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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7n20 | |||||||||
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タイトル | NMR structure of native AnIB | |||||||||
要素 | Alpha-conotoxin AnIB | |||||||||
キーワード | TOXIN (毒素) / alpha-conotoxin / CC-C-C framework / alpha4/7 pattern / sulfotyrosine | |||||||||
機能・相同性 | Conotoxin, alpha-type, conserved site / Alpha-conotoxin family signature. / host cell postsynaptic membrane / acetylcholine receptor inhibitor activity / ion channel regulator activity / toxin activity / extracellular region / Alpha-conotoxin AnIB 機能・相同性情報 | |||||||||
生物種 | Conus anemone (アネモネイモ) | |||||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing / na | |||||||||
Model details | AnIB, tyrosine sulfated, C-terminal amide | |||||||||
データ登録者 | Conibear, A.C. / Rosengren, K.J. / Lee, H.S. | |||||||||
資金援助 | オーストラリア, 2件
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引用 | ジャーナル: Rsc Med Chem / 年: 2021 タイトル: Posttranslational modifications of alpha-conotoxins: sulfotyrosine and C-terminal amidation stabilise structures and increase acetylcholine receptor binding. 著者: Ho, T.N.T. / Lee, H.S. / Swaminathan, S. / Goodwin, L. / Rai, N. / Ushay, B. / Lewis, R.J. / Rosengren, K.J. / Conibear, A.C. | |||||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 7n20.cif.gz | 77.5 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb7n20.ent.gz | 51.4 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 7n20.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/n2/7n20 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/n2/7n20 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | 7n0tC 7n1zC 7n21C 7n22C 7n23C 7n24C 7n25C 7n26C C: 同じ文献を引用 (文献) |
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類似構造データ | |
その他のデータベース |
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-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 1792.930 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: solid phase peptide synthesis / 由来: (合成) Conus anemone (アネモネイモ) / 参照: UniProt: P0C1V7 |
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研究の焦点であるリガンドがあるか | Y |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 | タイプ: solution 内容: 1.0 mg/mL Alpha-conotoxin AnIB, 10 uM DSS, 90% H2O/10% D2O 詳細: 90% H2O, 10% D2O, 10 uM 2,2-dimethyl-2-silapentane-5-sulfonate sodium salt (DSS), pH 3.0 Label: CX0016 / 溶媒系: 90% H2O/10% D2O | ||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | 詳細: 90% H2O, 10% D2O, 10 M 2,2-dimethyl-2-silapentane-5-sulfonate sodium salt (DSS), pH 3.0 イオン強度: 5 mM / Label: aqueous / pH: 3.0 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 700 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 |
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代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |