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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7ymm | ||||||||||||
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タイトル | PSII-Pcb Tetramer of Acaryochloris Marina | ||||||||||||
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![]() | PHOTOSYNTHESIS / Photosystem II / Pcb | ||||||||||||
機能・相同性 | ![]() photosystem / oxygen evolving activity / photosystem II stabilization / photosystem II / photosystem II reaction center / oxidoreductase activity, acting on diphenols and related substances as donors, oxygen as acceptor / photosynthetic electron transport chain / response to herbicide / photosystem II / plasma membrane-derived thylakoid membrane ...photosystem / oxygen evolving activity / photosystem II stabilization / photosystem II / photosystem II reaction center / oxidoreductase activity, acting on diphenols and related substances as donors, oxygen as acceptor / photosynthetic electron transport chain / response to herbicide / photosystem II / plasma membrane-derived thylakoid membrane / chlorophyll binding / photosynthesis, light reaction / electron transporter, transferring electrons within the cyclic electron transport pathway of photosynthesis activity / phosphate ion binding / photosynthetic electron transport in photosystem II / photosynthesis / manganese ion binding / electron transfer activity / protein stabilization / iron ion binding / heme binding / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||||||||
生物種 | ![]() | ||||||||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.6 Å | ||||||||||||
![]() | Shen, L.L. / Gao, Y.Z. / Wang, W.D. / Zhang, X. / Shen, J.R. / Wang, P.Y. / Han, G.Y. | ||||||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structure of a large photosystem II supercomplex from Acaryochloris marina. 著者: Shen, L.L. / Gao, Y.Z. / Wang, W.D. / Zhang, X. / Shen, J.R. / Wang, P.Y. / Han, G.Y. | ||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 2.9 MB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 表示 | ![]() | |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 28.9 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 30.8 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 727.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 884 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 33933MC ![]() 7ymiC M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
-Photosystem II ... , 14種, 56分子 1A2A3A4A1B2B3B4B1C2C3C4C1D2D3D4D1F2F3F4F1H2H3H4H1I2I3I4I1K2K...
#1: タンパク質 | 分子量: 39695.211 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() 参照: UniProt: A5A8K9, photosystem II #2: タンパク質 | 分子量: 56518.746 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() 参照: UniProt: B0CFM2 #3: タンパク質 | 分子量: 53978.320 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() 参照: UniProt: B0C1V7 #4: タンパク質 | 分子量: 39291.852 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() 参照: UniProt: B0C1V6, photosystem II #6: タンパク質 | 分子量: 11277.320 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() 参照: UniProt: B0C2V2 #7: タンパク質 | 分子量: 7683.901 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() 参照: UniProt: B0CDZ2 #8: タンパク質・ペプチド | 分子量: 3948.692 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() 参照: UniProt: B0C5R5 #9: タンパク質・ペプチド | 分子量: 4939.008 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() 参照: UniProt: B0C6Z7 #10: タンパク質・ペプチド | 分子量: 4254.045 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() 参照: UniProt: B0C6T1 #11: タンパク質・ペプチド | 分子量: 3614.302 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() 参照: UniProt: B0CFM0 #12: タンパク質・ペプチド | 分子量: 5442.383 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() 参照: UniProt: B0C605 #13: タンパク質・ペプチド | 分子量: 4443.303 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() 参照: UniProt: B0BYW9 #14: タンパク質・ペプチド | 分子量: 4015.932 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() #15: タンパク質 | 分子量: 6395.632 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() 参照: UniProt: B0C0S7 |
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-High light inducible ... , 4種, 16分子 12223242112131411323334314243444
#16: タンパク質 | 分子量: 38753.934 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() 参照: UniProt: B0C3E5 #18: タンパク質 | 分子量: 38612.156 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() 参照: UniProt: B0C576 #19: タンパク質 | 分子量: 38707.781 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() 参照: UniProt: B0C6I0 #20: タンパク質 | 分子量: 37967.473 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() 参照: UniProt: B0C3E6 |
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-タンパク質 / タンパク質・ペプチド / 糖 , 3種, 16分子 1E2E3E4E1G2G3G4G![](data/chem/img/DGD.gif)
![](data/chem/img/DGD.gif)
#17: タンパク質・ペプチド | 分子量: 3507.314 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() #27: 糖 | ChemComp-DGD / #5: タンパク質 | 分子量: 9495.788 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() 参照: UniProt: B0C6T2 |
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-非ポリマー , 11種, 616分子 ![](data/chem/img/CL7.gif)
![](data/chem/img/PHO.gif)
![](data/chem/img/8CT.gif)
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![](data/chem/img/PL9.gif)
![](data/chem/img/HEM.gif)
![](data/chem/img/ZEX.gif)
![](data/chem/img/PHO.gif)
![](data/chem/img/8CT.gif)
![](data/chem/img/LMG.gif)
![](data/chem/img/SQD.gif)
![](data/chem/img/LHG.gif)
![](data/chem/img/FE2.gif)
![](data/chem/img/BCT.gif)
![](data/chem/img/PL9.gif)
![](data/chem/img/HEM.gif)
![](data/chem/img/ZEX.gif)
#21: 化合物 | ChemComp-CL7 / #22: 化合物 | ChemComp-PHO / #23: 化合物 | ChemComp-8CT / ( #24: 化合物 | ChemComp-LMG / #25: 化合物 | ChemComp-SQD / #26: 化合物 | ChemComp-LHG / #28: 化合物 | ChemComp-FE2 / #29: 化合物 | ChemComp-BCT / #30: 化合物 | ChemComp-PL9 / #31: 化合物 | ChemComp-HEM / #32: 化合物 | ChemComp-ZEX / ( |
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