- PDB-7do6: Crystal structure of Azotobacter vinelandii L-rhamnose 1-dehydrog... -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 7do6
タイトル
Crystal structure of Azotobacter vinelandii L-rhamnose 1-dehydrogenase(NADP bound-form)
要素
Short-chain dehydrogenase/reductase SDR
キーワード
OXIDOREDUCTASE / L-Rhamnose metabolism / NADP-dependent dehydrogenase / SDR protein family
機能・相同性
機能・相同性情報
L-rhamnose 1-dehydrogenase [NAD(P)+] / rhamnose metabolic process / oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor / quinone binding / fatty acid biosynthetic process / nucleotide binding 類似検索 - 分子機能
構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 2.37→50.03 Å / SU ML: 0.35 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.96 / 位相誤差: 29.37 / 立体化学のターゲット値: ML 詳細: The entry contains friedel pairs in F_plus/minus columns and I_plus/minus columns
Rfactor
反射数
%反射
Rfree
0.2573
4170
5.04 %
Rwork
0.2049
78609
-
obs
0.2076
82779
98.12 %
溶媒の処理
減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL