PDB-7w76: Crystal structure of the K. lactis Bre1 RBD in complex with Rad6,...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 7w76

タイトル

Crystal structure of the K. lactis Bre1 RBD in complex with Rad6, crystal form II

要素

E3 ubiquitin-protein ligase BRE1
Ubiquitin-conjugating enzyme E2 2

キーワード

GENE REGULATION / Complex / ubiquitin / ubiquitin ligase

機能・相同性

機能・相同性情報

: / E2 ubiquitin-conjugating enzyme / sporulation resulting in formation of a cellular spore / ubiquitin conjugating enzyme activity / RING-type E3 ubiquitin transferase / ubiquitin-protein transferase activity / chromatin organization / DNA repair / ATP binding / nucleus ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Kluyveromyces lactis NRRL Y-1140 (酵母)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 3.05 Å

データ登録者

Shi, M. / Zhao, J. / Xiang, S.

資金援助

中国, 2件

引用

ジャーナル: Elife / 年: 2023
タイトル: Structural basis for the Rad6 activation by the Bre1 N-terminal domain.
著者: Shi, M. / Zhao, J. / Zhang, S. / Huang, W. / Li, M. / Bai, X. / Zhang, W. / Zhang, K. / Chen, X. / Xiang, S.

履歴

登録	2021年12月3日	登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2023年3月29日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2023年4月5日	Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author / Item: _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title
改定 1.2	2023年11月29日	Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim Item: _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id ..._struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	7w76.cif.gz	401.3 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb7w76.ent.gz	331.5 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	7w76.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	7w76_validation.pdf.gz	489.6 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	7w76_full_validation.pdf.gz	498.7 KB	表示
XML形式データ	7w76_validation.xml.gz	32.9 KB	表示
CIF形式データ	7w76_validation.cif.gz	44.2 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/w7/7w76 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/w7/7w76	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	7w75C 1ayzS C: 同じ文献を引用 (文献) S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#60 - 2004年12月ユビキチン (Ubiquitin) 類似性 (8) #234 - 2019年6月 MDM2とがん (MDM2 and Cancer) 類似性 (8) #163 - 2013年7月 HIVカプシド (HIV Capsid) 類似性 (1) #56 - 2004年8月カスパーゼ (Caspases) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Ubiquitin-conjugating enzyme E2 2

B: Ubiquitin-conjugating enzyme E2 2

C: E3 ubiquitin-protein ligase BRE1

D: E3 ubiquitin-protein ligase BRE1

E: E3 ubiquitin-protein ligase BRE1

F: E3 ubiquitin-protein ligase BRE1

ヘテロ分子

132 kDa, 6 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Ubiquitin-conjugating enzyme E2 2

C: E3 ubiquitin-protein ligase BRE1

D: E3 ubiquitin-protein ligase BRE1

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: gel filtration
66.1 kDa, 3 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

B: Ubiquitin-conjugating enzyme E2 2

E: E3 ubiquitin-protein ligase BRE1

F: E3 ubiquitin-protein ligase BRE1

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
66 kDa, 3 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	113.221, 113.221, 386.165
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 120.000
Int Tables number	178
Space group name H-M	P6₁22

Components on special symmetry positions

ID	モデル	要素
1	1	D-301- SO4

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	(chain A and (resid 0 through 89 or resid 98 through 157 or resid 1000))
2	1	(chain B and resid 0 through 1000)
1	2	(chain C and (resid 17 through 121 or resid 133 through 170))
2	2	(chain D and (resid 17 through 121 or resid 133 through 170))
3	2	(chain E and resid 17 through 170)
4	2	(chain F and (resid 17 through 121 or resid 133 through 170))

NCSドメイン領域:

Dom-ID	Component-ID	Ens-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Selection details	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	1	HIS	HIS	LEU	LEU	(chain A and (resid 0 through 89 or resid 98 through 157 or resid 1000))	A	A	0 - 89	3 - 92
1	2	1	PRO	PRO	ALA	ALA	(chain A and (resid 0 through 89 or resid 98 through 157 or resid 1000))	A	A	98 - 157	101 - 160
1	3	1	GOL	GOL	GOL	GOL	(chain A and (resid 0 through 89 or resid 98 through 157 or resid 1000))	A	G	1000
2	1	1	HIS	HIS	GOL	GOL	(chain B and resid 0 through 1000)	B	B - H	0 - 1000	3
1	1	2	SER	SER	LYS	LYS	(chain C and (resid 17 through 121 or resid 133 through 170))	C	C	17 - 121	17 - 121
1	2	2	ARG	ARG	ASP	ASP	(chain C and (resid 17 through 121 or resid 133 through 170))	C	C	133 - 170	133 - 170
2	1	2	SER	SER	LYS	LYS	(chain D and (resid 17 through 121 or resid 133 through 170))	D	D	17 - 121	17 - 121
2	2	2	ARG	ARG	ASP	ASP	(chain D and (resid 17 through 121 or resid 133 through 170))	D	D	133 - 170	133 - 170
3	1	2	SER	SER	ASP	ASP	(chain E and resid 17 through 170)	E	E	17 - 170	17 - 170
4	1	2	SER	SER	LYS	LYS	(chain F and (resid 17 through 121 or resid 133 through 170))	F	F	17 - 121	17 - 121
4	2	2	ARG	ARG	ASP	ASP	(chain F and (resid 17 through 121 or resid 133 through 170))	F	F	133 - 170	133 - 170

