PDB-6uhh: Crystal Structure of Human RYR Receptor 3 ( 848-1055) in Complex ...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 6uhh

タイトル

Crystal Structure of Human RYR Receptor 3 ( 848-1055) in Complex with ATP

要素

Ryanodine receptor 3

キーワード

METAL TRANSPORT / Type 3 Ryanodine Receptor / Alpha Fold / PSI-BIOLOGY / MCSG / Structural Genomics / Midwest Center for Structural Genomics

機能・相同性

機能・相同性情報

calcium-induced calcium release activity / cellular response to magnesium ion / ryanodine-sensitive calcium-release channel activity / release of sequestered calcium ion into cytosol by sarcoplasmic reticulum / cellular response to ATP / cellular response to caffeine / intracellularly gated calcium channel activity / smooth endoplasmic reticulum / Ion homeostasis / sarcoplasmic reticulum membrane ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 3.138 Å

データ登録者

Wu, R. / Kim, Y. / Jedrzejczak, R. / Joachimiak, A. / Midwest Center for Structural Genomics (MCSG)

引用

ジャーナル: To Be Published
タイトル: Crystal Structure of Human RYR Receptor 3 ( 848-1055) in Complex with ATP
著者: Wu, R. / Kim, Y. / Jedrzejczak, R. / Joachimiak, A.

履歴

登録	2019年9月27日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2020年8月5日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2023年10月11日	Group: Advisory / Data collection ...Advisory / Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
改定 1.2	2023年11月15日	Group: Data collection / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / Item: _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_2
改定 1.3	2024年10月23日	Group: Structure summary カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature Item: _pdbx_entry_details.has_protein_modification

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	6uhh.cif.gz	358.8 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb6uhh.ent.gz	293.3 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	6uhh.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/uh/6uhh ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/uh/6uhh	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	6uhbS S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	3rux-1 6a5w-1 1lqp-d 4oiu-d 3dct-d 3px8-d 4oh6-d 2ao6-d 1lqk-d 5emw-3 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#163 - 2013年7月 HIVカプシド (HIV Capsid) 類似性 (6) #44 - 2003年8月カルモジュリン (Calmodulin) 類似性 (1) #196 - 2016年4月鉛の毒 (Lead Poisoning) 類似性 (1) #28 - 2002年4月炭疽毒素 (Anthrax Toxin) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Ryanodine receptor 3

B: Ryanodine receptor 3

C: Ryanodine receptor 3

D: Ryanodine receptor 3

ヘテロ分子

100 kDa, 4 ポリマー
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1

A: Ryanodine receptor 3

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
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2

B: Ryanodine receptor 3

ヘテロ分子

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3

C: Ryanodine receptor 3

ヘテロ分子

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24.9 kDa, 1 ポリマー
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4

D: Ryanodine receptor 3

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
24.9 kDa, 1 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	62.043, 61.855, 279.128
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

-
タンパク質 , 1種, 4分子 ABCD

#1: タンパク質	Ryanodine receptor 3 / RyR3 / Brain ryanodine receptor-calcium release channel / Brain-type ryanodine receptor / Type 3 ...RyR3 / Brain ryanodine receptor-calcium release channel / Brain-type ryanodine receptor / Type 3 ryanodine receptor 分子量: 24466.447 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: RYR3, HBRR / プラスミド: PLASMID / 詳細 (発現宿主): pMCSG68 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / Variant (発現宿主): Gold / 参照: UniProt: Q15413

#1: タンパク質

Ryanodine receptor 3 / RyR3 / Brain ryanodine receptor-calcium release channel / Brain-type ryanodine receptor / Type 3 ...

