PDB-7y8w: Crystal structure of DLC-1/SAO-1 complex

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 7y8w

タイトル

Crystal structure of DLC-1/SAO-1 complex

要素

Dynein light chain 1, cytoplasmic
Isoform b of Suppressor of aph-1

キーワード

PROTEIN BINDING / Complex

機能・相同性

機能・相同性情報

regulation of protein deneddylation / Aggrephagy / COPI-mediated anterograde transport / COPI-independent Golgi-to-ER retrograde traffic / Intraflagellar transport / Macroautophagy / HSP90 chaperone cycle for steroid hormone receptors (SHR) in the presence of ligand / Neutrophil degranulation / nuclear migration along microtubule / cytoplasmic dynein complex ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Caenorhabditis elegans (センチュウ)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.4 Å

データ登録者

Yan, H. / Zhao, C. / Wei, Z. / Yu, C.

資金援助

中国, 3件

組織	認可番号	国
National Natural Science Foundation of China (NSFC)	31870757	中国
National Natural Science Foundation of China (NSFC)	31971131	中国
National Natural Science Foundation of China (NSFC)	32170697	中国

引用

ジャーナル: Cell Death Discov / 年: 2022
タイトル: Interaction between DLC-1 and SAO-1 facilitates CED-4 translocation during apoptosis in the Caenorhabditis elegans germline.
著者: Zhang, D. / Yang, H. / Jiang, L. / Zhao, C. / Wang, M. / Hu, B. / Yu, C. / Wei, Z. / Tse, Y.C.

履歴

登録	2022年6月24日	登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2023年7月26日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2024年5月29日	Group: Data collection / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	7y8w.cif.gz	473 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb7y8w.ent.gz	396.9 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	7y8w.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	7y8w_validation.pdf.gz	592.7 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	7y8w_full_validation.pdf.gz	602.5 KB	表示
XML形式データ	7y8w_validation.xml.gz	37.5 KB	表示
CIF形式データ	7y8w_validation.cif.gz	53.7 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/y8/7y8w ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/y8/7y8w	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	3p8mS S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: Dynein light chain 1, cytoplasmic

B: Dynein light chain 1, cytoplasmic

C: Dynein light chain 1, cytoplasmic

D: Dynein light chain 1, cytoplasmic

E: Isoform b of Suppressor of aph-1

F: Isoform b of Suppressor of aph-1

G: Dynein light chain 1, cytoplasmic

H: Dynein light chain 1, cytoplasmic

I: Dynein light chain 1, cytoplasmic

J: Dynein light chain 1, cytoplasmic

K: Isoform b of Suppressor of aph-1

L: Isoform b of Suppressor of aph-1

M: Dynein light chain 1, cytoplasmic

N: Dynein light chain 1, cytoplasmic

O: Isoform b of Suppressor of aph-1

P: Isoform b of Suppressor of aph-1

Q: Dynein light chain 1, cytoplasmic

R: Dynein light chain 1, cytoplasmic

S: Isoform b of Suppressor of aph-1

T: Isoform b of Suppressor of aph-1

ヘテロ分子

157 kDa, 20 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Dynein light chain 1, cytoplasmic

B: Dynein light chain 1, cytoplasmic

C: Dynein light chain 1, cytoplasmic

D: Dynein light chain 1, cytoplasmic

E: Isoform b of Suppressor of aph-1

F: Isoform b of Suppressor of aph-1

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
50.4 kDa, 6 ポリマー
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2

G: Dynein light chain 1, cytoplasmic

H: Dynein light chain 1, cytoplasmic

I: Dynein light chain 1, cytoplasmic

J: Dynein light chain 1, cytoplasmic

K: Isoform b of Suppressor of aph-1

L: Isoform b of Suppressor of aph-1

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
50.3 kDa, 6 ポリマー
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3

M: Dynein light chain 1, cytoplasmic

N: Dynein light chain 1, cytoplasmic

O: Isoform b of Suppressor of aph-1

P: Isoform b of Suppressor of aph-1

登録者が定義した集合体
28.4 kDa, 4 ポリマー
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4

Q: Dynein light chain 1, cytoplasmic

R: Dynein light chain 1, cytoplasmic

S: Isoform b of Suppressor of aph-1

T: Isoform b of Suppressor of aph-1

登録者が定義した集合体
28.4 kDa, 4 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	40.274, 163.515, 229.132
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.460, 90.000
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:
NCSドメイン領域:

