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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6xlh | ||||||||||||||||||
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タイトル | Asymmetric hydrolysis state of Hsc82 in complex with Aha1 bound with ADP and ATPgammaS | ||||||||||||||||||
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![]() | CHAPERONE / Co-chaperone / activator | ||||||||||||||||||
機能・相同性 | ![]() Tetrahydrobiopterin (BH4) synthesis, recycling, salvage and regulation / eNOS activation / Extra-nuclear estrogen signaling / VEGFR2 mediated vascular permeability / HSP90 chaperone cycle for steroid hormone receptors (SHR) in the presence of ligand / HSF1-dependent transactivation / HSF1 activation / response to oxygen levels / box C/D snoRNP assembly / ATPase activator activity ...Tetrahydrobiopterin (BH4) synthesis, recycling, salvage and regulation / eNOS activation / Extra-nuclear estrogen signaling / VEGFR2 mediated vascular permeability / HSP90 chaperone cycle for steroid hormone receptors (SHR) in the presence of ligand / HSF1-dependent transactivation / HSF1 activation / response to oxygen levels / box C/D snoRNP assembly / ATPase activator activity / proteasome assembly / Neutrophil degranulation / telomere maintenance / ATP-dependent protein folding chaperone / disordered domain specific binding / unfolded protein binding / protein folding / cellular response to heat / protein-folding chaperone binding / protein stabilization / perinuclear region of cytoplasm / ATP hydrolysis activity / protein-containing complex / mitochondrion / ATP binding / plasma membrane / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||||||||||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||||||||||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.83 Å | ||||||||||||||||||
![]() | Liu, Y.X. / Sun, M. / Myasnikov, A.G. / Elnatan, D. / Agard, D.A. | ||||||||||||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Cryo-EM structures reveal a multistep mechanism of Hsp90 activation by co-chaperone Aha1 著者: Liu, Y.X. / Sun, M. / Myasnikov, A.G. / Elnatan, D. / Agard, D.A. | ||||||||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
ムービー |
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構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 318.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 247.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 54 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 80.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
-タンパク質 , 2種, 4分子 ABCD
#1: タンパク質 | 分子量: 81003.594 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 株: ATCC 204508 / S288c / 遺伝子: HSC82, YMR186W, YM8010.16 / 発現宿主: ![]() ![]() #2: タンパク質 | 分子量: 39486.422 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 株: ATCC 204508 / S288c / 遺伝子: AHA1, YDR214W, YD8142.16, YD8142B.06 / 発現宿主: ![]() ![]() |
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-非ポリマー , 4種, 6分子 ![](data/chem/img/AGS.gif)
![](data/chem/img/MG.gif)
![](data/chem/img/K.gif)
![](data/chem/img/ADP.gif)
![](data/chem/img/MG.gif)
![](data/chem/img/K.gif)
![](data/chem/img/ADP.gif)
#3: 化合物 | ChemComp-AGS / | ||||
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#4: 化合物 | #5: 化合物 | #6: 化合物 | ChemComp-ADP / | |
-詳細
研究の焦点であるリガンドがあるか | Y |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
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試料調製
構成要素 | 名称: Asymmetric hydrolysis state of Hsc82 in complex with Aha1 bound with ADP and ATPgammaS タイプ: COMPLEX / Entity ID: #1-#2 / 由来: RECOMBINANT |
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分子量 | 単位: MEGADALTONS / 実験値: YES |
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() 株: ATCC 204508 / S288c |
由来(組換発現) | 生物種: ![]() ![]() |
緩衝液 | pH: 7.5 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD |
撮影 | 電子線照射量: 72 e/Å2 / 検出モード: SUPER-RESOLUTION フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) |
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解析
ソフトウェア |
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CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING ONLY | ||||||||||||||||||||||||
3次元再構成 | 解像度: 2.83 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 112624 / 対称性のタイプ: POINT | ||||||||||||||||||||||||
原子モデル構築 | プロトコル: FLEXIBLE FIT / 空間: REAL | ||||||||||||||||||||||||
精密化 | 交差検証法: NONE 立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2 | ||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 46.99 Å2 | ||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
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