PDB-7esx: Crystal structure of Wolbachia cytoplasmic incompatibility factor...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 7esx

タイトル

Crystal structure of Wolbachia cytoplasmic incompatibility factor CidA from wPip

要素

Bacteria factor 1

キーワード

ANTITOXIN / Wolbachia / cytoplasmic incompatibility

機能・相同性

CidA_IV beta/2 protein

機能・相同性情報

生物種

Wolbachia pipientis subsp. Culex pipiens

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

単波長異常分散 / 解像度: 1.8 Å

データ登録者

Xiao, Y.J. / Wang, W. / Chen, X. / Ji, X.Y. / Yang, H.T.

資金援助

中国, 1件

引用

ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2021
タイトル: Structural and mechanistic insights into the complexes formed by Wolbachia cytoplasmic incompatibility factors.
著者: Xiao, Y. / Chen, H. / Wang, H. / Zhang, M. / Chen, X. / Berk, J.M. / Zhang, L. / Wei, Y. / Li, W. / Cui, W. / Wang, F. / Wang, Q. / Cui, C. / Li, T. / Chen, C. / Ye, S. / Zhang, L. / Ji, X. / ...

履歴

登録	2021年5月12日	登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2021年11月10日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2024年5月29日	Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / struct_ncs_dom_lim Item: _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id ..._struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	7esx.cif.gz	375 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb7esx.ent.gz	306.5 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	7esx.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/es/7esx ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/es/7esx	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	7esyC 7eszC 7et0C C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	7esx-2 4zse-2 4bzy-3 5mb9-1 4k34-3 1pg0-d 7me7-d 6sqc-d 5cow-2 1pg2-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: Bacteria factor 1

B: Bacteria factor 1

115 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Bacteria factor 1

登録者が定義した集合体
根拠: gel filtration
57.5 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

B: Bacteria factor 1

登録者が定義した集合体
57.5 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	56.671, 63.376, 66.716
Angle α, β, γ (deg.)	82.590, 70.210, 89.370
Int Tables number	1
Space group name H-M	P1

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	(CHAIN A AND (RESID 2 THROUGH 122 OR (RESID 123...
2	1	(CHAIN B AND (RESID 2 THROUGH 276 OR (RESID 277...

NCSドメイン領域:

Ens-ID: 1

Dom-ID	Component-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Selection details	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	PRO	PRO	PRO	PRO	(CHAIN A AND (RESID 2 THROUGH 122 OR (RESID 123...	A	A	2	2
1	2	ARG	ARG	ARG	ARG	(CHAIN A AND (RESID 2 THROUGH 122 OR (RESID 123...	A	A	123	123
1	3	PRO	PRO	LYS	LYS	(CHAIN A AND (RESID 2 THROUGH 122 OR (RESID 123...	A	A	2 - 428	2 - 428
1	4	PRO	PRO	LYS	LYS	(CHAIN A AND (RESID 2 THROUGH 122 OR (RESID 123...	A	A	2 - 428	2 - 428
1	5	PRO	PRO	LYS	LYS	(CHAIN A AND (RESID 2 THROUGH 122 OR (RESID 123...	A	A	2 - 428	2 - 428
1	6	PRO	PRO	LYS	LYS	(CHAIN A AND (RESID 2 THROUGH 122 OR (RESID 123...	A	A	2 - 428	2 - 428
2	1	PRO	PRO	PRO	PRO	(CHAIN B AND (RESID 2 THROUGH 276 OR (RESID 277...	B	B	2	2
2	2	GLU	GLU	GLU	GLU	(CHAIN B AND (RESID 2 THROUGH 276 OR (RESID 277...	B	B	277	277
2	3	PRO	PRO	LEU	LEU	(CHAIN B AND (RESID 2 THROUGH 276 OR (RESID 277...	B	B	2 - 431	2 - 431
2	4	PRO	PRO	LEU	LEU	(CHAIN B AND (RESID 2 THROUGH 276 OR (RESID 277...	B	B	2 - 431	2 - 431
2	5	PRO	PRO	LEU	LEU	(CHAIN B AND (RESID 2 THROUGH 276 OR (RESID 277...	B	B	2 - 431	2 - 431
2	6	PRO	PRO	LEU	LEU	(CHAIN B AND (RESID 2 THROUGH 276 OR (RESID 277...	B	B	2 - 431	2 - 431