Component-ID: 1

Dom-ID	Ens-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Selection details	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	LYS	LYS	GLY	GLY	chain A	A	A	5 - 89	11 - 95
2	1	ARG	ARG	GLY	GLY	chain B	B	B	4 - 89	10 - 95
3	1	ARG	ARG	SER	SER	chain C	C	C	4 - 88	10 - 94
4	1	ALA	ALA	GLY	GLY	chain D	D	D	6 - 89	12 - 95
5	1	ARG	ARG	GLY	GLY	chain G	G	G	4 - 89	10 - 95
6	1	ARG	ARG	GLY	GLY	chain H	H	H	4 - 89	10 - 95
7	1	LYS	LYS	GLY	GLY	chain I	I	I	5 - 89	11 - 95
8	1	ALA	ALA	GLY	GLY	chain J	J	J	6 - 89	12 - 95
9	1	ARG	ARG	GLY	GLY	chain M	M	M	4 - 89	10 - 95
10	1	VAL	VAL	SER	SER	chain N	N	N	2 - 88	8 - 94
11	1	LYS	LYS	GLY	GLY	chain Q	Q	Q	5 - 89	11 - 95
12	1	VAL	VAL	SER	SER	chain R	R	R	2 - 88	8 - 94
1	2	PHE	PHE	PRO	PRO	chain E	E	E	181 - 203	6 - 28
2	2	PHE	PHE	VAL	VAL	chain F	F	F	181 - 204	6 - 29
3	2	PHE	PHE	PRO	PRO	chain K	K	K	181 - 203	6 - 28
4	2	PHE	PHE	VAL	VAL	chain L	L	L	181 - 204	6 - 29
1	3	VAL	VAL	PRO	PRO	chain O	O	O	193 - 203	18 - 28
2	3	VAL	VAL	PRO	PRO	chain P	P	P	192 - 203	17 - 28
3	3	MET	MET	PRO	PRO	chain S	S	S	194 - 203	19 - 28
4	3	VAL	VAL	PRO	PRO	chain T	T	T	192 - 203	17 - 28

NCSアンサンブル:

ID
1
2
3

#1: タンパク質	Dynein light chain 1, cytoplasmic 分子量: 10933.447 Da / 分子数: 12 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Caenorhabditis elegans (センチュウ) 遺伝子: dlc-1, T26A5.9 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: Q22799
#2: タンパク質・ペプチド	Isoform b of Suppressor of aph-1 分子量: 3250.588 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Caenorhabditis elegans (センチュウ) 遺伝子: sao-1, R10D12.14 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: C6KRN1
#3: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 26 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
研究の焦点であるリガンドがあるか	N

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.4 Å³/Da / 溶媒含有率: 48.74 %
結晶化	温度: 289 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7.5 詳細: 0.2 M Potassium chloride, 0.05 M HEPES pH 7.5, 35% (v/v) Pentaerythritol propoxylate

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

SSRF

/ ビームライン: BL18U1 / 波長: 0.98 Å

検出器

タイプ: DECTRIS PILATUS3 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2019年10月20日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.98 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2.4→50 Å / Num. obs: 55428 / % possible obs: 95.3 % / 冗長度: 5.2 % / B_iso Wilson estimate: 37.03 Å² / R_merge(I) obs: 0.129 / R_pim(I) all: 0.059 / R_rim(I) all: 0.142 / Χ²: 0.861 / Net I/σ(I): 3.9 / Num. measured all: 285979

