&H Search |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Beg auth comp-ID: THR / Beg label comp-ID: THR
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