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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7sbe | ||||||
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タイトル | Structure of the K. lactis telomerase RNA binding domain | ||||||
![]() | Telomerase reverse transcriptase | ||||||
![]() | RNA BINDING PROTEIN / Telomerase | ||||||
機能・相同性 | ![]() telomerase catalytic core complex / : / telomeric DNA binding / telomere maintenance via telomerase / RNA-directed DNA polymerase / chromosome, telomeric region / nucleolus / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Skordalakes, E. / Tzfati, Y. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structure of the K. lactis telomerase RNA binding domain 著者: Skordalakes, E. / Tzfati, Y. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 106.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 80.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 436.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 448.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 18.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 23.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 2r4gS S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 27902.664 Da / 分子数: 2 / 断片: RNA binding domain / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.59 Å3/Da / 溶媒含有率: 52.49 % |
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結晶化 | 温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / 詳細: 14% PEG3350 and 200 mM Na.citrate |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2013年11月10日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.1 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.65→20 Å / Num. obs: 15880 / % possible obs: 99.3 % / 冗長度: 5.4 % / CC1/2: 0.99 / Net I/σ(I): 5.4 |
反射 シェル | 解像度: 2.65→2.72 Å / Num. unique obs: 1177 / CC1/2: 0.58 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: 2R4G 解像度: 2.65→19.71 Å / SU ML: 0.47 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 38.12 / 立体化学のターゲット値: ML
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso max: 183.96 Å2 / Biso mean: 91.4427 Å2 / Biso min: 41 Å2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: final / 解像度: 2.65→19.71 Å
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LS精密化 シェル | Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Rfactor Rfree error: 0 / Total num. of bins used: 6
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