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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7fbj | ||||||
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タイトル | Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing nanobody 17F6 | ||||||
要素 |
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キーワード | VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM (ウイルス性) / SARS-CoV-2 (SARSコロナウイルス2) / Spike glycoprotein (スパイクタンパク質) / RBD / VNAR (ナノボディ) / VIRAL PROTEIN (ウイルスタンパク質) / VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex (ウイルス性) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 Maturation of spike protein / viral translation / Translation of Structural Proteins / Virion Assembly and Release / host cell surface / host extracellular space / suppression by virus of host tetherin activity / Induction of Cell-Cell Fusion / structural constituent of virion / entry receptor-mediated virion attachment to host cell ...Maturation of spike protein / viral translation / Translation of Structural Proteins / Virion Assembly and Release / host cell surface / host extracellular space / suppression by virus of host tetherin activity / Induction of Cell-Cell Fusion / structural constituent of virion / entry receptor-mediated virion attachment to host cell / host cell endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane / receptor-mediated endocytosis of virus by host cell / Attachment and Entry / membrane fusion / positive regulation of viral entry into host cell / receptor-mediated virion attachment to host cell / receptor ligand activity / host cell surface receptor binding / fusion of virus membrane with host plasma membrane / fusion of virus membrane with host endosome membrane / エンベロープ (ウイルス) / symbiont-mediated suppression of host type I interferon-mediated signaling pathway / virion attachment to host cell / SARS-CoV-2 activates/modulates innate and adaptive immune responses / host cell plasma membrane / virion membrane / 生体膜 / identical protein binding / 細胞膜 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARSコロナウイルス2) Chiloscyllium plagiosum (シロボシテンジク) | ||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.85 Å | ||||||
データ登録者 | Zhu, J. / Xu, T. / Feng, B. / Liu, J. | ||||||
資金援助 | 1件
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引用 | ジャーナル: Small Methods / 年: 2022 タイトル: A Class of Shark-Derived Single-Domain Antibodies can Broadly Neutralize SARS-Related Coronaviruses and the Structural Basis of Neutralization and Omicron Escape. 著者: Feng, B. / Chen, Z. / Sun, J. / Xu, T. / Wang, Q. / Yi, H. / Niu, X. / Zhu, J. / Fan, M. / Hou, R. / Shao, Y. / Huang, S. / Li, C. / Hu, P. / Zheng, P. / He, P. / Luo, J. / Yan, Q. / Xiong, X. ...著者: Feng, B. / Chen, Z. / Sun, J. / Xu, T. / Wang, Q. / Yi, H. / Niu, X. / Zhu, J. / Fan, M. / Hou, R. / Shao, Y. / Huang, S. / Li, C. / Hu, P. / Zheng, P. / He, P. / Luo, J. / Yan, Q. / Xiong, X. / Liu, J. / Zhao, J. / Chen, L. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 7fbj.cif.gz | 977.7 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb7fbj.ent.gz | 821.3 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 7fbj.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/fb/7fbj ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/fb/7fbj | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | 7fbkC 2i26S 7eamS S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献) |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索 |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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