#1: タンパク質	Bacteria factor 1 分子量: 57482.438 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Wolbachia pipientis subsp. Culex pipiens (strain wPip) (バクテリア) 株: wPip / 遺伝子: WP0282 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: B3CP62
#2: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 803 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 1.94 Å³/Da / 溶媒含有率: 36.71 %
結晶化	温度: 289 K / 手法: batch mode 詳細: 0.1M Tris pH 8.0, 30% w/v polyethylene glycol monomethyl ether 2000

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: SSRF / ビームライン: BL19U1 / 波長: 0.97776 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS3 X 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2017年5月13日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.97776 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.8→50 Å / Num. obs: 76435 / % possible obs: 95.6 % / 冗長度: 3.5 % / R_merge(I) obs: 0.09 / R_pim(I) all: 0.057 / R_rim(I) all: 0.106 / Χ²: 1.955 / Net I/σ(I): 26.4 / Num. measured all: 267156
反射シェル	解像度: 1.8→1.83 Å / 冗長度: 3.6 % / R_merge(I) obs: 0.655 / Num. unique obs: 3846 / CC_1/2: 0.994 / R_pim(I) all: 0.036 / R_rim(I) all: 0.067 / Χ²: 3.388 / % possible all: 95.2

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
HKL-2000		データスケーリング
PHENIX	1.14_3260	精密化
PDB_EXTRACT	3.27	データ抽出
PHENIX		モデル構築
AutoSol		位相決定

精密化

構造決定の手法:

単波長異常分散 / 解像度: 1.8→47.47 Å / SU ML: 0.17 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0.09 / 位相誤差: 20.22 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.198	1982	2.62 %
R_work	0.165	73537	-
obs	0.166	75519	94.3 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 102.09 Å² / B_iso mean: 32.01 Å² / B_iso min: 8.65 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 1.8→47.47 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	6885	0	0	803	7688
B_iso mean	-	-	-	37.78	-
残基数	-	-	-	-	841

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Refine-ID	タイプ	Rms dev position (Å)
1	1	A	3989	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0
1	2	B	3989	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / R_factor R_free error: 0

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	% reflection obs (%)
1.801-1.8319	0.2312	94	0.2003	3418	88
1.8319-1.8652	0.2277	100	0.1908	3612	92
1.8652-1.9011	0.2583	97	0.1949	3597	92
1.9011-1.9399	0.2162	98	0.1943	3593	93
1.9399-1.9821	0.2526	98	0.1875	3680	94
1.9821-2.0282	0.2593	99	0.1836	3702	95
2.0282-2.0789	0.2095	99	0.1735	3665	95
2.0789-2.1351	0.239	100	0.1722	3714	95
2.1351-2.198	0.2043	102	0.1622	3748	95
2.198-2.2689	0.1887	100	0.1643	3705	95
2.2689-2.35	0.2103	101	0.164	3753	96
2.35-2.4441	0.1991	99	0.162	3699	95
2.4441-2.5553	0.1752	100	0.1644	3725	95
2.5553-2.69	0.2368	102	0.1741	3755	96
2.69-2.8586	0.1984	100	0.1751	3713	96
2.8586-3.0792	0.2155	100	0.1761	3730	96
3.0792-3.389	0.2087	98	0.1701	3645	93
3.389-3.8792	0.1912	101	0.1528	3729	96
3.8792-4.8866	0.1486	96	0.1379	3618	93
4.8866-47.47	0.1725	98	0.1565	3736	95

