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Open data
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Basic information
| Entry | Database: PDB / ID: 6jw3 | |||||||||
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| Title | Degenerate RVD RG forms a distinct loop conformation | |||||||||
Components |
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Keywords | DNA BINDING PROTEIN/DNA / methylation TAL effector complex / DNA BINDING PROTEIN-DNA complex | |||||||||
| Function / homology | : / TAL effector repeat / TAL effector repeat / host cell nucleus / extracellular region / DNA / DNA (> 10) / Hax3 Function and homology information | |||||||||
| Biological species | Xanthomonas campestris pv. armoraciae (bacteria)synthetic construct (others) | |||||||||
| Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 3.1 Å | |||||||||
Authors | Liu, L. / Yi, C. | |||||||||
| Funding support | China, 2items
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Citation | Journal: J.Mol.Biol. / Year: 2020Title: Structural Insights into the Specific Recognition of 5-methylcytosine and 5-hydroxymethylcytosine by TAL Effectors. Authors: Liu, L. / Zhang, Y. / Liu, M. / Wei, W. / Yi, C. / Peng, J. | |||||||||
| History |
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Structure visualization
| Structure viewer | Molecule: Molmil Jmol/JSmol |
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Downloads & links
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Download
| PDBx/mmCIF format | 6jw3.cif.gz | 872.2 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
|---|---|---|---|---|
| PDB format | pdb6jw3.ent.gz | 724.8 KB | Display | PDB format |
| PDBx/mmJSON format | 6jw3.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
| Others | Other downloads |
-Validation report
| Summary document | 6jw3_validation.pdf.gz | 516.1 KB | Display | wwPDB validaton report |
|---|---|---|---|---|
| Full document | 6jw3_full_validation.pdf.gz | 549.1 KB | Display | |
| Data in XML | 6jw3_validation.xml.gz | 68.7 KB | Display | |
| Data in CIF | 6jw3_validation.cif.gz | 96 KB | Display | |
| Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/jw/6jw3 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/jw/6jw3 | HTTPS FTP |
-Related structure data
| Related structure data | ![]() 6jvzC ![]() 6jw0C ![]() 6jw1C ![]() 6jw2C ![]() 6jw4C ![]() 6jw5C ![]() 4gjpS S: Starting model for refinement C: citing same article ( |
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| Similar structure data |
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Links
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Assembly
| Deposited unit | ![]()
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| Unit cell |
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| Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: _ / Refine code: _
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Components
About Yorodumi




Xanthomonas campestris pv. armoraciae (bacteria)
X-RAY DIFFRACTION
China, 2items
Citation
















PDBj










































