登録情報 | データベース: PDB / ID: 6r9q |
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タイトル | Structure of Saccharomyces cerevisiae apo Pan2 pseudoubiquitin hydrolase-RNA exonuclease (UCH-Exo) module in complex with AACCAA RNA |
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要素 | - AACCAA
- PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2
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キーワード | HYDROLASE / DEDD RNase / deadenylase / pseudoubiquitin hydrolase |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
PAN complex / Deadenylation of mRNA / poly(A)-specific ribonuclease / poly(A)-specific ribonuclease activity / nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening / postreplication repair / P-body / mRNA processing / nucleic acid binding / metal ion binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 PAN2, UCH domain / PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2 / : / : / Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase / PAN2 N-terminal / Exonuclease / Exonuclease, RNase T/DNA polymerase III / EXOIII / Ubiquitin specific protease domain ...PAN2, UCH domain / PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2 / : / : / Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase / PAN2 N-terminal / Exonuclease / Exonuclease, RNase T/DNA polymerase III / EXOIII / Ubiquitin specific protease domain / Ubiquitin specific protease (USP) domain profile. / Cysteine proteinases / Quinoprotein alcohol dehydrogenase-like superfamily / Cathepsin B; Chain A / Papain-like cysteine peptidase superfamily / Ribonuclease H superfamily / Ribonuclease H-like superfamily / WD40/YVTN repeat-like-containing domain superfamily / Alpha-Beta Complex / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 RNA / PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Saccharomyces cerevisiae S288C (パン酵母) Saccharomyces cerevisiae (パン酵母) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 3.079 Å |
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データ登録者 | Tang, T.T.L. / Stowell, J.A.W. / Hill, C.H. / Passmore, L.A. |
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資金援助 | 英国, 2件 組織 | 認可番号 | 国 |
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European Research Council | 725685 | | Medical Research Council (United Kingdom) | MC_U105192715 | 英国 |
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引用 | ジャーナル: Nat.Struct.Mol.Biol. / 年: 2019 タイトル: The intrinsic structure of poly(A) RNA determines the specificity of Pan2 and Caf1 deadenylases. 著者: Tang, T.T.L. / Stowell, J.A.W. / Hill, C.H. / Passmore, L.A. |
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履歴 | 登録 | 2019年4月3日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2019年5月22日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2019年5月29日 | Group: Data collection / Database references カテゴリ: citation / citation_author / pdbx_database_proc Item: _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation_author.identifier_ORCID |
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改定 1.2 | 2019年6月19日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last |
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改定 1.3 | 2019年8月21日 | Group: Data collection / カテゴリ: diffrn_source / Item: _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site |
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改定 1.4 | 2024年1月24日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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