分子量: 24466.447 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: RYR3, HBRR / プラスミド: PLASMID / 詳細 (発現宿主): pMCSG68 / 発現宿主:

Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / Variant (発現宿主): Gold / 参照: UniProt: Q15413

-
非ポリマー , 5種, 108分子

#2: 化合物	ChemComp-ATP / ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / ATP 分子量: 507.181 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₆N₅O₁₃P₃ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION / コメント: ATP, エネルギー貯蔵分子*YM
#3: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 13 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#4: 化合物	ChemComp-TRS / 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL / TRIS BUFFER / トリス(ヒドロキシメチル)メチルアンモニウム分子量: 122.143 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄H₁₂NO₃ / コメント: pH緩衝剤*YM
#5: 化合物	ChemComp-PEG / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / ジエチレングリコ-ル分子量: 106.120 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 式: C₄H₁₀O₃
#6: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 91 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
詳細

研究の焦点であるリガンドがあるか	Y
Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.79 Å³/Da / 溶媒含有率: 55.9 %
結晶化	温度: 297 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.5 詳細: 0.1 M Tris:HCl pH 8.5, 20% (w/v) PEG 1000, protein in co-crystallization with 10mM ATP

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

APS

/ ビームライン: 19-ID / 波長: 0.97927 Å

検出器

タイプ: DECTRIS PILATUS3 X 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2016年4月11日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.97927 Å / 相対比: 1

Reflection twin

Operator: k,h,-l / Fraction: 0.16

反射

解像度: 3.138→50 Å / Num. obs: 18902 / % possible obs: 96 % / 冗長度: 3 % / R_merge(I) obs: 0.098 / R_pim(I) all: 0.065 / R_rim(I) all: 0.118 / Χ²: 0.781 / Net I/σ(I): 6.6

反射シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Num. unique obs	CC_1/2	R_pim(I) all	R_rim(I) all	Χ²	% possible all
3.14-3.19	3.1	0.547	919	0.593	0.363	0.66	0.829	97.7
3.19-3.25	3	0.456	982	0.73	0.304	0.551	0.827	97.4
3.25-3.31	2.9	0.377	869	0.764	0.258	0.46	0.773	95.3
3.31-3.38	3	0.291	949	0.835	0.194	0.352	0.759	97.2
3.38-3.46	3.2	0.279	962	0.858	0.181	0.334	0.95	98.6
3.46-3.54	3.2	0.225	940	0.888	0.145	0.269	0.777	99.3
3.54-3.62	3.1	0.191	974	0.893	0.124	0.229	0.773	99.2
3.62-3.72	3.2	0.184	936	0.887	0.12	0.221	0.885	98.8
3.72-3.83	3.1	0.145	966	0.934	0.093	0.174	0.701	98.6
3.83-3.96	3.1	0.139	927	0.939	0.089	0.166	0.8	96.8
3.96-4.1	2.9	0.108	930	0.954	0.069	0.129	0.6	95.1
4.1-4.26	3.1	0.101	931	0.948	0.065	0.121	0.586	96.2
4.26-4.45	3.1	0.093	979	0.963	0.058	0.111	0.604	97.5
4.45-4.69	3.1	0.087	925	0.964	0.055	0.103	0.568	96.4
4.69-4.98	3	0.083	928	0.964	0.054	0.1	0.526	94.9
4.98-5.37	2.9	0.08	937	0.954	0.051	0.096	0.489	94.2
5.37-5.91	3.1	0.076	963	0.958	0.047	0.09	0.797	96
5.91-6.76	3.1	0.075	983	0.962	0.047	0.089	0.9	95.9
6.76-8.51	2.8	0.065	937	0.962	0.042	0.078	0.986	91.3
8.51-50	2.7	0.086	965	0.94	0.061	0.106	1.577	86.1

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.11.1-2575_1309	精密化
SCALEPACK		データスケーリング
PDB_EXTRACT	3.25	データ抽出
HKL-3000		データ削減
HKL-3000		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 6UHB

6uhb

解像度: 3.138→46.521 Å / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 3.66 / 位相誤差: 29.7

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2874	916	5.44 %
R_work	0.233	-	-
obs	0.2372	16849	85.78 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

原子変位パラメータ

B_iso max: 166.94 Å² / B_iso mean: 53.1847 Å² / B_iso min: 0.45 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 3.138→46.521 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	6662	0	152	91	6905
B_iso mean	-	-	72.16	32.23	-
残基数	-	-	-	-	821

