登録情報 | データベース: PDB / ID: 6gfl |
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タイトル | Crystal structure of the Escherichia coli nucleosidase PpnN (apo form) |
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要素 | Pyrimidine/purine nucleotide 5'-monophosphate nucleosidase |
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キーワード | HYDROLASE / YgdH / PpnN / allosteric enzyme / nucleotide metabolism / stringent response / antibiotic tolerance / persistence / fluoroquinolone |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
inosinate nucleosidase activity / pyrimidine-5'-nucleotide nucleosidase / pyrimidine-5'-nucleotide nucleosidase activity / AMP nucleosidase / AMP nucleosidase activity / 加水分解酵素; 糖加水分解酵素; N-グリコシル化合物加水分解酵素 / guanosine tetraphosphate binding / protein-containing complex / cytosol類似検索 - 分子機能 MCP/YpsA-like / MoCo carrier protein-like / Pyrimidine/purine nucleotide 5'-monophosphate nucleosidase, C-terminal domain / Pyrimidine/purine nucleotide 5'-monophosphate nucleosidase, N-terminal / Pyrimidine/purine nucleotide 5'-monophosphate nucleosidase PpnN-like superfamily / Pyrimidine/purine nucleotide monophosphate nucleosidase, C-terminal / Pyrimidine/purine nucleotide 5'-monophosphate nucleosidases / LOG family / Possible lysine decarboxylase / Rossmann fold - #450 ...MCP/YpsA-like / MoCo carrier protein-like / Pyrimidine/purine nucleotide 5'-monophosphate nucleosidase, C-terminal domain / Pyrimidine/purine nucleotide 5'-monophosphate nucleosidase, N-terminal / Pyrimidine/purine nucleotide 5'-monophosphate nucleosidase PpnN-like superfamily / Pyrimidine/purine nucleotide monophosphate nucleosidase, C-terminal / Pyrimidine/purine nucleotide 5'-monophosphate nucleosidases / LOG family / Possible lysine decarboxylase / Rossmann fold - #450 / Rossmann fold / 2-Layer Sandwich / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Pyrimidine/purine nucleotide 5'-monophosphate nucleosidase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Escherichia coli (大腸菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.48 Å |
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データ登録者 | Zhang, Y. / Baerentsen, R.L. / Gerdes, K. / Brodersen, D.E. |
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資金援助 | デンマーク, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Danish National Research Foundation | DNRF120 | デンマーク |
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引用 | ジャーナル: Mol.Cell / 年: 2019 タイトル: (p)ppGpp Regulates a Bacterial Nucleosidase by an Allosteric Two-Domain Switch. 著者: Zhang, Y.E. / Baerentsen, R.L. / Fuhrer, T. / Sauer, U. / Gerdes, K. / Brodersen, D.E. |
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履歴 | 登録 | 2018年5月1日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2019年4月24日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2019年5月1日 | Group: Data collection / Database references カテゴリ: citation / citation_author / pdbx_database_proc Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.title / _citation.year |
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改定 1.2 | 2019年5月8日 | Group: Data collection / Database references カテゴリ: citation / citation_author / pdbx_database_proc Item: _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title ..._citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation_author.identifier_ORCID / _citation_author.name |
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改定 1.3 | 2019年7月3日 | Group: Data collection / Database references カテゴリ: citation / database_PDB_rev ...citation / database_PDB_rev / database_PDB_rev_record / pdbx_database_proc Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first |
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改定 1.4 | 2019年7月31日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation_author / Item: _citation_author.name |
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改定 1.5 | 2024年1月17日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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