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	6.4067	5.1457	4.753	7.0271	5.2224	4.6949	-0.2092	0.3396	-0.134	-0.2343	0.3419	-0.1068	-0.3378	0.5879	-0.1125	0.1101	-0.02	0.035	0.1748	-0.0021	0.1149	16.321	-24.004	45.001
2	1.8564	0.3206	1.257	1.8539	-0.0778	6.6929	-0.1512	0.3405	-0.0546	-0.699	0.4109	0.5407	-0.1025	-0.3255	-0.0003	0.275	-0.098	-0.075	0.1522	-0.0145	0.0399	5.679	-24.79	35.615
3	7.5476	-1.2888	0.3375	3.9359	-0.7011	3.2038	-0.0746	-0.7687	-0.3267	1.1715	0.0623	-0.4496	0.0787	0.0795	-0.0106	0.1816	-0.0195	-0.0111	0.2301	0.0057	0.149	11.576	-26.308	52.249
4	6.6388	-3.5886	4.2597	6.382	-3.4045	7.1298	0.0473	0.4392	-0.2663	-0.3779	-0.0296	0.0814	0.1219	0.0404	-0.0076	0.1779	-0.0452	0.0162	0.1453	-0.0509	0.1087	4.972	-33.652	40.329
5	6.4227	-1.8562	-1.9934	5.3169	1.2663	5.2137	-0.0492	0.0926	-0.5723	-0.0206	0.0694	0.0312	0.3947	-0.119	-0.0278	0.1518	-0.0606	-0.0251	0.1152	-0.0088	0.1192	0.498	-37.865	50.862
6	4.1236	1.2929	4.9134	7.8747	1.1915	7.5261	0.1521	-0.4373	-0.7319	0.2176	0.0733	-0.7332	1.2259	-0.1634	-0.206	0.3369	-0.0556	0.038	0.2176	0.0246	0.2146	-0.902	-41.569	64.646
7	6.4531	-0.0193	-1.3445	0.0658	-0.3403	2.2293	0.86	-0.9759	-2.0026	0.1597	-0.0858	-0.3731	0.4733	0.0115	-0.5468	0.9046	-0.1062	-0.3445	0.4199	0.1576	0.6692	6.061	-44.022	75.154
8	4.4525	-3.8125	-6.1846	6.9307	6.5624	9.0619	0.4054	-1.7818	-0.3908	-0.0555	0.1315	-1.4438	0.8142	1.3118	-0.0504	0.886	-0.2847	-0.0301	0.7438	0.3618	0.7297	0.128	-44.975	83.021
9	8.7613	5.1503	-4.8575	8.6477	-6.5664	7.9509	-0.0714	-0.5166	0.0332	0.5901	-0.2907	-0.0848	0.0352	0.5584	0.3652	0.4181	-0.0515	-0.0163	0.2746	0.0338	0.1564	-1.087	-35.155	72.943
10	2.6207	-2.6328	-0.44	3.6924	-1.1993	2.7961	0.1767	-1.6883	0.1547	0.7709	0.1305	-0.2928	-0.3235	0.064	-0.3259	0.2425	-0.0564	-0.0488	0.406	-0.0188	0.1497	-1.905	-27.409	62.394
11	5.9346	0.9001	-1.1455	3.8886	-0.3202	6.2734	0.1001	-0.5097	-0.4864	0.6294	0.3518	0.8995	0.4198	-0.5884	-0.3978	0.3027	-0.0655	0.0834	0.2795	0.0908	0.2447	-11.481	-32.811	64.784
12	5.5018	0.2704	2.3778	6.1848	0.3068	5.9995	-0.0181	-0.1358	0.218	0.11	0.0515	0.2239	-0.0033	-0.0173	-0.0382	0.0993	-0.0228	0.0255	0.1289	0.0134	0.0861	-11.527	-23.02	53.356
13	6.7165	4.5755	-0.5982	6.0154	0.5852	2.1957	0.1861	-0.2758	0.1734	-0.0179	-0.1532	0.6668	-0.1834	-0.6265	-0.0068	0.1154	-0.0163	-0.015	0.2532	0.054	0.2328	-17.121	-14.623	49.057
14	3.5503	1.7186	0.6206	6.7103	1.2689	3.7191	-0.1625	0.1983	-0.0699	0.0458	0.2257	-0.1761	-0.0832	0.2018	-0.06	0.0854	-0.0147	-0.0014	0.1831	0.0363	0.1216	-4.263	-13.436	47.8