NCSアンサンブル:

ID
1
2

#1: タンパク質	Ubiquitin-conjugating enzyme E2 2 / E2 ubiquitin-conjugating enzyme 2 / Ubiquitin carrier protein UBC2 / Ubiquitin-protein ligase UBC2 分子量: 19547.471 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Kluyveromyces lactis NRRL Y-1140 (酵母) 株: NRRL Y-1140 / 遺伝子: UBC2 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q6CUD9, E2 ubiquitin-conjugating enzyme
#2: タンパク質	E3 ubiquitin-protein ligase BRE1 / RING-type E3 ubiquitin transferase BRE1 分子量: 23162.822 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Kluyveromyces lactis NRRL Y-1140 (酵母) 株: NRRL Y-1140 / 遺伝子: BRE1 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q6CWM4, RING-type E3 ubiquitin transferase
#3: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#4: 化合物	ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン分子量: 96.063 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO₄
研究の焦点であるリガンドがあるか	N

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.74 Å³/Da / 溶媒含有率: 55.11 % 解説: THE ENTRY CONTAINS FRIEDEL PAIRS IN I/F_PLUS/MINUS COLUMNS.
結晶化	温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / 詳細: sodium acetrate trithydrate, ammonium sulfate

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

SSRF

/ ビームライン: BL19U1 / 波長: 0.97846 Å

検出器

タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2021年2月1日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.97846 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 3.05→50 Å / Num. obs: 58132 / % possible obs: 99.7 % / 冗長度: 10.3 % / R_merge(I) obs: 0.135 / R_pim(I) all: 0.027 / R_rim(I) all: 0.138 / Χ²: 1.039 / Net I/σ(I): 4.6

反射シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Num. unique obs	CC_1/2	R_pim(I) all	R_rim(I) all	Χ²	% possible all
3.05-3.1	8.35	1.16	2716	0.876	0.246	1.191	0.531	96.9
3.1-3.16	8.9	0.915	2834	0.935	0.19	0.937	0.545	98.3
3.16-3.22	9.9	0.809	2810	0.982	0.164	0.828	0.464	99.5
3.22-3.29	10.2	0.742	2794	0.978	0.15	0.759	0.455	100
3.29-3.36	10.3	0.576	2820	0.98	0.117	0.589	0.473	100
3.36-3.43	10.3	0.495	2884	0.979	0.102	0.507	0.502	100
3.43-3.52	10.35	0.47	2856	0.979	0.098	0.481	0.544	100
3.52-3.62	10.05	0.36	2818	0.994	0.076	0.369	0.555	100
3.62-3.72	9.5	0.311	2854	0.992	0.068	0.319	0.613	99.9
3.72-3.84	9.8	0.271	2862	0.992	0.058	0.278	0.636	100
3.84-3.98	10.1	0.207	2864	0.996	0.043	0.212	0.768	100
3.98-4.14	10.3	0.177	2892	0.996	0.035	0.181	0.779	100
4.14-4.33	10.2	0.155	2920	0.997	0.031	0.158	0.853	100
4.33-4.56	10.1	0.14	2812	0.997	0.028	0.143	0.952	100
4.56-4.84	9.55	0.116	2892	0.998	0.024	0.119	1.133	100
4.84-5.21	9.7	0.12	2942	0.997	0.025	0.123	1.118	99.9
5.21-5.74	10.65	0.122	2972	0.998	0.025	0.125	1.082	100
5.74-6.57	10.95	0.11	3010	0.997	0.022	0.113	1.199	100
6.57-8.27	11.75	0.084	3080	0.999	0.017	0.086	1.756	100
8.27-50	13.85	0.073	3396	0.999	0.014	0.074	3.686	100

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.20.1_4487	精密化
SCALEPACK		データスケーリング
PDB_EXTRACT	3.27	データ抽出
HKL-3000		データ削減
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 1ayz

