+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 7qyr | ||||||||||||
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Title | Crystal structure of RimK from Pseudomonas aeruginosa PAO1 | ||||||||||||
Components |
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Keywords | LIGASE / ATP-grasp fold / glutamate ligase / ribosomal modification | ||||||||||||
Function / homology | Function and homology information C-terminal protein amino acid modification / ribosomal S6-glutamic acid ligase activity / ligase activity, forming carbon-nitrogen bonds / Ligases; Forming carbon-nitrogen bonds; Acid-amino-acid ligases (peptide synthases) / SOS response / translation / ATP binding / metal ion binding / cytoplasm Similarity search - Function | ||||||||||||
Biological species | Pseudomonas aeruginosa PAO1 (bacteria) synthetic construct (others) | ||||||||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.4 Å | ||||||||||||
Authors | Thompson, C.M.A. / Little, R.H. / Stevenson, C.E.M. / Lawson, D.M. / Malone, J.G. | ||||||||||||
Funding support | United Kingdom, 3items
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Citation | Journal: Proteins / Year: 2023 Title: Structural insights into the mechanism of adaptive ribosomal modification by Pseudomonas RimK. Authors: Thompson, C.M.A. / Little, R.H. / Stevenson, C.E.M. / Lawson, D.M. / Malone, J.G. | ||||||||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 7qyr.cif.gz | 882.2 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb7qyr.ent.gz | 739.6 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 7qyr.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/qy/7qyr ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/qy/7qyr | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Related structure data | 7qysC 4iwxS S: Starting model for refinement C: citing same article (ref.) |
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Similar structure data | Similarity search - Function & homologyF&H Search |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: _ / Beg auth comp-ID: MET / Beg label comp-ID: MET / Refine code: _
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