登録情報 | データベース: PDB / ID: 7wcq |
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タイトル | Crystal structure of HIV-1 protease in complex with lactam derivative 1 |
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要素 | Protease |
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キーワード | HYDROLASE/INHIBITOR / HYDROLASE-Inhibitor complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
viral genome integration into host DNA / establishment of integrated proviral latency / RNA stem-loop binding / RNA-directed DNA polymerase activity / endonuclease activity / aspartic-type endopeptidase activity / proteolysis / DNA binding類似検索 - 分子機能 Retropepsin-like catalytic domain / Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) / Reverse transcriptase domain / Reverse transcriptase (RT) catalytic domain profile. / Retropepsins / Retroviral aspartyl protease / Aspartyl protease, retroviral-type family profile. / Peptidase A2A, retrovirus, catalytic / Aspartic peptidase, active site / Eukaryotic and viral aspartyl proteases active site. ...Retropepsin-like catalytic domain / Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) / Reverse transcriptase domain / Reverse transcriptase (RT) catalytic domain profile. / Retropepsins / Retroviral aspartyl protease / Aspartyl protease, retroviral-type family profile. / Peptidase A2A, retrovirus, catalytic / Aspartic peptidase, active site / Eukaryotic and viral aspartyl proteases active site. / Aspartic peptidase domain superfamily / Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain / DNA/RNA polymerase superfamily類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | ![](img/tx_virus.gif) Human immunodeficiency virus (ヒト免疫不全ウイルス) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 2.011 Å |
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データ登録者 | Kojima, E. / Iimuro, A. / Nakajima, M. / Kinuta, H. / Asada, N. / Sako, Y. / Nakata, Z. / Uemura, K. / Arita, S. / Miki, S. ...Kojima, E. / Iimuro, A. / Nakajima, M. / Kinuta, H. / Asada, N. / Sako, Y. / Nakata, Z. / Uemura, K. / Arita, S. / Miki, S. / Wakasa-Morimoto, C. / Tachibana, Y. / Fumoto, M. |
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資金援助 | 1件 |
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引用 | ジャーナル: J.Med.Chem. / 年: 2022 タイトル: Pocket-to-Lead: Structure-Based De Novo Design of Novel Non-peptidic HIV-1 Protease Inhibitors Using the Ligand Binding Pocket as a Template. 著者: Kojima, E. / Iimuro, A. / Nakajima, M. / Kinuta, H. / Asada, N. / Sako, Y. / Nakata, Z. / Uemura, K. / Arita, S. / Miki, S. / Wakasa-Morimoto, C. / Tachibana, Y. |
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履歴 | 登録 | 2021年12月20日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2022年11月2日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2023年11月29日 | Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model |
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