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Yorodumi- PDB-6fog: X-ray structure of homo sapiens Fumarylacetoacetate hydrolase dom... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 6fog | ||||||||||||
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Title | X-ray structure of homo sapiens Fumarylacetoacetate hydrolase domain containing protein 1 (FAHD1) in complex with inhibitor oxalate at 1.94A resolution. | ||||||||||||
Components | Acylpyruvase FAHD1, mitochondrial | ||||||||||||
Keywords | hydrolase/lyase / FAHD 1 / Fumarylacetoacetate hydrolase domain containing protein 1 / oxalate / inhibitor / hydrolase-lyase complex | ||||||||||||
Function / homology | Function and homology information acylpyruvate hydrolase / fumarylpyruvate hydrolase activity / acylpyruvate hydrolase activity / oxaloacetate tautomerase / oxaloacetate tautomerase activity / acetylpyruvate hydrolase activity / oxaloacetate decarboxylase / oxaloacetate decarboxylase activity / oxaloacetate metabolic process / Pyruvate metabolism ...acylpyruvate hydrolase / fumarylpyruvate hydrolase activity / acylpyruvate hydrolase activity / oxaloacetate tautomerase / oxaloacetate tautomerase activity / acetylpyruvate hydrolase activity / oxaloacetate decarboxylase / oxaloacetate decarboxylase activity / oxaloacetate metabolic process / Pyruvate metabolism / pyruvate metabolic process / mitochondrial matrix / mitochondrion / nucleoplasm / metal ion binding / cytosol Similarity search - Function | ||||||||||||
Biological species | Homo sapiens (human) | ||||||||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / Resolution: 1.94 Å | ||||||||||||
Authors | Naschberger, A. / Weiss, A.K.H. | ||||||||||||
Funding support | Austria, 3items
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Citation | Journal: Biochem. J. / Year: 2018 Title: Structural basis for the bi-functionality of human oxaloacetate decarboxylase FAHD1. Authors: Weiss, A.K.H. / Naschberger, A. / Loeffler, J.R. / Gstach, H. / Bowler, M.W. / Holzknecht, M. / Cappuccio, E. / Pittl, A. / Etemad, S. / Dunzendorfer-Matt, T. / Scheffzek, K. / Liedl, K.R. / Jansen-Durr, P. | ||||||||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 6fog.cif.gz | 672.5 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb6fog.ent.gz | 554.2 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 6fog.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 6fog_validation.pdf.gz | 2.9 MB | Display | wwPDB validaton report |
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Full document | 6fog_full_validation.pdf.gz | 2.9 MB | Display | |
Data in XML | 6fog_validation.xml.gz | 67.4 KB | Display | |
Data in CIF | 6fog_validation.cif.gz | 94.8 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/fo/6fog ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/fo/6fog | HTTPS FTP |
-Related structure data
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: _ / Refine code: _
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