登録情報 データベース : PDB / ID : 6vnr 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal Structure of Danio rerio Histone Deacetylase 6 Catalytic Domain 2 (CD2) Complexed with Bishydroxamic Acid Inhibitor 要素Hdac6 protein 詳細 キーワード Hydrolase/Hydrolase Inhibitor / Histone deacetylase / metallohydrolase / Hydrolase-Hydrolase Inhibitor complex機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
Aggrephagy / tubulin deacetylase activity / swimming behavior / definitive hemopoiesis / protein lysine deacetylase activity / regulation of tubulin deacetylation / histone deacetylase activity / potassium ion binding / histone deacetylase complex / hematopoietic progenitor cell differentiation ... Aggrephagy / tubulin deacetylase activity / swimming behavior / definitive hemopoiesis / protein lysine deacetylase activity / regulation of tubulin deacetylation / histone deacetylase activity / potassium ion binding / histone deacetylase complex / hematopoietic progenitor cell differentiation / angiogenesis / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / zinc ion binding 類似検索 - 分子機能 Ubiquitin Carboxyl-terminal Hydrolase-like zinc finger / Zinc finger, UBP-type / Zn-finger in ubiquitin-hydrolases and other protein / Zinc finger UBP-type profile. / Histone deacetylase domain / Arginase; Chain A / Histone deacetylase family / Histone deacetylase domain / Histone deacetylase domain superfamily / Histone deacetylase domain ... Ubiquitin Carboxyl-terminal Hydrolase-like zinc finger / Zinc finger, UBP-type / Zn-finger in ubiquitin-hydrolases and other protein / Zinc finger UBP-type profile. / Histone deacetylase domain / Arginase; Chain A / Histone deacetylase family / Histone deacetylase domain / Histone deacetylase domain superfamily / Histone deacetylase domain / Ureohydrolase domain superfamily / Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 : / Chem-R5G / Hdac6 protein / Histone deacetylase 6 類似検索 - 構成要素生物種 Danio rerio (ゼブラフィッシュ)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.94301319072 Å 詳細データ登録者 Osko, J.D. / Porter, N.J. / Christianson, D.W. 資金援助 米国, 1件 詳細 詳細を隠す組織 認可番号 国 National Institutes of Health/National Human Genome Research Institute (NIH/NHGRI) GM49758 米国
引用ジャーナル : Chemmedchem / 年 : 2020タイトル : Design and Synthesis of Dihydroxamic Acids as HDAC6/8/10 Inhibitors.著者 : Morgen, M. / Steimbach, R.R. / Geraldy, M. / Hellweg, L. / Sehr, P. / Ridinger, J. / Witt, O. / Oehme, I. / Herbst-Gervasoni, C.J. / Osko, J.D. / Porter, N.J. / Christianson, D.W. / Gunkel, N. / Miller, A.K. 履歴 登録 2020年1月29日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2020年5月13日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2020年7月15日 Group : Database references / カテゴリ : citation / citation_authorItem : _citation.journal_volume / _citation.page_first ... _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation_author.name 改定 1.2 2023年10月11日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id
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