1ayz

解像度: 3.05→32.18 Å / SU ML: 0.47 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.33 / 位相誤差: 34.43 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.286	2657	5.13 %
R_work	0.2372	49122	-
obs	0.2396	51779	98.24 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 297.64 Å² / B_iso mean: 122.3942 Å² / B_iso min: 40.19 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 3.05→32.18 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	7486	0	17	0	7503
B_iso mean	-	-	112.69	-	-
残基数	-	-	-	-	941

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Refine-ID	Rms	タイプ
1	1	A	1172	X-RAY DIFFRACTION	14.194	TORSIONAL
1	2	B	1172	X-RAY DIFFRACTION	14.194	TORSIONAL
2	1	C	2637	X-RAY DIFFRACTION	14.194	TORSIONAL
2	2	D	2637	X-RAY DIFFRACTION	14.194	TORSIONAL
2	3	E	2637	X-RAY DIFFRACTION	14.194	TORSIONAL
2	4	F	2637	X-RAY DIFFRACTION	14.194	TORSIONAL

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / R_factor R_free error: 0 / Total num. of bins used: 19

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
3.05-3.11	0.469	117	0.4029	2378	2495	91
3.11-3.17	0.4409	128	0.3622	2528	2656	96
3.17-3.23	0.4146	143	0.3513	2550	2693	97
3.23-3.3	0.4736	150	0.3306	2566	2716	98
3.3-3.38	0.3909	123	0.3101	2577	2700	98
3.38-3.46	0.3208	174	0.2906	2567	2741	98
3.46-3.55	0.3082	149	0.2856	2620	2769	99
3.55-3.66	0.2866	124	0.2712	2598	2722	99
3.66-3.78	0.3192	132	0.2518	2612	2744	99
3.78-3.91	0.284	164	0.2439	2564	2728	98
3.91-4.07	0.3297	143	0.2376	2613	2756	99
4.07-4.25	0.2674	156	0.2201	2576	2732	99
4.25-4.48	0.2886	150	0.2274	2620	2770	99
4.48-4.76	0.2047	134	0.204	2634	2768	100
4.76-5.12	0.2511	159	0.2281	2586	2745	100
5.12-5.63	0.3149	117	0.2562	2647	2764	99
5.63-6.44	0.2942	125	0.2766	2624	2749	99
6.45-8.09	0.3059	129	0.2293	2664	2793	100
8.1-32.18	0.2034	140	0.1591	2598	2738	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.1187	0.8829	0.0612	5.0241	-2.9463	2.3072	-0.7963	1.2563	-0.0981	-0.5366	-0.0691	-1.5271	-0.3308	-1.4285	-0.7727	0.4814	-0.1617	-0.1079	1.5227	0.0349	0.5101	-10.0372	-26.6111	-62.3632
2	0.5373	-0.2451	-0.2069	0.4083	0.4801	0.5063	0.1599	0.4861	0.2732	-0.3211	-0.4324	-0.0608	0.0077	-1.339	0.0002	0.6978	0.1379	-0.15	1.0283	-0.1192	0.6919	-4.2262	-22.372	-53.6128
3	2.296	-0.3795	-1.9105	1.6271	0.9981	1.8905	0.3202	-0.0162	0.1132	-0.1595	-0.3161	-0.1343	-0.6474	-0.5539	0.14	0.4886	-0.0749	-0.0839	0.4622	-0.0219	0.5421	5.6185	-22.78	-53.1518
4	1.5508	0.6365	1.7643	0.5494	1.3498	3.6835	-0.7396	0.518	0.13	-0.9584	0.6718	0.1362	-1.2539	0.6812	-0.0307	0.3904	0.0261	-0.0975	0.5195	-0.0943	0.6269	10.5564	-27.0387	-59.085
5	0.8991	0.8157	0.5313	0.7621	-0.0383	1.0024	0.6586	-0.3671	-0.1883	0.7787	-0.2895	-0.185	0.1352	0.1036	0.03	0.5895	-0.0201	-0.1289	0.4042	-0.0159	0.6373	15.4296	-25.2312	-45.275
6	0.0402	-0.0613	0.0527	0.0554	-0.0599	0.0506	-0.3728	-0.1917	-0.6036	0.3294	0.9488	0.2115	-0.6601	0.0309	-0.0012	1.225	0.0737	0.0647	1.0655	-0.0495	0.9581	-5.3704	-15.5463	-44.998
7	0.6752	0.9	0.5777	3.298	-0.0433	0.7086	-1.3242	0.7319	-0.9707	0.4141	0.8843	0.5938	-0.9026	-0.7614	-0.4407	1.734	0.3669	0.6797	1.5999	0.1762	1.1765	-38.4306	-38.2656	21.1505
8	3.4311	0.8451	1.1335	3.5707	-0.2598	0.4189	1.0058	-0.5046	-0.1842	1.3744	0.0376	0.3964	-1.2745	-1.034	1.4935	1.8567	0.501	0.611	1.2889	0.26	0.9579	-29.8333	-45.0381	11.6127
9	0.6347	1.4839	0.3975	3.8617	1.6205	0.7526	0.4994	-0.1406	-0.4317	2.1188	0.7881	-1.0907	0.5668	0.7427	2.8521	1.8137	0.4795	0.332	0.2377	0.2509	0.6327	-21.2976	-46.9576	11.3298
10	1.6382	1.2155	-0.524	2.5169	-0.7718	5.5952	0.7466	0.3005	0.2469	0.8633	-0.0397	0.1303	-0.3679	-1.1812	1.6178	1.2804	-0.0162	0.2103	0.5537	0.0914	0.9182	-17.75	-51.3584	1.3141
