PDB-6lua: Cis-mutant R349A of the central AAA+ domain of the flagellar regu...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 6lua

タイトル

Cis-mutant R349A of the central AAA+ domain of the flagellar regulatory protein FlrC

要素

Flagellar regulatory protein C

キーワード

TRANSCRIPTION / Flagellar gene transcription protein / mutation / Vibrio cholerae

機能・相同性

機能・相同性情報

phosphorelay signal transduction system / sequence-specific DNA binding / regulation of DNA-templated transcription / ATP hydrolysis activity / ATP binding / metal ion binding
類似検索 - 分子機能

生物種

Vibrio cholerae serotype O1 (コレラ菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 3.1 Å

データ登録者

Dasgupta, J. / Chakraborty, S.

引用

ジャーナル: To Be Published
タイトル: Oligomerization of flagellar regulatory protein FlrC is essential for cis-mediated ATP binding while c-di-GMP prefers its monomeric state
著者: Dasgupta, J. / Chakraborty, S.

履歴

登録	2020年1月27日	登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2020年3月18日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2023年11月29日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	6lua.cif.gz	671.6 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb6lua.ent.gz	559.9 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	6lua.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	6lua_validation.pdf.gz	1.8 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	6lua_full_validation.pdf.gz	1.8 MB	表示
XML形式データ	6lua_validation.xml.gz	57.2 KB	表示
CIF形式データ	6lua_validation.cif.gz	76.6 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/lu/6lua ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/lu/6lua	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	6lufC 4qhsS S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	4qhs-d 6luf-d 4qht-d 1vg3-3 1v4h-2 1v4k-2 1vg7-3 1vg6-3 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#190 - 2015年10月 2つの要素で構成される検知・応答系 (Two-component Systems) 類似性 (5) #97 - 2008年1月概日体内時計タンパク質 (Circadian Clock Proteins) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Flagellar regulatory protein C

B: Flagellar regulatory protein C

C: Flagellar regulatory protein C

D: Flagellar regulatory protein C

E: Flagellar regulatory protein C

F: Flagellar regulatory protein C

G: Flagellar regulatory protein C

ヘテロ分子

211 kDa, 7 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者が定義した集合体
根拠: gel filtration

単位格子

Length a, b, c (Å)	80.753, 154.633, 194.598
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

#1: タンパク質	Flagellar regulatory protein C 分子量: 30108.545 Da / 分子数: 7 / 変異: R349A / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Vibrio cholerae serotype O1 (strain ATCC 39541 / Classical Ogawa 395 / O395) (コレラ菌) 株: ATCC 39541 / Classical Ogawa 395 / O395 / 遺伝子: flrC, VC0395_A1719 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: A0A0H3AHP1
#2: 化合物	ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル分子量: 62.068 Da / 分子数: 7 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₆O₂ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 33 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
研究の焦点であるリガンドがあるか	Y

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実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶	マシュー密度: 3.16 Å³/Da / 溶媒含有率: 61.14 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法詳細: 10% (w/v) PEG6000, in 0.1M HEPES (pH 7.0) and 3% Glycerol

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: RRCAT INDUS-2 / ビームライン: PX-BL21 / 波長: 0.979 Å
検出器	タイプ: MARMOSAIC 225 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2019年3月11日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.979 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 3.1→48.65 Å / Num. obs: 45041 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 5.5 % / CC_1/2: 0.992 / R_merge(I) obs: 0.163 / R_pim(I) all: 0.076 / Net I/σ(I): 11.1
反射シェル	解像度: 3.1→3.21 Å / Num. unique obs: 4337 / CC_1/2: 0.738

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.9_1692	精密化
XDS		データ削減
Aimless		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 4QHS

4qhs

解像度: 3.1→48.65 Å / SU ML: 0.38 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 25.34

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2508	1998	4.45 %
R_work	0.1903	-	-
obs	0.193	44941	99.81 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 3.1→48.65 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	13438	0	28	33	13499

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.003	13740
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.573	18573
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	14.051	5227
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.023	2120
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.003	2413

