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- PDB-6vc7: Structure of the F349A mutant of the periplasmic domain of YejM f... -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 6vc7
タイトルStructure of the F349A mutant of the periplasmic domain of YejM from Salmonella typhimurium
要素Periplasmic domain of the cardiolipin transporter protein YejM/PbgA
キーワードHydrolase / Transport protein / YejM / membrane protein / phosphatase / cardiolipin
機能・相同性
機能・相同性情報


Inner membrane protein YejM / Inner membrane protein YejM, N-terminal / : / Domain of unknown function (DUF3413) / Sulfatase, N-terminal / Sulfatase / Alkaline-phosphatase-like, core domain superfamily
類似検索 - ドメイン・相同性
ETHANOLAMINE / : / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / TRIETHYLENE GLYCOL / : / Inner membrane protein YejM
類似検索 - 構成要素
生物種Salmonella typhimurium (サルモネラ菌)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.05 Å
データ登録者Gabale, U. / Ressl, S.
引用ジャーナル: Sci Rep / 年: 2020
タイトル: The essential inner membrane protein YejM is a metalloenzyme.
著者: Gabale, U. / Pena Palomino, P.A. / Kim, H. / Chen, W. / Ressl, S.
履歴
登録2019年12月20日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02020年8月26日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12020年10月28日Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author
Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.title / _citation.year
改定 1.22020年11月4日Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author
Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation_author.identifier_ORCID / _citation_author.name
改定 1.32023年10月11日Group: Data collection / Database references / Refinement description
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model
Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
改定 2.02023年11月15日Group: Atomic model / Data collection / カテゴリ: atom_site / chem_comp_atom / chem_comp_bond
Item: _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id ..._atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id / _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_1 / _chem_comp_bond.atom_id_2

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
A: Periplasmic domain of the cardiolipin transporter protein YejM/PbgA
B: Periplasmic domain of the cardiolipin transporter protein YejM/PbgA
C: Periplasmic domain of the cardiolipin transporter protein YejM/PbgA
D: Periplasmic domain of the cardiolipin transporter protein YejM/PbgA
E: Periplasmic domain of the cardiolipin transporter protein YejM/PbgA
F: Periplasmic domain of the cardiolipin transporter protein YejM/PbgA
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)251,84758
ポリマ－246,5866
非ポリマー5,26152
水18,1951010
1
A: Periplasmic domain of the cardiolipin transporter protein YejM/PbgA
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)42,32714
ポリマ－41,0981
非ポリマー1,23013
水181
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
手法PISA
2
B: Periplasmic domain of the cardiolipin transporter protein YejM/PbgA
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)42,09711
ポリマ－41,0981
非ポリマー99910
水181
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
手法PISA
3
C: Periplasmic domain of the cardiolipin transporter protein YejM/PbgA
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)42,01410
ポリマ－41,0981
非ポリマー9169
水181
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
手法PISA
4
D: Periplasmic domain of the cardiolipin transporter protein YejM/PbgA
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)41,7177
ポリマ－41,0981
非ポリマー6196
水181
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
手法PISA
5
E: Periplasmic domain of the cardiolipin transporter protein YejM/PbgA
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)41,8649
ポリマ－41,0981
非ポリマー7668
水181
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
手法PISA
6
F: Periplasmic domain of the cardiolipin transporter protein YejM/PbgA
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)41,8287
ポリマ－41,0981
非ポリマー7306
水181
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
手法PISA
単位格子
Length a, b, c (Å)121.612, 124.899, 183.296
Angle α, β, γ (deg.)90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number19
Space group name H-MP212121

-
要素

-
タンパク質 , 1種, 6分子 ABCDEF

#1: タンパク質
Periplasmic domain of the cardiolipin transporter protein YejM/PbgA


分子量: 41097.707 Da / 分子数: 6 / 変異: F349A / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現) Salmonella typhimurium (サルモネラ菌)
遺伝子: pbgA, FKA83_01810 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: A0A5A8TP41, UniProt: P40709*PLUS

-
非ポリマー , 10種, 1062分子

#2: 化合物 ChemComp-P6G / HEXAETHYLENE GLYCOL / POLYETHYLENE GLYCOL PEG400 / ヘキサエチレングリコ-ル


分子量: 282.331 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C12H26O7 / コメント: 沈殿剤*YM
#3: 化合物 ChemComp-PGE / TRIETHYLENE GLYCOL / トリエチレングリコ-ル


分子量: 150.173 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C6H14O4
#4: 化合物 ChemComp-PEG / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / ジエチレングリコ-ル


分子量: 106.120 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C4H10O3
#5: 化合物
ChemComp-ETA / ETHANOLAMINE / エタノ-ルアミン