11	0.198	-0.3205	0.2663	0.459	-0.4003	0.3188	-0.46	0.6345	0.3309	-0.6575	-1.2715	0.1719	1.7518	0.1393	-0.0268	1.1935	-0.2848	0.0057	1.1848	-0.1628	0.8592	-11.269	-27.9306	-40.2388
12	8.2612	0.0075	6.5919	-0.0188	0.8367	4.6657	0.783	-2.2508	-0.2268	0.0274	-0.1996	-0.1749	0.7023	-1.9983	0.2985	0.7279	-0.1444	-0.0131	0.692	-0.1627	0.6844	24.278	-19.5067	-17.1551
13	0.3233	-0.2473	0.4128	0.5285	0.3611	0.6641	-0.1455	0.7425	0.3631	-0.8413	-0.0842	-0.5557	-0.3074	-0.0328	-0.0007	0.9681	0.0145	0.1709	0.6988	-0.1924	1.1908	59.8377	-14.2089	-10.2195
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15	0.5537	1.053	0.7915	3.8668	1.4339	1.1877	0.5056	-0.1865	0.3936	2.7125	-0.6935	-0.0076	0.6744	-0.3862	-0.0259	1.0326	-0.0774	0.266	1.3066	-0.2787	0.8379	-2.4255	-17.713	-23.096
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17	0.1083	0.0985	-0.0358	0.0783	-0.0038	-0.0036	0.7182	0.3065	-0.0419	0.7011	-0.7773	0.4654	0.8767	-2.3951	0.0002	0.9243	-0.1593	-0.0811	0.8347	-0.2616	0.8887	43.8189	-27.9578	-1.6202
18	1.7557	-1.5726	-1.7437	1.8166	1.0195	2.2179	0.6076	-0.3161	-0.6891	1.037	0.1701	-1.5166	1.4309	1.3108	0.2655	1.1212	0.2091	-0.4682	0.233	-0.2598	1.6417	61.0671	-28.8195	-0.0404
19	3.2908	-0.1253	0.1026	0.1259	-0.1941	-0.3049	-0.6202	1.0762	-0.9606	0.0344	0.353	-0.0856	1.2872	-0.5643	-0.4394	1.544	-0.2408	0.0354	1.0305	-0.1579	0.8932	29.4483	-35.2268	-22.3687
20	0.2632	-0.0126	-0.0453	0.248	-0.1045	0.0259	-0.495	-0.3052	0.193	0.5982	0.8356	0.2224	0.676	-0.6514	0.0006	1.4159	-0.6151	0.0277	1.448	-0.0473	0.7645	-3.3361	-32.1317	-35.0997
21	1.0063	0.4717	1.527	1.5494	-0.0977	2.8805	0.0204	0.5909	-0.2875	0.1991	-1.1595	0.2207	-0.8034	-0.5116	-1.8227	1.9795	0.7166	1.3384	2.2003	0.2669	1.2377	-38.8458	-36.7693	1.1178
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23	0.0637	-0.037	0.1573	0.0571	-0.0356	0.5553	-0.1632	1.1929	0.2284	0.2236	0.4686	-0.9747	0.1402	-0.3648	-0.0052	1.5483	-0.0154	-0.2866	1.3681	0.4686	2.5533	28.0851	-68.6602	-53.8876
24	1.5089	-0.692	0.9457	0.4525	-0.2318	0.8272	1.0065	-1.2786	-2.1388	1.3833	-0.4926	-0.7115	1.014	-0.2758	0.0765	1.2835	0.3497	0.0154	1.0223	0.233	1.5414	14.6041	-68.0899	-45.848
25	2.1467	3.1214	-1.5488	4.5838	-2.0668	1.5324	-0.5231	-0.1823	-0.7699	0.6077	-0.3773	-3.033	0.1834	-0.395	-0.4443	0.9766	0.2582	-0.6839	1.3387	-0.1225	1.7095	23.6883	-59.7364	-45.321
26	0.5241	-0.6713	0.1698	0.2323	0.2015	0.9899	0.5207	-0.4861	0.1521	0.4663	0.3307	-0.2484	0.2578	0.0035	0.1217	1.2093	-0.0614	0.0397	1.3481	0.0529	0.9066	-2.9735	-43.0541	-31.7035
27	0.0577	0.0606	-0.0131	0.069	-0.017	0.0067	-0.317	0.2019	-0.237	0.0573	-0.2755	-0.0224	-0.2287	-0.2186	-0.0094	2.5701	-0.3078	0.0498	2.6418	0.2753	2.0114	-31.9501	-47.1424	-22.8537
28	0.0189	-0.0305	0.0112	0.0302	0.0141	0.073	-0.4638	-0.5083	-0.7894	-0.4831	-0.3951	-0.9807	-0.3067	0.2454	-0.0025	1.8794	0.1068	-0.1853	2.86	0.5214	1.5423	-36.5779	-45.661	-16.6827
29	1.1081	1.0662	-0.1752	-1.0185	-0.3865	0.9106	0.6368	-0.8245	0.6639	0.6521	0.0219	-0.0032	-0.3567	0.4157	0.0385	0.9316	-0.0462	0.2743	0.9368	-0.0561	0.8863	1.3659	-51.3414	-37.123
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31	0.3107	-0.1251	-0.0842	0.2918	-0.0634	0.0561	-0.5234	-0.3431	0.5169	-0.6425	-1.2637	-1.3377	0.2878	0.0435	-0.0683	1.2404	-0.0811	-0.161	1.2935	-0.1361	1.217	28.0593	-47.4911	-49.1428
32	1.0709	-0.3453	0.3077	0.4857	0.2342	1.3683	-0.0991	0.3649	0.1193	0.641	0.3547	-0.0313	-0.6564	0.1408	1.2053	1.1203	-0.1484	0.0429	1.1191	0.1323	0.8272	-1.1317	-40.7831	-22.7657
33	0.047	-0.02	0.0213	0.0621	0.021	0.0059	-0.0484	1.7006	0.6757	0.4606	-1.072	0.0104	-0.3587	-0.0411	-0.0028	1.7508	0.1893	0.028	2.2196	0.2811	1.3594	-30.8429	-34.4376	-6.7296

