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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7lgl | ||||||
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タイトル | Structural characterization of two b-KTx scorpion toxins. One of them blocks human KCNQ1 potassium channels | ||||||
要素 | Potassium channel toxin TcoKIK | ||||||
キーワード | TOXIN / B-KTx / NMR solution structure / scorpion toxins / cysteine-stabilized ab motif / TcoKIK / Beta-KTx14.3 / KCNQ1 / Kv7.1. | ||||||
機能・相同性 | Long chain scorpion toxin family / Potassium channel toxin / BetaSPN-type cysteine-stabilized alpha/beta (CS-alpha/beta) domain profile. / toxin activity / extracellular region / Potassium channel toxin TcoKIK 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Tityus costatus (サソリ) | ||||||
手法 | 溶液NMR / molecular dynamics | ||||||
データ登録者 | del Rio-Portilla, F. / Lopez-Giraldo, A.E. | ||||||
引用 | ジャーナル: To Be Published タイトル: b-KTx scorpion toxin blocks human KCNQ1 potassium channels 著者: del Rio-Portilla, F. / Lopez-Giraldo, A.E. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 7lgl.cif.gz | 283.6 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb7lgl.ent.gz | 239.3 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 7lgl.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/lg/7lgl ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/lg/7lgl | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 5294.156 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Tityus costatus (サソリ) / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / Variant (発現宿主): Rosetta / 参照: UniProt: Q0GY42 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 | タイプ: solution / 内容: 1.2 mM TcoKIK, 95% H2O/5% D2O / Label: 1H_sample / 溶媒系: 95% H2O/5% D2O |
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試料 | 濃度: 1.2 mM / 構成要素: TcoKIK / Isotopic labeling: natural abundance |
試料状態 | イオン強度: 0 Not defined / Label: 1 / pH: 6.8 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE II / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE II / 磁場強度: 700 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: molecular dynamics / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |