+データを開く
-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7qpg | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | Human RZZ kinetochore corona complex. | ||||||
要素 |
| ||||||
キーワード | CELL CYCLE / Kinetochore / centromere / chromosome segregation / mitosis | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 protein localization to kinetochore involved in kinetochore assembly / RZZ complex / Dsl1/NZR complex / kinetochore microtubule / centromeric DNA binding / regulation of attachment of spindle microtubules to kinetochore / regulation of exit from mitosis / protein localization to kinetochore / COPI-dependent Golgi-to-ER retrograde traffic / mitotic metaphase chromosome alignment ...protein localization to kinetochore involved in kinetochore assembly / RZZ complex / Dsl1/NZR complex / kinetochore microtubule / centromeric DNA binding / regulation of attachment of spindle microtubules to kinetochore / regulation of exit from mitosis / protein localization to kinetochore / COPI-dependent Golgi-to-ER retrograde traffic / mitotic metaphase chromosome alignment / mitotic spindle assembly checkpoint signaling / Golgi organization / establishment of mitotic spindle orientation / mitotic sister chromatid segregation / Amplification of signal from unattached kinetochores via a MAD2 inhibitory signal / endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport / Mitotic Prometaphase / EML4 and NUDC in mitotic spindle formation / Resolution of Sister Chromatid Cohesion / bioluminescence / lipid droplet / meiotic cell cycle / generation of precursor metabolites and energy / RHO GTPases Activate Formins / kinetochore / small GTPase binding / spindle pole / Separation of Sister Chromatids / protein transport / actin cytoskeleton / protein-containing complex assembly / cell division / endoplasmic reticulum membrane / endoplasmic reticulum / membrane / nucleus / plasma membrane / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.9 Å | ||||||
データ登録者 | Raisch, T. / Ciossani, G. / d'Amico, E. / Cmetowski, V. / Carmignani, S. / Maffini, S. / Merino, F. / Wohlgemuth, S. / Vetter, I.R. / Raunser, S. / Musacchio, A. | ||||||
資金援助 | ドイツ, 1件
| ||||||
引用 | ジャーナル: EMBO J / 年: 2022 タイトル: Structure of the RZZ complex and molecular basis of Spindly-driven corona assembly at human kinetochores. 著者: Tobias Raisch / Giuseppe Ciossani / Ennio d'Amico / Verena Cmentowski / Sara Carmignani / Stefano Maffini / Felipe Merino / Sabine Wohlgemuth / Ingrid R Vetter / Stefan Raunser / Andrea Musacchio / 要旨: In metazoans, a ≈1 megadalton (MDa) multiprotein complex comprising the dynein-dynactin adaptor Spindly and the ROD-Zwilch-ZW10 (RZZ) complex is the building block of a fibrous biopolymer, the ...In metazoans, a ≈1 megadalton (MDa) multiprotein complex comprising the dynein-dynactin adaptor Spindly and the ROD-Zwilch-ZW10 (RZZ) complex is the building block of a fibrous biopolymer, the kinetochore fibrous corona. The corona assembles on mitotic kinetochores to promote microtubule capture and spindle assembly checkpoint (SAC) signaling. We report here a high-resolution cryo-EM structure that captures the essential features of the RZZ complex, including a farnesyl-binding site required for Spindly binding. Using a highly predictive in vitro assay, we demonstrate that the SAC kinase MPS1 is necessary and sufficient for corona assembly at supercritical concentrations of the RZZ-Spindly (RZZS) complex, and describe the molecular mechanism of phosphorylation-dependent filament nucleation. We identify several structural requirements for RZZS polymerization in rings and sheets. Finally, we identify determinants of kinetochore localization and corona assembly of Spindly. Our results describe a framework for the long-sought-for molecular basis of corona assembly on metazoan kinetochores. | ||||||
履歴 |
|
-構造の表示
ムービー |
ムービービューア |
---|---|
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 7qpg.cif.gz | 1.2 MB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | pdb7qpg.ent.gz | 1021.9 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 7qpg.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 7qpg_validation.pdf.gz | 782.7 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | 7qpg_full_validation.pdf.gz | 841.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | 7qpg_validation.xml.gz | 173.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 7qpg_validation.cif.gz | 264.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/qp/7qpg ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/qp/7qpg | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
|
---|---|
1 |
|
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 67293.805 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: ZWILCH / 発現宿主: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ) / 参照: UniProt: Q9H900 #2: タンパク質 | 分子量: 279805.562 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: DS885_16260, KNTC1, KIAA0166 / 発現宿主: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ) / 参照: UniProt: A0A366VY15, UniProt: P50748 #3: タンパク質 | 分子量: 88940.336 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: ZW10 / 発現宿主: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ) / 参照: UniProt: O43264 |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
---|---|
EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
-試料調製
構成要素 | 名称: RZZ complex / タイプ: COMPLEX / Entity ID: all / 由来: RECOMBINANT |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
由来(組換発現) | 生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ) |
緩衝液 | pH: 8 |
試料 | 濃度: 5 mg/ml / 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-電子顕微鏡撮影
実験機器 | モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
---|---|
顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: FIELD EMISSION GUN / 加速電圧: 300 kV / 照射モード: OTHER |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2700 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 1200 nm |
撮影 | 電子線照射量: 60 e/Å2 フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) |
-解析
CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION |
---|---|
3次元再構成 | 解像度: 3.9 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 191979 / 対称性のタイプ: POINT |