登録情報 | データベース: PDB / ID: 6ra3 |
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タイトル | Structural basis for recognition and ring-cleavage of the Pseudomonas quinolone signal (PQS) by AqDC in complex with its product |
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要素 | Putative dioxygenase (1H-3-hydroxy-4-oxoquinaldine 2,4-dioxygenase) |
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キーワード | HYDROLASE / dioxygenase / alpha/beta hydrolase fold / catalytic triad / quorum sensing / Pseudomonas quinolone signal / Pseudomonas aeruginosa |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
Uteroglobin - #20 / Uteroglobin / Alpha/Beta hydrolase fold, catalytic domain / Alpha/Beta hydrolase fold / Rossmann fold / Orthogonal Bundle / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 2-(octanoylamino)benzoic acid / Dioxygenase (1H-3-hydroxy-4-oxoquinaldine 2,4-dioxygenase)類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Mycobacteroides abscessus subsp. abscessus (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2 Å |
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データ登録者 | Wullich, S. / Kobus, S. / Smits, S.H. / Fetzner, S. |
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引用 | ジャーナル: J.Struct.Biol. / 年: 2019 タイトル: Structural basis for recognition and ring-cleavage of the Pseudomonas quinolone signal (PQS) by AqdC, a mycobacterial dioxygenase of the alpha / beta-hydrolase fold family. 著者: Wullich, S.C. / Kobus, S. / Wienhold, M. / Hennecke, U. / Smits, S.H.J. / Fetzner, S. |
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履歴 | 登録 | 2019年4月5日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2019年7月3日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2019年9月4日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last |
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改定 1.2 | 2020年1月29日 | Group: Refinement description / カテゴリ: refine_ls_shell / Item: _refine_ls_shell.d_res_low |
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改定 2.0 | 2020年6月24日 | Group: Advisory / Atomic model ...Advisory / Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: atom_site / pdbx_poly_seq_scheme ...atom_site / pdbx_poly_seq_scheme / pdbx_struct_sheet_hbond / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / pdbx_unobs_or_zero_occ_residues / pdbx_validate_close_contact / pdbx_validate_peptide_omega / pdbx_validate_rmsd_angle / pdbx_validate_torsion / struct_conf / struct_mon_prot_cis / struct_ref_seq / struct_sheet_range / struct_site_gen Item: _atom_site.auth_seq_id / _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num ..._atom_site.auth_seq_id / _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id / _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_seq_id / _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id / _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 / _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 / _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_1 / _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_2 / _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 / _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 / _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 / _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id / _struct_conf.beg_auth_seq_id / _struct_conf.end_auth_seq_id / _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id / _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 / _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg / _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end / _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id / _struct_sheet_range.end_auth_seq_id / _struct_site_gen.auth_seq_id |
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改定 2.1 | 2024年1月24日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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