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 0 through 18 )	A	0 - 18
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 19 through 41 )	A	19 - 41
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 42 through 77 )	A	42 - 77
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 78 through 101 )	A	78 - 101
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 102 through 150 )	A	102 - 150
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 151 through 158 )	A	151 - 158
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resid -1 through 18 )	B	-1 - 18
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 19 through 68 )	B	19 - 68
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 69 through 114 )	B	69 - 114
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 115 through 157 )	B	115 - 157
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'C' and (resid 12 through 21 )	C	12 - 21
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'C' and (resid 22 through 80 )	C	22 - 80
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'C' and (resid 81 through 128 )	C	81 - 128
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'C' and (resid 129 through 173 )	C	129 - 173
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'D' and (resid 16 through 29 )	D	16 - 29
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'D' and (resid 30 through 97 )	D	30 - 97
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'D' and (resid 98 through 110 )	D	98 - 110
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'D' and (resid 111 through 131 )	D	111 - 131
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'D' and (resid 132 through 172 )	D	132 - 172
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'D' and (resid 173 through 183 )	D	173 - 183
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'E' and (resid 14 through 22 )	E	14 - 22
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'E' and (resid 23 through 80 )	E	23 - 80
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'E' and (resid 81 through 85 )	E	81 - 85
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'E' and (resid 86 through 110 )	E	86 - 110
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'E' and (resid 111 through 133 )	E	111 - 133
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'E' and (resid 134 through 170 )	E	134 - 170
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'F' and (resid 17 through 21 )	F	17 - 21
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'F' and (resid 22 through 29 )	F	22 - 29
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'F' and (resid 30 through 97 )	F	30 - 97
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'F' and (resid 98 through 121 )	F	98 - 121
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'F' and (resid 122 through 133 )	F	122 - 133
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'F' and (resid 134 through 172 )	F	134 - 172
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'F' and (resid 173 through 182 )	F	173 - 182

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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