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.004	6980
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.838	9443
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.07	1018
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.005	1202
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	16.033	4293

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / R_factor R_free error: 0

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	% reflection obs (%)
3.138-3.3392	0.3903	77	0.2753	1560	49
3.3392-3.5968	0.2922	107	0.2612	2656	83
3.5968-3.9582	0.3061	144	0.2328	2945	92
3.9582-4.5299	0.2964	187	0.208	2898	90
4.5299-5.703	0.277	172	0.2272	2930	89
5.703-34.4638	0.2614	173	0.2328	2963	86

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.7214	0.2134	-0.7371	4.3121	0.2319	0.4791	-0.0708	-0.0213	-0.3309	0.0529	-0.1995	0.3151	0.0859	-0.0847	-0.4658	0.3031	-0.1544	-0.0359	0.0886	-0.0007	0.1295	3.8115	-15.1724	6.905
2	0.9352	0.3926	-1.4235	0.3421	-0.0012	4.0135	-0.0172	0.8429	-0.0452	-0.2551	-0.0942	0.1964	-0.057	-0.5808	0.1408	0.3087	0.0494	-0.0238	0.4873	0.0304	0.2237	8.3239	-4.9395	-16.0659
3	1.0477	0.3186	0.1166	0.9444	-0.5507	1.5414	-0.2933	0.291	-0.1333	-0.6105	0.1991	0.2398	0.588	-0.1104	-0.2069	0.6136	-0.2095	0.204	0.0963	0.0185	0.3841	3.3039	-9.5788	-3.881
4	0.8823	0.2443	0.1467	1.2517	0.1409	1.2535	0.2118	0.0972	0.2717	-0.1424	-0.355	-0.0056	-0.311	-0.3575	0.0698	0.1365	0.1546	0.0603	0.2824	-0.0019	0.459	11.8967	6.3742	-7.8077
5	2.6705	-1.7619	-1.81	6.0751	1.3525	5.606	-0.028	-0.1362	-0.4049	-0.4589	0.1049	0.6259	-0.1177	-0.6723	-0.1233	0.1309	0.0294	-0.0621	0.5235	0.1391	0.1851	14.5156	-14.2761	0.608
6	4.55	2.5696	2.4907	4.8506	2.097	8.2992	0.1255	0.5882	-0.242	-0.8492	-0.1641	0.6575	0.3292	-0.7869	0.1202	0.3472	0.1429	-0.1216	0.5	-0.1066	0.4688	19.0494	-24.4325	-11.0537
7	1.0596	-0.1004	0.3785	2.0776	-0.4815	1.8098	0.0101	-0.4561	0.1636	0.3159	0.2223	-0.0118	-0.3645	0.1331	0.0369	0.1481	-0.0863	-0.0054	0.2602	-0.1038	0.0453	15.8476	-2.0369	0.6202
8	1.0075	0.3711	-0.0006	1.0911	0.477	1.6638	-0.011	-0.4075	-0.0765	0.4643	-0.1267	0.1258	0.464	-0.4432	0.1069	0.3814	-0.0381	0.0344	0.3205	0.0455	0.1505	8.0668	-5.0166	-57.9223
9	1.5344	0.0036	-0.4148	2.936	-3.0453	6.8301	0.0821	-0.7742	0.0558	0.3694	0.1434	0.5607	-0.0626	-0.7751	-0.3723	0.1188	-0.0712	0.1322	0.4526	-0.0351	0.4227	5.8282	-8.9242	-66.6011
10	1.8746	-0.597	-0.1143	1.3993	-0.7614	1.8377	0.0979	0.0271	-0.0932	-0.0816	-0.1371	-0.0557	0.1695	0.1956	0.0049	0.2353	-0.0217	-0.0012	0.225	-0.0907	0.1505	14.6949	0.3548	-64.5775
11	2.5937	0.6108	-0.4734	6.2017	-1.2151	5.7207	0.0391	-0.7103	-0.2558	1.3079	-0.533	0.0906	0.3715	-0.0183	0.3098	0.5663	-0.103	-0.0565	0.4645	0.1352	0.2982	-8.7642	5.6816	-58.6746
12	4.2091	-1.4618	-1.0198	4.3908	1.0244	3.1869	-0.3263	0.1254	0.3659	-0.2855	0.0143	-0.3766	-0.3535	-0.2866	0.0456	0.1621	-0.0192	-0.0111	0.351	0.0837	0.2637	13.175	3.3914	-70.1094
13	1.7287	-0.3063	3.1597	3.5308	0.2158	8.6426	0.0004	-0.0059	-0.4766	-0.1874	-0.3496	-0.2141	0.951	-0.0064	0.2643	0.2425	0.0162	0.0565	0.3943	-0.0005	0.5154	42.5105	-9.0003	-26.9099
