登録情報 | データベース: PDB / ID: 6or4 |
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タイトル | Crystal structure of SpGH29 |
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要素 | Glycoside hydrolase |
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キーワード | HYDROLASE / glycoside hydrolase |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
alpha-L-fucosidase activity / fucose metabolic process / glycoside catabolic process / lysosome / metal ion binding類似検索 - 分子機能 CalX-like domain superfamily / Glycoside hydrolase, family 29 / Alpha-L-fucosidase / Alpha-L-fucosidase / Coagulation factors 5/8 type C domain (FA58C) profile. / Coagulation factor 5/8 C-terminal domain / Galactose-binding-like domain superfamily / Glycoside hydrolase superfamily類似検索 - ドメイン・相同性 Lewis A antigen, beta anomer / F5/8 type C domain-containing protein類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Streptococcus pneumoniae serotype 4 (肺炎レンサ球菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.1 Å |
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データ登録者 | Pluvinage, B. / Boraston, A.B. |
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資金援助 | カナダ, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Canadian Institutes of Health Research (CIHR) | | カナダ |
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引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2019 タイトル: Two complementary alpha-fucosidases fromStreptococcus pneumoniaepromote complete degradation of host-derived carbohydrate antigens. 著者: Hobbs, J.K. / Pluvinage, B. / Robb, M. / Smith, S.P. / Boraston, A.B. |
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履歴 | 登録 | 2019年4月29日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2019年7月10日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2019年7月17日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title |
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改定 1.2 | 2019年9月4日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last |
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改定 1.3 | 2020年1月8日 | Group: Author supporting evidence / Data collection / カテゴリ: chem_comp / pdbx_audit_support Item: _chem_comp.type / _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 2.0 | 2020年7月29日 | Group: Atomic model / Data collection ...Atomic model / Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / struct_asym / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation |
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改定 2.1 | 2020年8月5日 | Group: Derived calculations / Structure summary / カテゴリ: pdbx_molecule_features / struct_conn / Item: _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag |
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改定 2.2 | 2023年10月11日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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