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
3.1-3.1775	0.3574	139	0.2714	2994	X-RAY DIFFRACTION	100
3.1775-3.2634	0.3581	142	0.2678	3028	X-RAY DIFFRACTION	100
3.2634-3.3594	0.3397	141	0.255	3058	X-RAY DIFFRACTION	100
3.3594-3.4678	0.3206	140	0.2352	2993	X-RAY DIFFRACTION	100
3.4678-3.5917	0.3076	142	0.234	3047	X-RAY DIFFRACTION	100
3.5917-3.7355	0.3072	141	0.2057	3043	X-RAY DIFFRACTION	100
3.7355-3.9054	0.2771	141	0.1957	3038	X-RAY DIFFRACTION	100
3.9054-4.1112	0.2293	142	0.1787	3036	X-RAY DIFFRACTION	100
4.1112-4.3686	0.2321	143	0.1718	3075	X-RAY DIFFRACTION	100
4.3686-4.7057	0.1946	144	0.145	3076	X-RAY DIFFRACTION	100
4.7057-5.1788	0.2124	142	0.1586	3074	X-RAY DIFFRACTION	100
5.1788-5.927	0.22	145	0.1756	3107	X-RAY DIFFRACTION	100
5.927-7.4631	0.2609	146	0.1849	3146	X-RAY DIFFRACTION	100
7.4631-48.65	0.1588	150	0.1479	3228	X-RAY DIFFRACTION	98

