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- PDB-7fbj: Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in comple... -
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Open data
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Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 7fbj | ||||||
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Title | Crystal structure of SARS-CoV-2 receptor binding domain in complex with neutralizing nanobody 17F6 | ||||||
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![]() | VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM / SARS-CoV-2 / Spike glycoprotein / RBD / VNAR / VIRAL PROTEIN / VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex | ||||||
Function / homology | ![]() Maturation of spike protein / viral translation / Translation of Structural Proteins / Virion Assembly and Release / host cell surface / host extracellular space / suppression by virus of host tetherin activity / Induction of Cell-Cell Fusion / structural constituent of virion / host cell endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane ...Maturation of spike protein / viral translation / Translation of Structural Proteins / Virion Assembly and Release / host cell surface / host extracellular space / suppression by virus of host tetherin activity / Induction of Cell-Cell Fusion / structural constituent of virion / host cell endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane / entry receptor-mediated virion attachment to host cell / receptor-mediated endocytosis of virus by host cell / Attachment and Entry / membrane fusion / positive regulation of viral entry into host cell / receptor-mediated virion attachment to host cell / receptor ligand activity / host cell surface receptor binding / fusion of virus membrane with host plasma membrane / fusion of virus membrane with host endosome membrane / viral envelope / virion attachment to host cell / SARS-CoV-2 activates/modulates innate and adaptive immune responses / host cell plasma membrane / virion membrane / identical protein binding / membrane / plasma membrane Similarity search - Function | ||||||
Biological species | ![]() ![]() ![]() | ||||||
Method | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Zhu, J. / Xu, T. / Feng, B. / Liu, J. | ||||||
Funding support | 1items
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![]() | ![]() Title: A Class of Shark-Derived Single-Domain Antibodies can Broadly Neutralize SARS-Related Coronaviruses and the Structural Basis of Neutralization and Omicron Escape. Authors: Feng, B. / Chen, Z. / Sun, J. / Xu, T. / Wang, Q. / Yi, H. / Niu, X. / Zhu, J. / Fan, M. / Hou, R. / Shao, Y. / Huang, S. / Li, C. / Hu, P. / Zheng, P. / He, P. / Luo, J. / Yan, Q. / Xiong, ...Authors: Feng, B. / Chen, Z. / Sun, J. / Xu, T. / Wang, Q. / Yi, H. / Niu, X. / Zhu, J. / Fan, M. / Hou, R. / Shao, Y. / Huang, S. / Li, C. / Hu, P. / Zheng, P. / He, P. / Luo, J. / Yan, Q. / Xiong, X. / Liu, J. / Zhao, J. / Chen, L. | ||||||
History |
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Structure visualization
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PDB format | ![]() | 821.3 KB | Display | ![]() |
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Others | ![]() |
-Validation report
Summary document | ![]() | 2 MB | Display | ![]() |
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Full document | ![]() | 2 MB | Display | |
Data in XML | ![]() | 85.6 KB | Display | |
Data in CIF | ![]() | 116.5 KB | Display | |
Arichive directory | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | ![]() 7fbkC ![]() 2i26S ![]() 7eamS S: Starting model for refinement C: citing same article ( |
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Similar structure data | Similarity search - Function & homology ![]() |
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Links
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Assembly
Deposited unit | ![]()
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
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