15	6.9587	3.3277	2.6682	6.4907	-0.7912	4.9795	0.0194	0.2424	0.3175	-0.248	0.6471	1.6135	-0.0723	-1.2884	-0.2629	0.1786	0.0388	0.0071	0.4511	0.223	0.4459	-16.498	-6.239	41.833
16	5.1178	-4.4387	-5.8695	4.3497	5.1775	8.5316	-0.1447	-0.632	0.7207	0.3423	0.5213	-0.707	-0.2504	0.6305	-0.2499	0.1603	-0.0268	-0.0065	0.1796	0.0359	0.1929	-2.732	-4.854	44.699
17	7.9871	-2.053	0.2858	8.2983	-1.962	6.0811	0.0482	0.6561	0.1137	-0.7727	-0.1741	0.0276	0.0597	-0.0417	0.0467	0.1718	-0.0607	0.0154	0.2306	0.0238	0.118	-5.574	-9.274	34.169
18	3.8991	-4.3761	-1.4842	6.5401	0.1405	2.0527	0.3018	1.3086	0.1959	-0.9891	-0.0079	1.2907	-0.5823	-0.9453	-0.1412	0.399	0.1184	-0.0546	0.5272	0.174	0.5139	-11.201	5.079	34.216
19	5.4626	-2.8793	-1.9341	7.7574	2.0868	3.0449	0.0045	0.2073	0.0677	0.187	-0.0654	-0.1133	0.2516	-0.1463	0.0612	0.1186	-0.0241	0.0304	0.1138	0.0566	0.1076	5.993	-5.647	33.943
20	3.9562	-0.9037	-0.9143	2.5235	-0.0327	2.0613	0.1024	-0.0644	0.3602	0.0158	0.0941	-0.0924	-0.0566	-0.0229	-0.1529	0.1103	-0.0048	0.0221	0.1268	0.0568	0.178	11.205	0.133	30.201
21	5.2952	-1.9415	-1.6152	7.3025	0.9003	3.9041	0.1988	0.5545	0.1272	-0.3937	-0.087	0.0336	0.0704	-0.0507	-0.094	0.2165	0.0354	0.0136	0.287	0.0981	0.1912	11.861	-2.222	20.938
22	6.6941	-1.2184	1.3756	3.1627	-0.8012	4.1342	-0.0029	-0.3027	0.7792	0.1027	0.4087	-0.7602	-0.2569	-0.1576	-0.2416	0.1982	-0.009	0.0845	0.0891	-0.0064	0.5224	18.098	9.006	30.372
23	7.4439	-1.6768	1.869	6.663	-1.9659	3.4024	0.3155	-0.9906	-0.1519	0.7466	-0.3696	-1.0251	-0.0934	0.8764	0.1184	0.2735	-0.02	-0.1077	0.4122	0.0946	0.5181	26.09	-6.595	34.368
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25	5.4617	7.2041	5.136	9.6563	7.0728	5.0931	0.1969	-0.6445	0.5433	0.4365	-0.4737	0.4758	-0.1472	-0.8253	0.2438	0.2895	0.0629	0.0738	0.3716	-0.0081	0.2443	-21.463	-10.586	19.939
26	6.5657	4.9031	0.5195	6.2872	1.1872	6.8615	-0.0879	-0.0842	-0.0272	-0.0657	0.0276	0.2056	0.1521	-0.7729	0.0609	0.2039	0.0361	0.0162	0.2001	0.0155	0.1065	-23.642	-21.66	11.297
27	4.0628	0.5299	1.1087	6.8043	0.185	5.5342	-0.0767	-0.1065	0.3328	0.0136	0.1023	0.2925	-0.4561	-0.3682	-0.0103	0.1946	0.0622	0.0591	0.2311	0.0543	0.1363	-20.015	-11.184	9.06
28	8.7038	-0.3016	-1.5147	5.8194	0.3238	3.4705	0.0866	0.3383	0.6145	-0.3578	-0.0258	0.3336	-0.5258	-0.3033	-0.0388	0.3443	0.0175	-0.0292	0.1813	0.0312	0.1443	-15.417	-7.021	-0.881