反射シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Num. unique obs	CC_1/2	R_pim(I) all	R_rim(I) all	Χ²	% possible all
2.4-2.44	4.9	0.762	2782	0.775	0.361	0.847	0.726	97
2.44-2.49	4.7	0.708	2816	0.793	0.344	0.792	0.726	95.6
2.49-2.53	5	0.601	2817	0.908	0.281	0.666	0.737	96.7
2.53-2.59	5	0.563	2718	0.89	0.263	0.624	0.755	95.8
2.59-2.64	5.3	0.519	2830	0.908	0.232	0.571	0.754	97.1
2.64-2.7	5.3	0.465	2824	0.935	0.209	0.512	0.748	96.6
2.7-2.77	5.2	0.378	2777	0.947	0.169	0.416	0.773	97.1
2.77-2.85	5.3	0.338	2817	0.963	0.151	0.372	0.78	96.8
2.85-2.93	5.1	0.293	2814	0.963	0.133	0.323	0.809	96.6
2.93-3.02	5.2	0.241	2798	0.977	0.109	0.265	0.825	96.2
3.02-3.13	5.1	0.212	2799	0.975	0.098	0.234	0.818	96.2
3.13-3.26	4.8	0.189	2731	0.979	0.09	0.211	0.854	95
3.26-3.41	5.1	0.135	2787	0.99	0.062	0.149	0.94	94.7
3.41-3.58	5.5	0.108	2753	0.996	0.048	0.119	1.004	96
3.58-3.81	5.4	0.101	2782	0.993	0.044	0.11	1.092	95.4
3.81-4.1	5.4	0.085	2782	0.994	0.038	0.094	1.009	95.2
4.1-4.52	5.2	0.075	2751	0.989	0.035	0.083	1.081	94.2
4.52-5.17	5	0.069	2681	0.994	0.033	0.077	1.006	92.1
5.17-6.51	5.6	0.071	2716	0.995	0.031	0.078	0.842	92.6
6.51-50	5.2	0.058	2653	0.996	0.026	0.064	0.895	89.7

-
位相決定

位相決定	手法: 分子置換

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.9_1692	精密化
HKL-2000		データスケーリング
PHASER		位相決定
PDB_EXTRACT	3.27	データ抽出
HKL-3000		データ削減

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 3P8M

3p8m

解像度: 2.4→50 Å / SU ML: 0.35 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 34.22 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2849	1962	3.58 %
R_work	0.2532	52908	-
obs	0.2544	54870	95.05 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 135.57 Å² / B_iso mean: 66.712 Å² / B_iso min: 15.77 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 2.4→50 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	9280	0	18	26	9324
B_iso mean	-	-	68.43	42.45	-
残基数	-	-	-	-	1165

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.003	9489
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.707	12809
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.027	1400
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.002	1631
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	11.787	3387

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Refine-ID	Rms	タイプ
1	1	A	4936	X-RAY DIFFRACTION	8.897	TORSIONAL
1	2	B	4936	X-RAY DIFFRACTION	8.897	TORSIONAL
1	3	C	4936	X-RAY DIFFRACTION	8.897	TORSIONAL
1	4	D	4936	X-RAY DIFFRACTION	8.897	TORSIONAL
1	5	G	4936	X-RAY DIFFRACTION	8.897	TORSIONAL
1	6	H	4936	X-RAY DIFFRACTION	8.897	TORSIONAL
1	7	I	4936	X-RAY DIFFRACTION	8.897	TORSIONAL
1	8	J	4936	X-RAY DIFFRACTION	8.897	TORSIONAL
1	9	M	4936	X-RAY DIFFRACTION	8.897	TORSIONAL
1	10	N	4936	X-RAY DIFFRACTION	8.897	TORSIONAL
1	11	Q	4936	X-RAY DIFFRACTION	8.897	TORSIONAL
1	12	R	4936	X-RAY DIFFRACTION	8.897	TORSIONAL
2	1	E	417	X-RAY DIFFRACTION	8.897	TORSIONAL
2	2	F	417	X-RAY DIFFRACTION	8.897	TORSIONAL
2	3	K	417	X-RAY DIFFRACTION	8.897	TORSIONAL
2	4	L	417	X-RAY DIFFRACTION	8.897	TORSIONAL
3	1	O	202	X-RAY DIFFRACTION	8.897	TORSIONAL
3	2	P	202	X-RAY DIFFRACTION	8.897	TORSIONAL
3	3	S	202	X-RAY DIFFRACTION	8.897	TORSIONAL
3	4	T	202	X-RAY DIFFRACTION	8.897	TORSIONAL

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / R_factor R_free error: 0 / Total num. of bins used: 14

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
2.4-2.46	0.3373	140	0.3432	3781	3921	96
2.46-2.5264	0.3526	142	0.3378	3878	4020	96
2.5264-2.6006	0.362	138	0.3321	3752	3890	96
2.6006-2.6845	0.3551	136	0.3321	3894	4030	97
2.6845-2.7803	0.3429	139	0.3186	3741	3880	96
2.7803-2.8914	0.3338	143	0.3127	3908	4051	97
2.8914-3.0227	0.329	143	0.305	3786	3929	96
3.0227-3.1817	0.3614	141	0.3112	3783	3924	96
3.1817-3.3805	0.3115	142	0.2892	3810	3952	94
3.3805-3.6407	0.2959	140	0.2583	3776	3916	96
3.6407-4.0054	0.3051	147	0.2365	3799	3946	95
4.0054-4.5812	0.2118	138	0.196	3698	3836	94
4.5812-5.7577	0.2189	139	0.1863	3724	3863	93
5.7577-23.4575	0.2266	134	0.19	3578	3712	89