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	5.6859	2.7596	3.1896	6.3583	-1.5651	5.0003	-0.2889	0.5534	-0.3841	-0.8764	0.4462	0.1239	0.4255	0.1764	-0.1271	0.4369	0.0408	0.0366	0.2661	-0.0269	0.2601	14.8512	61.9648	-42.914
2	3.9737	-1.4494	1.1896	3.2764	-1.62	1.6736	0.0564	-0.0305	-0.0013	0.027	-0.1099	-0.0168	0.1565	0.056	0.0979	0.2229	0.0245	0.0533	0.2652	-0.0337	0.1728	28.3458	58.3593	-27.8989
3	1.0819	0.6463	0.4381	3.3503	2.9249	3.3352	-0.0694	0.2445	0.0316	-0.3017	0.0929	0.0012	0.098	0.167	-0.1199	0.3424	0.0788	-0.009	0.3151	0.0639	0.2392	11.8677	48.9272	-44.5978
4	3.2616	-2.6898	-4.5555	9.7109	1.7525	6.9838	0.1025	0.6573	-0.7306	-0.6621	0.0043	0.3366	0.4886	-0.2035	-0.2349	0.5623	-0.0006	-0.1347	0.4903	-0.1221	0.3297	8.7365	33.8077	-54.9516
5	3.1885	2.9169	-0.898	3.3527	1.3126	6.0697	-0.2164	0.3296	-0.0887	0.183	0.3183	-0.3512	0.743	0.148	-0.0446	0.4087	0.1172	-0.0936	0.2598	-0.0562	0.3714	15.1128	19.9724	-45.0208
6	3.4319	0.0766	0.139	-0.085	0.1854	3.4854	0.1409	-0.0465	0.0293	0.0635	0.0591	-0.0302	0.2546	0.1242	-0.1769	0.3254	0.0599	0.0142	0.1753	-0.0076	0.2704	27.5243	29.5719	-32.4238
7	0.3393	-0.5999	-0.0392	2.6337	-0.1934	0.3545	-0.003	0.1715	0.0334	-0.125	-0.0418	0.0502	0.1023	0.1007	0.0299	0.242	0.0297	-0.027	0.2901	-0.0467	0.26	12.017	8.3094	-36.3293
8	7.7254	-6.3615	-1.8679	8.1587	-0.8491	6.8223	-0.2454	-0.0364	-0.4197	-0.316	0.3887	0.0577	0.0239	-0.0786	-0.2811	0.3844	-0.1139	0.0417	0.2135	-0.1063	0.4328	8.9138	-6.9091	-30.4584
9	6.7728	6.2002	-5.1908	7.605	-6.5035	7.0084	0.1893	-0.0252	-0.2139	-0.0325	-0.4032	0.2282	0.4538	0.2287	0.1466	0.5385	-0.0951	0.0349	0.205	-0.0855	0.3623	12.7569	-12.7402	-13.9137
10	6.9738	-1.4397	-1.2556	5.4275	1.9015	2.9977	-0.0556	-0.2135	-0.3333	0.5489	0.2916	-0.5314	-0.0333	0.4538	-0.0212	0.2998	-0.0729	-0.108	0.2593	0.0042	0.2107	17.1589	-1.4289	-12.7503
11	4.4197	0.4614	0.6526	0.1077	0.5957	2.7767	0.1296	-0.3636	-0.3299	-0.0403	-0.0707	-0.0008	0.0363	-0.0235	-0.0596	0.2453	0.0371	-0.0551	0.2008	0.0448	0.2322	29.6971	3.9702	-8.9979
12	6.2868	1.3781	-0.0404	7.5066	0.1414	3.8475	0.0464	-0.1128	0.1166	0.169	0.0808	0.2834	0.1291	-0.2781	-0.1303	0.2398	0.006	-0.0321	0.2471	-0.0149	0.1588	28.3935	9.3267	-14.1941
13	7.4981	4.2793	-0.1448	4.9486	1.9383	3.0838	-0.395	0.8741	0.0177	-0.5215	0.5673	-0.1221	-0.586	0.0418	-0.1169	0.3612	0.0049	0.0141	0.3036	0.0908	0.1494	32.8056	8.0538	-18.659
14	6.8737	-0.6294	2.7699	7.3244	-0.7026	3.3267	-0.0703	0.6358	-0.2662	0.431	-0.2463	0.6612	-0.4434	-1.0466	0.1531	0.2433	-0.0191	-0.0392	0.3438	0.0017	0.2523	12.6136	11.666	-17.2956
15	1.0404	0.4919	0.6019	0.5746	-1.1056	6.4797	0.1565	0.1578	-0.4657	0.0887	-0.0453	-0.144	0.6391	0.3547	-0.119	0.4388	0.0108	-0.0358	0.2153	-0.0176	0.3604	11.3721	-11.3722	4.193
16	7.3586	-0.2908	2.4336	5.1362	-2.1744	7.7324	-0.4232	-0.7439	-0.2551	-0.0117	0.1024	0.0497	0.9628	-1.2013	0.1312	0.4543	0.0305	-0.013	0.4557	0.0618	0.3169	8.6741	-13.9614	17.0868
17	9.8383	-6.0118	-0.2617	9.5214	5.7702	5.3933	-0.0744	0.2336	0.4789	0.8241	0.3165	-0.2184	0.1239	-0.5341	-0.1387	0.5011	-0.0181	0.0085	0.2681	0.0707	0.2733	12.6209	-4.0685	31.7262
18	2.8545	0.3055	-0.9883	2.063	-0.159	0.0915	-0.0115	-0.2374	0.0614	0.179	-0.1548	-0.1613	0.0826	-0.0233	0.1688	0.3343	-0.058	-0.1045	0.3832	0.0148	0.2118	28.5874	8.2035	21.2088
19	8.8845	-1.3899	2.3829	2.586	-1.3018	1.0272	0.0025	0.031	-0.1427	-0.165	0.0247	0.0598	0.0977	-0.0964	0.0375	0.2931	-0.0165	-0.0247	0.2622	-0.0785	0.1562	22.8321	7.6516	10.661
20	5.64	-4.8198	-4.1968	9.2552	6.2849	4.5278	0.0069	-0.1094	0.0796	1.0339	0.1781	0.2955	0.018	-0.0998	-0.3225	0.4367	-0.0448	0.0454	0.2974	0.0338	0.3352	9.6258	2.9749	26.5069