29	1.6912	-0.3721	1.1961	4.9114	-0.9627	1.6024	-0.4231	0.2193	0.858	-0.1747	0.1196	-0.8675	-0.8993	0.3514	0.1419	0.6732	-0.1401	-0.0415	0.2649	0.0431	0.4915	-0.334	1.608	-1.099
30	5.3434	-0.9074	-0.9392	6.5064	2.175	4.7643	-0.0161	-0.0662	0.1423	-0.0983	0.1131	-0.2868	-0.2178	0.1026	-0.1025	0.1777	-0.0326	0.0169	0.127	-0.0054	0.0723	-0.606	-19.134	1.731
31	7.4217	0.3472	0.7026	2.6544	1.2455	7.9402	0.0332	0.2385	-0.0084	0.16	0.25	-0.4931	0.3476	1.0037	-0.2753	0.2591	0.0256	-0.0121	0.3096	-0.0242	0.1996	3.173	-29.199	4.166
32	6.4376	0.1019	-0.3332	4.6105	4.3145	4.6922	-0.1176	-0.6796	0.1731	0.1139	0.1953	-0.056	-0.3891	0.124	-0.0729	0.3025	0.0315	0.0128	0.2816	0.0362	0.1138	-5.655	-24.35	11.629
33	4.5933	-0.8323	4.6695	2.2256	-1.465	5.0282	0.2307	0.0773	-0.3177	-0.5099	-0.122	-0.4286	0.8474	0.8696	-0.2524	0.3463	0.0878	0.0267	0.3387	-0.0042	0.2016	1.178	-38.471	10.154
34	4.6581	-4.2927	2.0177	4.7522	-1.8974	6.4696	-0.1063	-0.7276	0.5731	0.4225	0.1758	-0.5337	-0.491	0.2569	0.0239	0.3015	-0.0491	0.004	0.2423	-0.0069	0.1366	-4.036	-30.888	20.783
35	6.9852	-4.2391	0.5517	4.0973	-2.0554	2.7154	0.3075	0.3206	-0.207	-0.3784	-0.2158	0.2882	0.1318	-0.1798	-0.0969	0.18	0.0086	0.0283	0.1876	0.0045	0.0886	-12.132	-34.635	14.109
36	6.7756	-0.5474	1.268	5.9852	1.9936	8.6729	0.058	0.6484	-1.2051	-0.7806	-0.0337	-0.4893	0.8702	0.5097	-0.0653	0.4075	0.083	0.107	0.304	-0.0473	0.3592	-3.83	-48.782	18.497
37	8.5181	-4.0457	0.1876	4.9638	-1.0717	2.7666	-0.001	-0.066	0.1884	-0.0464	0.0477	0.0279	-0.1553	0.0123	-0.0438	0.139	-0.0113	0.0281	0.1358	0.0199	0.0454	-17.167	-33.241	25.022
38	2.9557	-0.023	-1.3914	4.2039	1.4676	6.6574	-0.0517	-0.6506	-0.2978	0.2614	-0.0841	-0.1609	0.3533	0.3631	0.0619	0.1468	0.022	0.0011	0.2811	0.0928	0.1949	-12.284	-43.442	34.474
39	7.719	-1.8108	2.4277	6.5608	-2.0001	8.1992	0.0017	0.1403	0.4569	-0.0813	-0.0666	0.2908	-0.1906	-0.1066	0.0442	0.1431	0.02	0.0429	0.1013	-0.0065	0.1258	-29.172	-30.074	29.659
40	8.9136	-5.6366	3.9116	8.6628	-3.7572	4.3077	0.0547	0.1051	-0.3589	-0.2267	-0.2073	0.34	0.1684	0.0896	0.0974	0.1687	-0.0102	0.0316	0.1811	-0.0241	0.1881	-28.44	-41.815	29.168
41	5.2081	-3.8815	-1.1385	8.5456	-0.5271	3.4352	-0.1211	-0.5115	0.2507	0.3484	0.0388	-0.5154	-0.1635	0.3544	0.1253	0.1695	-0.0524	-0.0366	0.2515	0.0081	0.1322	-24.007	-34.377	41.564
42	4.9004	4.2996	0.1494	8.9701	0.2542	5.7677	0.1357	-0.0932	-0.6112	0.2662	-0.2487	0.1393	0.2705	0.0266	0.0641	0.1253	0.0128	0.0319	0.2126	0.0126	0.245	-32.205	-41.995	38.75