タイプ: L-peptide COOH carboxy terminus / 分子量: 61.083 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 合成 / 式: C2H7NO
#6: 化合物...
ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル


分子量: 62.068 Da / 分子数: 21 / 由来タイプ: 天然 / 式: C2H6O2
#7: 化合物
ChemComp-PG4 / TETRAETHYLENE GLYCOL / テトラエチレングリコ-ル


分子量: 194.226 Da / 分子数: 7 / 由来タイプ: 合成 / 式: C8H18O5 / コメント: 沈殿剤*YM
#8: 化合物
ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン


分子量: 24.305 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg
#9: 化合物 ChemComp-K / POTASSIUM ION / カリウムカチオン


分子量: 39.098 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: K
#10: 化合物 ChemComp-1PE / PENTAETHYLENE GLYCOL / PEG400 / ペンタエチレングリコ-ル


分子量: 238.278 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C10H22O6 / コメント: 沈殿剤*YM
#11: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 1010 / 由来タイプ: 天然 / 式: H2O

-
詳細

研究の焦点であるリガンドがあるかN

-
実験情報

-
実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶マシュー密度: 2.93 Å3/Da / 溶媒含有率: 57.96 %
結晶化温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.8 / 詳細: 0.1 M HEPES pH 6.8, 5% PEG3350

-
データ収集

回折平均測定温度: 80 K / Serial crystal experiment: N
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: ALS / ビームライン: 4.2.2 / 波長: 1.001 Å
検出器タイプ: RDI CMOS_8M / 検出器: CMOS / 日付: 2018年3月14日
放射プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 1.001 Å / 相対比: 1
反射解像度: 2.05→43.67 Å / Num. obs: 150136 / % possible obs: 85.9 % / 冗長度: 6.4 % / CC1/2: 0.997 / Net I/σ(I): 13.8
反射 シェル解像度: 2.05→2.123 Å / Num. unique obs: 8464 / CC1/2: 0.184 / % possible all: 48.97

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
PHENIX1.17.1_3660精密化
XDSデータ削減
Aimlessデータスケーリング
PHASER位相決定
精密化構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: 6VAT

6vat


解像度: 2.05→43.56 Å / SU ML: 0.26 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 25.19
Rfactor反射数%反射
Rfree0.2268 7477 4.98 %
Rwork0.1845 --
obs0.1866 150136 85.9 %
溶媒の処理減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å
原子変位パラメータBiso max: 201.91 Å2 / Biso mean: 47.2317 Å2 / Biso min: 15.8 Å2
精密化ステップサイクル: final / 解像度: 2.05→43.56 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数16308 0 340 1010 17658
Biso mean--62.56 45.18 -
残基数----2064
LS精密化 シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Rfactor Rfree error: 0 / Total num. of bins used: 30

