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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7v2w | ||||||
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タイトル | protomer structure from the dimer of yeast THO complex | ||||||
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![]() | TRANSCRIPTION / RNA transcription | ||||||
機能・相同性 | ![]() nucleoplasmic THO complex / THO complex part of transcription export complex / positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase I / transcription export complex / Cdc73/Paf1 complex / mRNA 3'-end processing / positive regulation of transcription by RNA polymerase I / transcription-coupled nucleotide-excision repair / mRNA export from nucleus / stress granule assembly ...nucleoplasmic THO complex / THO complex part of transcription export complex / positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase I / transcription export complex / Cdc73/Paf1 complex / mRNA 3'-end processing / positive regulation of transcription by RNA polymerase I / transcription-coupled nucleotide-excision repair / mRNA export from nucleus / stress granule assembly / transcription elongation by RNA polymerase II / mRNA processing / DNA recombination / nucleic acid binding / chromosome, telomeric region / molecular adaptor activity / mRNA binding / nucleus 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.2 Å | ||||||
![]() | Chen, C. / Tan, M. / Wu, Z. / Wu, J. / Lei, M. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structural and functional insights into R-loop prevention and mRNA export by budding yeast THO-Sub2 complex. 著者: Cong Chen / Ming Tan / Zhenfang Wu / Yuebin Zhang / Fanyang He / Yanjia Lu / Shaobai Li / Mi Cao / Guohui Li / Jian Wu / Hong Cheng / Ming Lei / ![]() | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 497.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 394.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 871.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 883.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 66.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 104.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 87938.547 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 株: S288c / 遺伝子: HPR1 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: P17629 |
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#2: タンパク質 | 分子量: 184163.734 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 株: S288c / 遺伝子: THO2 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: P53552 |
#3: タンパク質 | 分子量: 47229.652 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 株: S288c / 遺伝子: TEX1 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: P53851 |
#4: タンパク質 | 分子量: 45055.012 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 株: S288c / 遺伝子: MFT1 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: P33441 |
#5: タンパク質 | 分子量: 30340.264 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 株: S288c / 遺伝子: THP2 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: O13539 |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
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試料調製
構成要素 | 名称: THO Complex / タイプ: COMPLEX / Entity ID: all / 由来: RECOMBINANT |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
由来(組換発現) | 生物種: ![]() ![]() |
緩衝液 | pH: 7.5 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD |
撮影 | 電子線照射量: 50 e/Å2 / フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) |
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解析
CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION |
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3次元再構成 | 解像度: 3.2 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 393530 / 対称性のタイプ: POINT |