14	0.0071	-0.0167	0.0923	0.0376	-0.2086	1.1784	-0.2235	0.1929	0.4181	-0.2049	0.0092	-0.6142	-0.5074	0.3488	0.0704	0.4144	-0.2533	0.111	0.6962	-0.0106	0.8733	47.881	14.3715	-31.3341
15	1.2111	0.0033	1.3629	0.455	-0.429	1.9401	-0.0434	-0.5103	0.2905	0.1979	-0.1138	-0.0133	-0.4568	-0.1152	0.092	0.4899	0.0663	0.2254	1.3589	-0.0925	0.8351	56.3261	14.5776	-30.5742
16	3.7634	0.4966	-1.56	5.6493	0.3149	6.1631	0.2177	-0.1549	0.4403	-0.3882	0.2755	-0.8473	-0.5622	0.8538	-1.2553	0.4279	0.1377	0.0013	0.4164	-0.3208	0.5471	46.1999	-3.2274	-25.3944
17	1.9297	-0.791	-0.0719	1.5851	-0.7794	0.5182	0.2212	0.8826	0.102	-0.8602	-0.1462	-0.1931	-0.1699	0.2598	-0.023	0.7544	-0.2706	0.1427	0.7356	-0.0088	0.2585	36.5464	6.2032	-38.0906
18	1.8807	-0.3881	0.529	5.8804	1.4921	2.9421	0.2178	0.1927	0.3127	0.3977	0.198	-1.1532	-0.162	0.199	-0.1217	0.1149	0.0238	0.1369	0.2679	0.0539	0.2427	41.4873	4.45	-13.3677
19	5.6078	0.3412	-0.5594	4.7813	-1.4982	2.2796	-0.3304	0.156	0.0541	0.4255	0.2384	-0.8889	-0.3426	0.6354	-0.0175	0.3103	-0.0524	-0.077	0.4705	-0.1433	0.2348	46.1117	12.311	-8.54
20	3.6557	2.1298	1.2834	3.6378	0.1164	2.4776	-0.4537	-0.2446	0.0406	0.2084	0.0268	0.2348	-0.1365	-0.332	0.3559	0.3061	0.0847	0.1056	0.3539	-0.0823	0.214	33.2886	4.0485	-26.132
21	3.3034	0.0626	-1.3065	2.9014	-0.0406	6.2931	-0.0132	0.4909	0.5111	-0.403	0.1859	0.1963	-0.186	-0.5818	-0.0726	0.3965	-0.1208	0.0149	0.5104	-0.095	0.3541	6.8675	30.0892	-51.347
22	4.0713	3.003	-1.6398	3.8709	-0.1346	4.3761	0.0872	0.0497	0.3316	0.2192	0.3467	-0.2815	-0.3467	0.283	-0.2599	0.6096	-0.1431	0.1623	0.3878	-0.1933	0.3614	21.427	31.5584	-37.6481
23	3.5295	-0.6542	-0.8248	2.6917	0.6985	2.5155	-0.4257	0.2007	0.2418	-0.3374	0.1553	-0.148	-0.0673	0.0215	0.0442	0.8955	-0.3567	0.1362	0.6038	-0.3359	0.6943	33.6636	40.0276	-40.8482
24	3.3816	4.0449	4.3317	5.5196	5.0225	5.5829	-0.5776	0.5874	-0.2882	-0.6069	0.5667	-0.2377	-0.4662	0.1859	0.1351	0.3797	0.1713	0.1379	0.5589	-0.0027	0.4711	14.1269	33.7975	-45.4546
25	2.331	1.111	1.2848	3.8689	0.8383	0.7262	0.1909	0.2027	-0.4723	1.0204	0.3686	-0.2385	0.2408	-0.2114	-0.4953	0.7325	-0.1894	0.1976	0.7388	-0.0563	0.3854	23.7026	27.0211	-30.7074
26	2.8367	2.3417	-2.331	9.9346	-3.0455	2.1	0.0649	-0.3026	0.05	0.7152	-0.0308	-0.8444	0.6155	0.4093	-0.0272	0.5361	0.1142	-0.0585	0.6133	-0.1067	0.3313	21.8148	16.8775	-34.9087
27	4.2252	2.2145	-1.2371	6.0608	-2.8949	4.532	-0.0375	0.4771	0.3551	-0.2745	-0.2566	0.234	0.3781	-0.3538	0.2112	0.3569	0.0993	0.0643	0.3913	-0.0333	0.1935	17.1141	26.4506	-54.4952
28	3.7626	2.7572	-0.0503	9.1999	-3.9925	2.2202	0.0993	0.4044	0.5022	0.2763	0.2352	-0.691	-0.393	0.56	-0.21	0.486	0.0964	0.1228	0.5177	-0.1631	0.4261	28.4167	33.719	-62.5501
29	2.006	0.4163	0.7461	7.0681	-5.0984	4.2322	-0.0348	0.6048	-0.4115	-0.8082	-0.9042	-0.8015	0.2252	0.5023	0.6155	0.2957	0.0997	-0.0646	0.3448	-0.0604	0.4821	26.1539	22.1322	-50.3826
30	0.1991	-0.1529	0.7712	2.1533	0.8331	3.9967	0.2414	0.1863	-0.1619	0.4343	-0.1141	0.3493	0.3622	-0.7937	0.6797	0.434	-0.1416	0.146	0.4573	-0.2407	0.399	12.3395	18.9477	-39.21