解像度 (Å)Rfactor RfreeNum. reflection RfreeRfactor RworkNum. reflection RworkNum. reflection all% reflection obs (%)
2.05-2.070.35341210.32732561268246
2.07-2.10.36831270.31982662278949
2.1-2.120.33961670.31032826299352
2.12-2.150.32621520.29783033318555
2.15-2.180.34951590.28693184334358
2.18-2.210.33421750.28213331350661
2.21-2.240.3331890.26933561375065
2.24-2.270.28691840.25453735391968
2.27-2.310.28361760.24384038421473
2.31-2.350.29532340.23434267450177
2.35-2.390.29182160.22974592480883
2.39-2.430.27532570.22964883514089
2.43-2.480.26933040.22785349565397
2.48-2.530.28322860.208155295815100
2.53-2.580.24993080.2154775785100
2.58-2.640.24453050.207954855790100
2.64-2.710.24692950.207255015796100
2.71-2.780.2773230.222554835806100
2.78-2.860.25562830.204655055788100
2.86-2.960.25852940.197455555849100
2.96-3.060.21752730.198555105783100
3.06-3.180.23342840.194555415825100
3.18-3.330.2422680.193155865854100
3.33-3.50.20142730.174355785851100
3.5-3.720.22392710.161555875858100
3.72-4.010.19952940.153455815875100
4.01-4.420.17833190.139455625881100
4.42-5.050.1743180.124456265944100
5.05-6.360.19413190.164856545973100
6.36-43.670.19283030.16358776180100
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL11 (°2)L12 (°2)L13 (°2)L22 (°2)L23 (°2)L33 (°2)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T11 (Å2)T12 (Å2)T13 (Å2)T22 (Å2)T23 (Å2)T33 (Å2)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
12.7271-0.58311.3037.333-0.2432.74980.02840.22460.2268-0.2445-0.12140.44-0.2528-0.24530.09820.10970.04770.02670.32420.00440.1373-35.37436.1617-37.0883
21.8138-0.24330.49452.5170.79961.56350.14810.1638-0.39220.1283-0.13260.23040.2671-0.2687-0.01360.1812-0.0314-0.02470.2707-0.03480.2289-32.371824.0022-30.9198
34.78861.6909-0.90425.49450.69471.90270.1806-0.1318-0.17460.208-0.0830.80640.2325-0.6932-0.22140.2543-0.0888-0.03120.4197-0.1170.4094-43.335916.9748-32.737
42.84570.26030.71941.18440.26321.31250.23520.1895-0.4858-0.0128-0.0543-0.07510.2538-0.0186-0.18830.20160.0206-0.03490.2466-0.06380.2483-22.456722.1806-33.0092
52.4136-2.39173.36382.5767-3.33864.6827-0.2915-0.2090.43560.18870.11960.2274-0.4368-0.28050.21560.245-0.0084-0.06850.2119-0.060.3279-16.601739.2626-24.9851
61.69450.0837-0.97422.8181-0.45362.42160.0184-0.0430.0220.15930.00960.3084-0.1026-0.0601-0.0340.18250.01820.03050.1861-0.00190.1733-58.497139.8777-2.1419
71.4960.2974-0.60782.4635-0.79031.22760.01120.40350.2495-0.28260.15910.50690.0423-0.2824-0.14050.20290.0059-0.0230.31470.07180.2335-61.821744.5444-13.3943
85.78481.85290.41321.7191-1.99574.05810.13780.5695-0.4492-0.63770.01380.59750.0678-0.19510.22820.2229-0.0618-0.05080.31030.06430.2091-67.423937.0576-10.9797
91.17920.6217-0.23772.3782-0.4641.84660.0879-0.02260.28080.27620.02240.4469-0.1144-0.1587-0.04970.19940.01080.07790.19680.01370.2542-60.90742.54670.9692
105.93860.64310.19695.58720.98712.08440.2199-0.17990.55460.41820.00540.2683-0.34120.0137-0.2460.4293-0.06310.15660.20380.00120.365-54.392263.66044.5648
115.228-1.50570.98272.71820.27491.88020.0032-0.3786-0.02390.3820.1158-0.2166-0.09750.1344-0.08740.2846-0.0497-0.03750.11220.01350.20216.002262.2206-2.7643
122.3906-0.21781.04421.60450.75911.8022-0.13660.24070.3649-0.10820.0993-0.2129-0.51560.20470.00540.3492-0.0567-0.01780.18210.03920.26915.341769.2417-13.2954
136.7306-0.2986-0.57185.0386-0.06443.35280.0918-0.19090.5318-0.35010.2269-0.3216-0.72580.4414-0.47120.3335-0.1306-0.03780.2155-0.0290.345312.536670.1094-8.4424
142.20781.8341.25742.68640.21731.30740.00410.0832-0.16050.10470.1813-0.8273-0.21270.4108-0.18570.2412-0.0667-0.10920.2976-0.03450.408918.475560.4682-6.3435
151.1222-0.2488-0.03883.2710.91581.3442-0.0503-0.0353-0.11470.28190.0563-0.03380.00660.027-0.04190.2002-0.007-0.0370.17680.01240.16971.755850.029-7.4103
166.9731-3.5946-2.41222.581-0.20134.91360.08370.13870.24740.24850.03350.5399-0.5984-0.014-0.13560.2203-0.018-0.07710.2156-0.02480.3447-9.032347.4256-16.0175