21	2.8463	1.0785	0.548	2.1962	1.1771	3.2076	-0.0565	-0.1915	-0.1975	-0.167	0.1597	-0.3019	0.2768	-0.0712	-0.1459	0.3141	-0.0147	-0.0104	0.2424	0.1134	0.2194	12.0495	12.7429	45.0135
22	6.397	-2.128	2.54	9.2093	-2.7333	7.1809	-0.6119	-0.0532	-0.299	-0.3806	0.5715	0.4518	0.0129	-0.0843	0.1377	0.4123	0.0534	-0.0044	0.3988	-0.0251	0.1097	8.8362	18.9991	51.2167
23	9.4964	-6.0213	-6.2944	3.8242	4.2757	7.6534	0.2691	0.0114	0.311	0.8935	-0.1024	-0.4473	-0.418	-0.308	-0.0604	0.4331	-0.0175	-0.0295	0.2805	0.0176	0.2629	12.8596	36.3388	53.1067
24	2.7961	0.0272	-2.0774	0.7432	-1.6752	3.4663	0.0832	-0.1826	0.1402	-0.0035	-0.0022	0.1222	-0.0231	0.3243	-0.0293	0.282	-0.079	-0.0299	0.2211	-0.0659	0.2903	28.5095	36.5894	36.6172
25	7.0557	0.6216	0.8514	0.7948	-0.9336	2.0325	-0.0165	0.0741	-0.3755	-0.063	0.0621	0.0543	-0.0438	-0.1499	-0.0353	0.3371	-0.0095	-0.0356	0.2216	-0.0667	0.2136	22.7723	27.7101	30.8302
26	3.1256	-3.2074	1.4769	3.4102	-1.9187	2.0963	-0.2214	0.25	-0.032	0.8313	-0.2654	0.3827	-0.0807	-0.4444	0.2444	0.2721	0.019	-0.0331	0.1954	-0.029	0.3439	9.4053	37.3032	44.2113
27	4.4523	1.78	0.2435	2.7969	1.6795	2.553	-0.0764	-0.2358	-0.1472	0.0354	0.0377	-0.1202	0.3058	-0.034	0.0235	0.2714	-0.0564	0.0313	0.2225	-0.0456	0.141	11.9538	57.6126	48.1968
28	8.7376	5.6329	4.4383	7.6676	3.9446	5.8532	-0.783	0.4632	0.0583	-0.978	0.6833	0.3736	-1.0989	-0.3246	0.1319	0.4056	0.1005	0.0577	0.1057	-0.0169	0.336	8.9696	66.7369	47.3736
29	7.4016	-6.7994	4.6381	9.2375	-6.6172	9.6927	0.1984	0.4952	0.3671	-0.7057	-0.212	-0.8128	-0.6608	-0.4243	-0.0536	0.5749	0.0738	0.016	0.2727	-0.0383	0.3262	12.1622	79.2052	34.4055
30	8.7458	-0.4514	7.9924	3.0987	-0.3163	9.482	0.5066	-0.1739	0.2105	-0.0424	0.0297	-0.6362	-0.4769	-0.8766	-0.3178	0.3535	0.0145	0.1713	0.2806	0.1047	0.17	17.6067	69.3451	30.5985
31	3.568	-1.5284	-2.445	2.6488	3.7246	6.2817	0.2362	0.0501	-0.079	-0.0707	-0.081	-0.3424	-0.1378	-0.1258	-0.1143	0.2113	-0.0131	0.0008	0.1847	0.0477	0.2953	28.4449	67.5996	24.4924
32	2.5269	-2.4779	-1.9229	4.3035	4.3112	4.5007	0.021	0.0944	-0.2386	-0.3355	0.4467	-0.3089	-0.2237	0.2562	-0.4476	0.3258	-0.1201	0.0075	0.3446	-0.0539	0.3197	34.7825	61.8263	22.1161
33	4.4507	1.5654	-2.8916	7.9888	4.8942	7.2862	0.2031	0.2088	0.3727	-0.0583	-0.5653	0.3014	0.7614	0.4026	0.2395	0.1336	-0.0136	-0.0027	0.1834	0.0427	0.2632	23.5174	54.6441	26.0473
34	7.3471	-2.6526	-1.2526	3.0381	1.9904	4.3062	-0.1685	-0.38	-0.5023	0.1385	0.1519	0.3356	0.4811	0.2671	-0.0546	0.3384	-0.0676	0.0001	0.1226	0.0557	0.2653	29.6372	58.5964	28.8773
35	8.4227	3.704	3.8664	5.2693	4.4306	5.9499	-0.0727	-0.762	-0.297	-0.2501	-0.0697	-0.1687	-0.2102	-0.5386	0.0985	0.2523	-0.0086	0.0071	0.3069	0.0462	0.2474	13.0415	54.3754	28.1504
36	0.3579	0.5718	0.4396	6.6485	-4.0613	4.211	-0.2308	-0.0089	-0.0354	-0.0124	-0.1079	-0.4097	-0.7661	-0.0721	0.2532	0.5655	0.0661	0.0008	0.3713	-0.0115	0.2172	11.0352	80.8277	24.6247
37	8.8787	0.5471	3.9594	3.4397	-3.8225	7.2417	0.5168	-0.1299	0.3855	0.2853	-0.6454	0.1692	0.1984	1.722	0.0191	0.5161	-0.0915	0.0334	0.6404	-0.0498	0.5577	20.2784	95.3987	14.4563
38	1.6389	2.0029	-0.4179	3.3926	-1.7816	2.681	0.0293	0.0433	0.3542	-0.202	0.0697	-0.1622	0.0689	-0.0413	-0.0412	0.5525	0.0805	0.1033	0.2216	-0.04	0.298	8.0801	86.2894	12.7468
39	2.9757	4.7961	0.1146	7.9548	-0.8492	7.8738	-0.2693	0.2938	1.0159	-0.6299	-0.0354	0.6024	-1.361	-0.1909	0.2945	0.6478	0.1161	0.023	0.2256	-0.0158	0.6012	8.7363	93.4637	7.653
40	3.4574	-1.8549	-0.0841	2.459	0.4764	-0.0842	0.1429	0.0813	0.0937	-0.1805	-0.1267	-0.148	-0.1146	-0.0294	-0.0106	0.3515	-0.029	0.0462	0.3161	0.0202	0.1555	26.4754	76.1897	-3.4576
41	0.3522	0.1679	-0.0527	0.2855	-0.7451	5.041	-0.0146	-0.0438	0.0915	0.0923	0.1018	0.1723	0.0242	-0.3947	-0.0766	0.2351	0.0754	0.07	0.2992	0.0205	0.244	11.5322	78.7442	-20.3364