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.5509	0.3663	0.1951	0.1645	-0.0348	0.363	-0.0815	0.0974	-0.0154	-0.0179	-0.1661	-0.3592	-0.0217	0.4175	-0.1848	0.0773	-0.037	-0.0227	0.6486	0.0528	0.4368	9.7113	41.0316	237.756
2	1.7133	0.5386	-0.1917	0.8105	0.2292	0.579	0.0093	0.0479	-0.0011	0.0401	-0.0617	-0.3107	-0.009	0.2364	-0.0281	0.0236	-0.0377	-0.0261	0.3594	0.0439	0.2941	8.2343	41.4548	246.9043
3	3.4404	0.5457	-1.3455	2.0229	-0.7709	3.4278	0.1426	0.022	0.0842	0.0918	0.2976	0.1921	-0.2745	-0.6603	-0.3638	0.2571	-0.0618	0.1688	0.7861	0.0821	0.6881	-13.2174	37.4601	252.7559
4	4.2901	2.9778	1.5176	8.0895	2.2446	4.5637	0.3709	-0.53	0.0743	1.5422	-0.1843	0.8406	-0.2772	-1.1087	-0.1032	0.8529	0.0443	0.3182	0.6497	0.0881	0.5104	-10.0418	41.0344	263.0693
5	2.8563	0.2583	0.9525	1.6786	1.2072	1.077	0.188	-0.4146	0.2204	1.1619	-0.0306	0.3649	-1.2403	-0.1841	-0.1793	0.7504	-0.0015	0.1193	0.3526	-0.021	0.2661	-0.1959	42.7547	262.4734
6	0.6202	0.1776	-0.0042	0.3112	-0.3254	0.5234	0.0754	0.0116	-0.106	0.0499	0.0846	0.333	-0.0182	-0.3028	0.087	0.0699	-0.0522	0.0231	0.474	0.0293	0.4058	-3.5328	38.0907	251.9057
7	2.508	2.3862	-0.2999	2.4624	0.9128	7.5058	0.1612	-0.2738	0.5714	0.3337	0.2633	0.1378	-0.2155	-0.4589	-0.3203	0.1568	-0.0029	0.0637	0.3333	0.0231	0.319	-4.2139	40.2876	253.5281
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51	2.8246	0.0741	1.2684	0.5831	0.9564	4.573	0.4457	0.0422	0.0323	-0.1777	-0.1475	-0.0481	0.1448	0.0545	-0.1483	1.8885	0.0556	0.1347	0.4236	0.0137	0.4455	28.771	26.2786	284.7276
52	1.0918	0.3487	-0.2408	3.4663	0.0935	0.2686	0.0481	-0.0714	0.109	0.2518	0.0519	-0.047	0.0587	0.0191	0.0378	1.7375	-0.1522	-0.2517	0.4318	-0.007	0.6178	24.6323	8.0324	299.2272
53	0.2359	-0.0215	-0.2168	0.0813	0.2498	0.8702	0.1428	-0.1094	-0.0669	0.029	-0.0332	-0.0464	0.2298	0.1865	-0.0681	2.0932	-0.1432	-0.0961	0.4938	-0.0053	0.4222	29.7013	18.4893	303.2476
54	1.9783	0.0077	-1.0033	0.5622	0.2852	5.6832	0.1291	0.0222	-0.0817	0.2201	-0.0586	-0.0684	0.2603	0.3889	-0.0919	1.9698	0.1198	-0.1391	0.4906	-0.0212	0.4727	29.8502	15.6734	289.0966