172.6003-0.3355-0.70512.56891.26822.60590.13170.05740.3586-0.21320.0588-0.1651-0.27730.0272-0.23750.25490.00060.05390.2763-0.01710.20329.618325.5078-54.2059
182.1743-1.3004-1.46217.8281.67126.08940.14150.58630.4696-0.4831-0.07190.6569-0.5437-0.4706-0.03930.4110.1250.10670.34270.05770.3560.170334.3882-56.7957
192.6307-0.63580.17781.88690.69672.1129-0.034-0.42540.31360.22510.1861-0.2423-0.04490.155-0.14190.2814-0.00790.05590.3607-0.09230.242814.089123.7267-42.7991
202.1246-0.5397-0.81953.07910.46493.2560.0046-0.01840.29850.0843-0.0243-0.2126-0.32590.028-0.00150.23670.03810.08570.1964-0.01870.3629-28.225594.1327-0.6351
210.90030.05890.09744.3781.00162.31810.0491-0.25620.36230.25850.1241-0.98560.01410.7121-0.14110.29690.0310.06330.434-0.08560.6382-15.319588.6631-1.3609
224.3905-0.28220.82733.66250.85543.7459-0.0692-0.1010.3353-0.28530.1134-0.8084-0.31220.94470.0330.3506-0.10710.09250.3387-0.16030.6626-15.927797.80551.3757
231.8286-0.201-0.9311.95780.77533.04760.1564-0.11390.39740.13390.061-0.2581-0.477-0.0264-0.13030.36560.04620.08870.1902-0.04890.39-30.257296.45881.9267
246.40151.359-1.5714.32260.62635.28820.0029-0.11680.01330.4625-0.08850.20090.3181-0.42130.11680.3273-0.01230.11710.2384-0.02260.3552-42.742178.86386.7644
252.4832-0.08670.50672.02990.8273.8451-0.025-0.2746-0.0940.28270.1091-0.3980.01770.2423-0.00380.2601-0.0489-0.07740.312-0.10640.381461.8956-3.0434-43.9939
263.4511-0.30611.1211.22750.52712.77720.1614-0.3694-0.69190.20060.0612-0.22620.6252-0.0545-0.25220.3558-0.0468-0.08260.29-0.03450.442755.3776-15.6011-46.3638
274.30760.05073.76064.219-2.11474.4379-0.1489-0.1938-0.71160.1911-0.1944-0.24660.46470.32850.07120.3540.0717-0.17210.2996-0.03570.510363.6843-15.1855-39.9157
282.422-0.48190.45622.26150.65352.6378-0.0386-0.4330.1440.28220.0764-0.1927-0.0564-0.0306-0.01420.2428-0.0566-0.06690.3597-0.0990.308355.94321.9135-39.9869
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDSelection detailsAuth asym-IDAuth seq-ID
1X-RAY DIFFRACTION1chain 'A' and (resid 243 through 267 )A243 - 267
2X-RAY DIFFRACTION2chain 'A' and (resid 268 through 360 )A268 - 360
3X-RAY DIFFRACTION3chain 'A' and (resid 361 through 409 )A361 - 409
4X-RAY DIFFRACTION4chain 'A' and (resid 410 through 569 )A410 - 569
5X-RAY DIFFRACTION5chain 'A' and (resid 570 through 586 )A570 - 586
6X-RAY DIFFRACTION6chain 'B' and (resid 243 through 292 )B243 - 292
7X-RAY DIFFRACTION7chain 'B' and (resid 293 through 384 )B293 - 384
8X-RAY DIFFRACTION8chain 'B' and (resid 385 through 408 )B385 - 408
9X-RAY DIFFRACTION9chain 'B' and (resid 409 through 526 )B409 - 526
10X-RAY DIFFRACTION10chain 'B' and (resid 527 through 586 )B527 - 586
11X-RAY DIFFRACTION11chain 'C' and (resid 243 through 292 )C243 - 292
12X-RAY DIFFRACTION12chain 'C' and (resid 293 through 386 )C293 - 386
13X-RAY DIFFRACTION13chain 'C' and (resid 387 through 408 )C387 - 408
14X-RAY DIFFRACTION14chain 'C' and (resid 409 through 465 )C409 - 465
15X-RAY DIFFRACTION15chain 'C' and (resid 466 through 569 )C466 - 569
16X-RAY DIFFRACTION16chain 'C' and (resid 570 through 586 )C570 - 586
17X-RAY DIFFRACTION17chain 'D' and (resid 243 through 371 )D243 - 371
18X-RAY DIFFRACTION18chain 'D' and (resid 372 through 408 )D372 - 408
19X-RAY DIFFRACTION19chain 'D' and (resid 409 through 586 )D409 - 586
20X-RAY DIFFRACTION20chain 'E' and (resid 243 through 311 )E243 - 311
21X-RAY DIFFRACTION21chain 'E' and (resid 312 through 384 )E312 - 384
22X-RAY DIFFRACTION22chain 'E' and (resid 385 through 408 )E385 - 408
23X-RAY DIFFRACTION23chain 'E' and (resid 409 through 526 )E409 - 526
24X-RAY DIFFRACTION24chain 'E' and (resid 527 through 586 )E527 - 586
25X-RAY DIFFRACTION25chain 'F' and (resid 243 through 301 )F243 - 301
26X-RAY DIFFRACTION26chain 'F' and (resid 302 through 384 )F302 - 384
27X-RAY DIFFRACTION27chain 'F' and (resid 385 through 411 )F385 - 411
28X-RAY DIFFRACTION28chain 'F' and (resid 412 through 586 )F412 - 586

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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