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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6kr0 | ||||||
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タイトル | Crystal structure of HL homo-diabody | ||||||
![]() | HL diabody | ||||||
![]() | IMMUNE SYSTEM / Diabody | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Tanaka, Y. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Association behavior and control of the quality of cancer therapeutic bispecific diabodies expressed in Escherichia coli 著者: Nakazawa, H. / Onodera-Sugano, T. / Sugiyama, A. / Tanaka, Y. / Hattori, T. / Niide, T. / Ogata, H. / Asano, R. / Kumagai, I. / Umetsu, M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 184.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 151.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 453.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 461.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 33.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 46.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: 抗体 | 分子量: 31132.658 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.09 Å3/Da / 溶媒含有率: 41.29 % |
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結晶化 | 温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法 詳細: 0.1 M Tirs-HCl pH 9.0, 0.2 M calcium chloride, 3.25 M sodium formate |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: RAYONIX MX225HE / 検出器: CCD / 日付: 2015年4月9日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.3→45.75 Å / Num. obs: 47159 / % possible obs: 100 % / 冗長度: 7.43 % / Rsym value: 0.058 / Net I/σ(I): 27.85 |
反射 シェル | 解像度: 2.3→2.3 Å / Num. unique obs: 3394 / Rsym value: 0.887 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.3→45.75 Å
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