登録情報 | データベース: PDB / ID: 6tij |
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タイトル | Structure of A. niger Fdc WT in complex with indol-2-carboxylic acid |
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要素 | Ferulic acid decarboxylase 1 |
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キーワード | LIGASE / (de)carboxylase / UbiD / aromatic acid / prFMN |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
styrene metabolic process / aromatic amino acid family catabolic process / phenacrylate decarboxylase / 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase activity / ferulate metabolic process / cinnamic acid catabolic process / ubiquinone biosynthetic process / manganese ion binding / identical protein binding / cytosol類似検索 - 分子機能 UbiD-like decarboxylase/ferulic acid decarboxylase 1 / : / : / : / 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase N-terminal domain / 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase C-terminal domain / UbiD decarboxylyase family / 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase Rift-related domain類似検索 - ドメイン・相同性 hydroxylated prenyl-FMN / 1H-indole-2-carboxylic acid / : / : / Ferulic acid decarboxylase 1類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_fungus.gif) Aspergillus niger (黒麹菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / フーリエ合成 / 解像度: 1.12 Å |
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データ登録者 | Leys, D. |
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資金援助 | 英国, 2件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Biotechnology and Biological Sciences Research Council | BB/K017802 | 英国 | European Research Council | pre-FAB 695013 | 英国 |
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引用 | ジャーナル: Nat.Chem.Biol. / 年: 2020 タイトル: Enzymatic C-H activation of aromatic compounds through CO 2 fixation. 著者: Aleku, G.A. / Saaret, A. / Bradshaw-Allen, R.T. / Derrington, S.R. / Titchiner, G.R. / Gostimskaya, I. / Gahloth, D. / Parker, D.A. / Hay, S. / Leys, D. |
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履歴 | 登録 | 2019年11月22日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2020年6月24日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2020年8月12日 | Group: Database references / Derived calculations カテゴリ: citation / citation_author ...citation / citation_author / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed ..._citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation_author.identifier_ORCID / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id |
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改定 1.2 | 2020年9月30日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / Item: _citation.title |
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改定 1.3 | 2020年10月28日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation_author.identifier_ORCID |
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改定 1.4 | 2024年1月24日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: atom_type / chem_comp_atom ...atom_type / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _atom_type.pdbx_N_electrons / _atom_type.pdbx_scat_Z ..._atom_type.pdbx_N_electrons / _atom_type.pdbx_scat_Z / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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