55	0.5886	0.0252	-0.132	0.5037	0.5484	0.9583	0.2228	-0.0192	-0.0903	0.0842	-0.0637	-0.0348	-0.0427	0.056	0.1012	2.045	-0.0461	-0.3188	0.4883	0.0167	0.5335	27.3126	13.9121	295.751
56	4.2523	-3.6697	-1.089	3.3203	0.6521	0.8111	-0.0829	0.3048	-0.5364	-0.3884	-0.2361	0.222	0.0827	-0.0427	0.122	1.914	0.1695	-0.1597	0.4943	-0.0169	0.57	28.683	12.1217	286.7382
57	1.8464	0.6981	0.2023	0.704	0.4707	2.4886	-0.2761	-0.2545	-0.0619	0.0169	-0.0348	0.0151	-0.0425	-0.0799	0.0999	1.8942	0.0763	0.2613	0.522	-0.0066	0.5288	28.8463	30.4907	293.8753
58	1.8442	0.1687	-0.1948	4.8675	-1.5716	1.1773	0.0982	-0.1221	0.0184	0.4875	-0.0412	-0.0369	-0.14	0.0303	-0.0596	1.8729	-0.1186	-0.3287	0.4877	0.0227	0.5353	8.3564	45.5781	289.0073
59	1.0369	-0.6152	0.1066	1.4497	-1.4722	2.4701	-0.0107	-0.0682	0.0731	0.2647	-0.1993	-0.1605	-0.1412	0.3957	0.2624	1.963	-0.2569	-0.2166	0.6888	0.1323	0.5623	8.4177	51.6708	298.7172
60	0.7905	-0.373	-0.389	0.9835	1.4762	2.5852	0.0261	-0.0826	-0.0325	0.1469	0.2446	-0.174	0.3314	0.3835	-0.3185	2.0101	-0.4226	0.01	0.6955	-0.0666	0.5227	9.878	60.9249	296.0002
61	0.3297	0.0501	-0.0685	0.5229	-0.4466	4.0499	0.1127	-0.1539	-0.0411	0.2042	-0.1093	-0.0896	0.1705	0.5301	0.2677	1.9681	-0.2397	-0.0646	0.5683	0.0243	0.4069	12.1366	56.0346	284.8734
62	0.5257	-0.1339	-0.2671	0.1899	0.07	3.0084	0.2871	-0.0477	-0.0629	0.0038	-0.0942	-0.0085	-0.0661	0.0766	0.1244	1.8971	-0.1715	-0.2189	0.4785	0.0401	0.4574	8.1838	52.8131	288.2488
63	0.3769	-0.16	0.0572	0.0669	-0.0251	0.0095	0.4416	0.1089	0.1452	-0.1318	-0.2003	-0.0957	-0.2468	0.1028	0.119	2.085	0.1026	0.1596	0.5018	0.0465	0.4565	8.9412	65.3274	269.7012
64	0.1961	-0.0472	-0.1599	0.3537	-0.1218	0.7175	0.2686	-0.0233	0.0815	-0.0014	-0.077	-0.0648	-0.1837	0.1146	0.3487	2.124	-0.0333	0.1559	0.4385	0.0097	0.4033	10.0375	65.6437	278.9627
65	2.8621	0.7543	0.8279	2.5002	1.4342	1.7656	-0.6334	0.2112	0.4335	-0.3412	0.4128	-0.0005	-0.7546	0.2758	0.2436	1.625	-0.2172	0.1885	0.4588	-0.0603	0.509	7.185	69.1667	285.8911
66	0.9431	-0.4398	0.0122	3.2065	0.5732	0.4688	-0.2415	-0.1542	0.4797	0.1834	0.018	-0.1039	0.0764	-0.0042	0.0297	1.7087	-0.0888	-0.2118	0.4537	-0.0167	0.5006	8.8266	51.2388	279.2243

