+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 6jw5 | |||||||||
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Title | RVD Q* recognizes 5hmC through water-mediated H bonds | |||||||||
Components |
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Keywords | DNA BINDING PROTEIN/DNA / methylation TAL effector complex / DNA BINDING PROTEIN-DNA complex | |||||||||
Function / homology | : / TAL effector repeat / TAL effector repeat / DNA / DNA (> 10) / Hax3 Function and homology information | |||||||||
Biological species | Xanthomonas campestris pv. armoraciae (bacteria) synthetic construct (others) | |||||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.99 Å | |||||||||
Authors | Liu, L. / Yi, C. | |||||||||
Funding support | China, 2items
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Citation | Journal: J.Mol.Biol. / Year: 2020 Title: Structural Insights into the Specific Recognition of 5-methylcytosine and 5-hydroxymethylcytosine by TAL Effectors. Authors: Liu, L. / Zhang, Y. / Liu, M. / Wei, W. / Yi, C. / Peng, J. | |||||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 6jw5.cif.gz | 865.7 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb6jw5.ent.gz | 717.3 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 6jw5.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 6jw5_validation.pdf.gz | 512.6 KB | Display | wwPDB validaton report |
---|---|---|---|---|
Full document | 6jw5_full_validation.pdf.gz | 554.6 KB | Display | |
Data in XML | 6jw5_validation.xml.gz | 70.1 KB | Display | |
Data in CIF | 6jw5_validation.cif.gz | 97 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/jw/6jw5 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/jw/6jw5 | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | 6jvzC 6jw0C 6jw1C 6jw2C 6jw3C 6jw4C 4gjpS S: Starting model for refinement C: citing same article (ref.) |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: _ / Refine code: _
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