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	( CHAIN A AND RESID 2:18 )	A	2 - 18
2	X-RAY DIFFRACTION	2	( CHAIN A AND RESID 19:38 )	A	19 - 38
3	X-RAY DIFFRACTION	3	( CHAIN A AND RESID 39:53 )	A	39 - 53
4	X-RAY DIFFRACTION	4	( CHAIN A AND RESID 54:76 )	A	54 - 76
5	X-RAY DIFFRACTION	5	( CHAIN A AND RESID 77:110 )	A	77 - 110
6	X-RAY DIFFRACTION	6	( CHAIN A AND RESID 111:122 )	A	111 - 122
7	X-RAY DIFFRACTION	7	( CHAIN A AND RESID 123:127 )	A	123 - 127
8	X-RAY DIFFRACTION	8	( CHAIN A AND RESID 128:135 )	A	128 - 135
9	X-RAY DIFFRACTION	9	( CHAIN A AND RESID 136:154 )	A	136 - 154
10	X-RAY DIFFRACTION	10	( CHAIN A AND RESID 155:159 )	A	155 - 159
11	X-RAY DIFFRACTION	11	( CHAIN A AND RESID 160:173 )	A	160 - 173
12	X-RAY DIFFRACTION	12	( CHAIN A AND RESID 174:198 )	A	174 - 198
13	X-RAY DIFFRACTION	13	( CHAIN A AND RESID 199:213 )	A	199 - 213
14	X-RAY DIFFRACTION	14	( CHAIN A AND RESID 214:232 )	A	214 - 232
15	X-RAY DIFFRACTION	15	( CHAIN A AND RESID 233:245 )	A	233 - 245
16	X-RAY DIFFRACTION	16	( CHAIN A AND RESID 246:259 )	A	246 - 259
17	X-RAY DIFFRACTION	17	( CHAIN A AND RESID 260:276 )	A	260 - 276
18	X-RAY DIFFRACTION	18	( CHAIN A AND RESID 277:290 )	A	277 - 290
19	X-RAY DIFFRACTION	19	( CHAIN A AND RESID 291:324 )	A	291 - 324
20	X-RAY DIFFRACTION	20	( CHAIN A AND RESID 325:364 )	A	325 - 364
21	X-RAY DIFFRACTION	21	( CHAIN A AND RESID 365:385 )	A	365 - 385
22	X-RAY DIFFRACTION	22	( CHAIN A AND RESID 386:404 )	A	386 - 404
23	X-RAY DIFFRACTION	23	( CHAIN A AND RESID 406:414 )	A	406 - 414
24	X-RAY DIFFRACTION	24	( CHAIN A AND RESID 415:428 )	A	415 - 428
25	X-RAY DIFFRACTION	25	( CHAIN B AND RESID 2:18 )	B	2 - 18
26	X-RAY DIFFRACTION	26	( CHAIN B AND RESID 19:38 )	B	19 - 38
27	X-RAY DIFFRACTION	27	( CHAIN B AND RESID 39:76 )	B	39 - 76
28	X-RAY DIFFRACTION	28	( CHAIN B AND RESID 77:110 )	B	77 - 110
29	X-RAY DIFFRACTION	29	( CHAIN B AND RESID 111:173 )	B	111 - 173
30	X-RAY DIFFRACTION	30	( CHAIN B AND RESID 174:198 )	B	174 - 198
31	X-RAY DIFFRACTION	31	( CHAIN B AND RESID 199:213 )	B	199 - 213
32	X-RAY DIFFRACTION	32	( CHAIN B AND RESID 214:232 )	B	214 - 232
33	X-RAY DIFFRACTION	33	( CHAIN B AND RESID 233:245 )	B	233 - 245
34	X-RAY DIFFRACTION	34	( CHAIN B AND RESID 246:259 )	B	246 - 259
35	X-RAY DIFFRACTION	35	( CHAIN B AND RESID 260:273 )	B	260 - 273
36	X-RAY DIFFRACTION	36	( CHAIN B AND RESID 274:290 )	B	274 - 290
37	X-RAY DIFFRACTION	37	( CHAIN B AND RESID 291:324 )	B	291 - 324
38	X-RAY DIFFRACTION	38	( CHAIN B AND RESID 325:345 )	B	325 - 345
39	X-RAY DIFFRACTION	39	( CHAIN B AND RESID 346:364 )	B	346 - 364
40	X-RAY DIFFRACTION	40	( CHAIN B AND RESID 365:385 )	B	365 - 385
41	X-RAY DIFFRACTION	41	( CHAIN B AND RESID 386:414 )	B	386 - 414
42	X-RAY DIFFRACTION	42	( CHAIN B AND RESID 415:431 )	B	415 - 431

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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