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 130 through 165 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 166 through 279 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 280 through 361 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 362 through 376 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'B' and (resid 130 through 165 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'B' and (resid 166 through 285 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resid 286 through 361 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 362 through 376 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'C' and (resid 131 through 150 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'C' and (resid 151 through 165 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'C' and (resid 166 through 211 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'C' and (resid 212 through 249 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'C' and (resid 250 through 271 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'C' and (resid 272 through 292 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'C' and (resid 293 through 361 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resid 362 through 376 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'D' and (resid 131 through 149 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'D' and (resid 150 through 230 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'D' and (resid 231 through 292 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'D' and (resid 293 through 305 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'D' and (resid 306 through 361 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'D' and (resid 362 through 376 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'E' and (resid 131 through 150 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'E' and (resid 151 through 230 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'E' and (resid 231 through 292 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'E' and (resid 293 through 305 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'E' and (resid 306 through 361 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'E' and (resid 362 through 376 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'F' and (resid 131 through 149 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'F' and (resid 150 through 164 )
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'F' and (resid 165 through 205 )
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'F' and (resid 206 through 230 )
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'F' and (resid 231 through 249 )
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'F' and (resid 250 through 274 )
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'F' and (resid 275 through 292 )
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'F' and (resid 293 through 319 )
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'F' and (resid 320 through 332 )
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'F' and (resid 333 through 361 )
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'F' and (resid 362 through 376 )
40	X-RAY DIFFRACTION	40	chain 'G' and (resid 131 through 271 )
41	X-RAY DIFFRACTION	41	chain 'G' and (resid 272 through 376 )

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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