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Open data
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Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 6kvr | ||||||
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Title | Fatty acid amide hydrolase | ||||||
![]() | Fatty acid amide hydrolase | ||||||
![]() | HYDROLASE / fatty acid | ||||||
Function / homology | amidase / indoleacetamide hydrolase activity / Amidase, conserved site / Amidases signature. / Amidase signature domain / Amidase signature (AS) superfamily / Amidase / amidase activity / Amidase![]() | ||||||
Biological species | ![]() | ||||||
Method | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Min, C.A. / Yun, J.S. / Chang, J.H. | ||||||
Funding support | ![]()
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![]() | ![]() Title: Comparison of Candida Albicans Fatty Acid Amide Hydrolase Structure with Homologous Amidase Signature Family Enzymes Authors: Min, C.A. / Yun, J.S. / Choi, E.H. / Hwang, U.W. / Cho, D.H. / Yoon, J.H. / Chang, J.H. | ||||||
History |
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Structure visualization
Structure viewer | Molecule: ![]() ![]() |
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Downloads & links
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Download
PDBx/mmCIF format | ![]() | 293.2 KB | Display | ![]() |
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PDB format | ![]() | 198 KB | Display | ![]() |
PDBx/mmJSON format | ![]() | Tree view | ![]() | |
Others | ![]() |
-Validation report
Summary document | ![]() | 433.7 KB | Display | ![]() |
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Full document | ![]() | 440.4 KB | Display | |
Data in XML | ![]() | 44.9 KB | Display | |
Data in CIF | ![]() | 66.5 KB | Display | |
Arichive directory | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-Related structure data
Similar structure data |
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Links
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Assembly
Deposited unit | ![]()
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1 |
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Unit cell |
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Components
#1: Protein | Mass: 64128.656 Da / Num. of mol.: 2 Source method: isolated from a genetically manipulated source Source: (gene. exp.) ![]() ![]() ![]() #2: Water | ChemComp-HOH / | Has ligand of interest | N | |
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-Experimental details
-Experiment
Experiment | Method: ![]() |
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Sample preparation
Crystal | Density Matthews: 2.27 Å3/Da / Density % sol: 45.78 % |
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Crystal grow | Temperature: 280 K / Method: vapor diffusion, hanging drop Details: 100mM Tris/HCl (pH 8.5), 200mM Lithium sulfate, 30% w/v PEG 4000 |
-Data collection
Diffraction | Mean temperature: 100 K / Serial crystal experiment: N |
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Diffraction source | Source: ![]() ![]() |
Detector | Type: ADSC QUANTUM 270 / Detector: CCD / Date: Apr 2, 2016 |
Radiation | Protocol: MAD / Monochromatic (M) / Laue (L): M / Scattering type: x-ray |
Radiation wavelength | Wavelength: 0.9897 Å / Relative weight: 1 |
Reflection | Resolution: 2.2→50 Å / Num. obs: 58215 / % possible obs: 99.8 % / Redundancy: 7 % / Biso Wilson estimate: 29.83 Å2 / CC1/2: 0.9 / Net I/σ(I): 32.4 |
Reflection shell | Resolution: 2.2→2.28 Å / Num. unique obs: 5814 / CC1/2: 0.899 |
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Processing
Software |
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Refinement | Method to determine structure: ![]() Stereochemistry target values: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2
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Solvent computation | Shrinkage radii: 0.9 Å / VDW probe radii: 1.11 Å / Solvent model: FLAT BULK SOLVENT MODEL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Displacement parameters | Biso mean: 33.5 Å2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Refinement step | Cycle: LAST / Resolution: 2.2→28.11 Å
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Refine LS restraints |
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LS refinement shell |
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