登録情報 | データベース: PDB / ID: 7e4s |
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タイトル | Crystal structure of Lactobacillus rhamnosus 4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol-isomerase KduI complexed with HEPES |
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要素 | 5-dehydro-4-deoxy-D-glucuronate isomerase |
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キーワード | ISOMERASE / 4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate / cupin |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
5-dehydro-4-deoxy-D-glucuronate isomerase / 4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol-isomerase activity / pectin catabolic process / zinc ion binding類似検索 - 分子機能 5-keto 4-deoxyuronate isomerase / 5-keto-4-deoxyuronate isomerase, N-terminal / KduI/IolB isomerase / KduI/IolB family / RmlC-like cupin domain superfamily / RmlC-like jelly roll fold類似検索 - ドメイン・相同性 4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol-isomerase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Lactobacillus rhamnosus (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.79 Å |
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データ登録者 | Yamamoto, Y. / Takase, R. / Mikami, B. / Hashimoto, W. |
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資金援助 | 日本, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Japan Society for the Promotion of Science (JSPS) | 18H02166 | 日本 |
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引用 | ジャーナル: J.Appl.Glyosci. / 年: 2023 タイトル: Crystal structures of Lacticaseibacillus 4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol-isomerase KduI in complex with substrate analogs 著者: Iwase, H. / Yamamoto, Y. / Yamada, A. / Kawai, K. / Oiki, S. / Watanabe, D. / Mikami, B. / Takase, R. / Hashimoto, W. |
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履歴 | 登録 | 2021年2月15日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2022年2月23日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2023年11月15日 | Group: Data collection / Database references カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.title / _citation.year |
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改定 1.2 | 2023年11月29日 | Group: Refinement description / カテゴリ: pdbx_initial_refinement_model |
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