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 851 through 862 )	A	851 - 862
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 863 through 912 )	A	863 - 912
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 913 through 932 )	A	913 - 932
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 933 through 976 )	A	933 - 976
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 977 through 1001 )	A	977 - 1001
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 1002 through 1026 )	A	0
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 1027 through 1054 )	A	0
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 849 through 912 )	B	849 - 912
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 913 through 933 )	B	913 - 933
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 934 through 1000 )	B	934 - 1000
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 1001 through 1026 )	B	0
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 1027 through 1054 )	B	0
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'C' and (resid 852 through 873 )	C	852 - 873
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'C' and (resid 874 through 893 )	C	874 - 893
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'C' and (resid 894 through 912 )	C	894 - 912
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resid 913 through 933 )	C	913 - 933
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'C' and (resid 934 through 976 )	C	934 - 976
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'C' and (resid 977 through 1009 )	C	977 - 1009
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'C' and (resid 1010 through 1026 )	C	0
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resid 1027 through 1053 )	C	0
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'D' and (resid 849 through 865 )	D	849 - 865
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'D' and (resid 866 through 884 )	D	866 - 884
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'D' and (resid 885 through 912 )	D	885 - 912
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'D' and (resid 913 through 933 )	D	913 - 933
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'D' and (resid 934 through 966 )	D	934 - 966
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'D' and (resid 967 through 976 )	D	967 - 976
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'D' and (resid 977 through 1002 )	D	977 - 1002
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'D' and (resid 1003 through 1026 )	D	0
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'D' and (resid 1027 through 1038 )	D	0
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'D' and (resid 1039 through 1055 )	D	0

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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