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 5 through 50 )	A	5 - 50
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 51 through 89 )	A	51 - 89
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'B' and (resid 5 through 14 )	B	5 - 14
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'B' and (resid 15 through 31 )	B	15 - 31
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'B' and (resid 32 through 50 )	B	32 - 50
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'B' and (resid 51 through 78 )	B	51 - 78
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resid 79 through 89 )	B	79 - 89
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'C' and (resid 5 through 14 )	C	5 - 14
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'C' and (resid 15 through 31 )	C	15 - 31
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'C' and (resid 32 through 50 )	C	32 - 50
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'C' and (resid 51 through 59 )	C	51 - 59
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'C' and (resid 60 through 71 )	C	60 - 71
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'C' and (resid 72 through 80 )	C	72 - 80
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'C' and (resid 81 through 88 )	C	81 - 88
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'D' and (resid 6 through 31 )	D	6 - 31
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'D' and (resid 32 through 59 )	D	32 - 59
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'D' and (resid 60 through 71 )	D	60 - 71
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'D' and (resid 72 through 88 )	D	72 - 88
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'E' and (resid 181 through 190 )	E	181 - 190
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'E' and (resid 191 through 195 )	E	191 - 195
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'E' and (resid 196 through 203 )	E	196 - 203
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'F' and (resid 181 through 185 )	F	181 - 185
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'F' and (resid 186 through 190 )	F	186 - 190
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'F' and (resid 191 through 195 )	F	191 - 195
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'F' and (resid 196 through 203 )	F	196 - 203
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'G' and (resid 5 through 59 )	G	5 - 59
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'G' and (resid 60 through 89 )	G	60 - 89
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'H' and (resid 5 through 14 )	H	5 - 14
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'H' and (resid 15 through 31 )	H	15 - 31
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'H' and (resid 32 through 50 )	H	32 - 50
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'H' and (resid 51 through 78 )	H	51 - 78
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'H' and (resid 79 through 89 )	H	79 - 89
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'I' and (resid 5 through 14 )	I	5 - 14
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'I' and (resid 15 through 31 )	I	15 - 31
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'I' and (resid 32 through 59 )	I	32 - 59
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'I' and (resid 60 through 78 )	I	60 - 78
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'I' and (resid 79 through 89 )	I	79 - 89
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'J' and (resid 6 through 31 )	J	6 - 31
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'J' and (resid 32 through 59 )	J	32 - 59
40	X-RAY DIFFRACTION	40	chain 'J' and (resid 60 through 71 )	J	60 - 71
41	X-RAY DIFFRACTION	41	chain 'J' and (resid 72 through 88 )	J	72 - 88
42	X-RAY DIFFRACTION	42	chain 'K' and (resid 181 through 185 )	K	181 - 185
43	X-RAY DIFFRACTION	43	chain 'K' and (resid 186 through 195 )	K	186 - 195
44	X-RAY DIFFRACTION	44	chain 'K' and (resid 196 through 203 )	K	196 - 203
45	X-RAY DIFFRACTION	45	chain 'L' and (resid 181 through 185 )	L	181 - 185
46	X-RAY DIFFRACTION	46	chain 'L' and (resid 186 through 195 )	L	186 - 195
47	X-RAY DIFFRACTION	47	chain 'L' and (resid 196 through 203 )	L	196 - 203
48	X-RAY DIFFRACTION	48	chain 'M' and (resid 4 through 14 )	M	4 - 14
49	X-RAY DIFFRACTION	49	chain 'M' and (resid 15 through 50 )	M	15 - 50
50	X-RAY DIFFRACTION	50	chain 'M' and (resid 51 through 78 )	M	51 - 78
51	X-RAY DIFFRACTION	51	chain 'M' and (resid 79 through 89 )	M	79 - 89
52	X-RAY DIFFRACTION	52	chain 'N' and (resid 2 through 14 )	N	2 - 14
53	X-RAY DIFFRACTION	53	chain 'N' and (resid 15 through 59 )	N	15 - 59
54	X-RAY DIFFRACTION	54	chain 'N' and (resid 60 through 71 )	N	60 - 71
55	X-RAY DIFFRACTION	55	chain 'N' and (resid 72 through 88 )	N	72 - 88
56	X-RAY DIFFRACTION	56	chain 'O' and (resid 193 through 203 )	O	193 - 203
57	X-RAY DIFFRACTION	57	chain 'P' and (resid 194 through 203 )	P	194 - 203
58	X-RAY DIFFRACTION	58	chain 'Q' and (resid 5 through 14 )	Q	5 - 14
59	X-RAY DIFFRACTION	59	chain 'Q' and (resid 15 through 31 )	Q	15 - 31
60	X-RAY DIFFRACTION	60	chain 'Q' and (resid 32 through 50 )	Q	32 - 50
61	X-RAY DIFFRACTION	61	chain 'Q' and (resid 51 through 71 )	Q	51 - 71
62	X-RAY DIFFRACTION	62	chain 'Q' and (resid 72 through 89 )	Q	72 - 89
63	X-RAY DIFFRACTION	63	chain 'R' and (resid 6 through 50 )	R	6 - 50
64	X-RAY DIFFRACTION	64	chain 'R' and (resid 51 through 88 )	R	51 - 88
65	X-RAY DIFFRACTION	65	chain 'S' and (resid 194 through 203 )	S	194 - 203
66	X-RAY DIFFRACTION	66	chain 'T' and (resid 194 through 203 )	T	194 - 203

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関連情報:EMDBヘッダ

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