ソフトウェア | 名称 | バージョン | 分類 |
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XSCALE | | データスケーリング | PHENIX | 1.17.1精密化 | XDS | | データ削減 | PHASER | | 位相決定 | |
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精密化 | 構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: 1Q9A 解像度: 2.593→26.658 Å / SU ML: 0.23 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.42 / 位相誤差: 28.48 / 立体化学のターゲット値: ML 詳細: The Sf file contains friedel pairs under F_plus and F_minus columns.
| Rfactor | 反射数 | %反射 |
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Rfree | 0.2435 | 417 | 9.84 % |
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Rwork | 0.1796 | 3822 | - |
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obs | 0.1861 | 4239 | 99 % |
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL |
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原子変位パラメータ | Biso max: 228.25 Å2 / Biso mean: 24.1093 Å2 / Biso min: 5.14 Å2 |
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精密化ステップ | サイクル: final / 解像度: 2.593→26.658 Å
| タンパク質 | 核酸 | リガンド | 溶媒 | 全体 |
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原子数 | 0 | 556 | 6 | 4 | 566 |
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Biso mean | - | - | 129.21 | 23.01 | - |
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残基数 | - | - | - | - | 26 |
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拘束条件 | Refine-ID | タイプ | Dev ideal | 数 |
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X-RAY DIFFRACTION | f_bond_d0.005 | 622 | X-RAY DIFFRACTION | f_angle_d0.934 | 969 | X-RAY DIFFRACTION | f_chiral_restr0.038 | 129 | X-RAY DIFFRACTION | f_plane_restr0.006 | 26 | X-RAY DIFFRACTION | f_dihedral_angle_d13.463 | 308 | | | | | |
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LS精密化 シェル | Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Rfactor Rfree error: 0 / % reflection obs: 99 % 解像度 (Å) | Rfactor Rfree | Num. reflection Rfree | Rfactor Rwork | Num. reflection Rwork |
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2.593-2.9675 | 0.3634 | 140 | 0.2699 | 1286 | 2.9675-3.7371 | 0.2189 | 144 | 0.1568 | 1256 | 3.7371-26.658 | 0.2127 | 133 | 0.1614 | 1280 |
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