登録情報 データベース : PDB / ID : 6fbt 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル The X-ray Structure of Lytic Transglycosylase Slt from Pseudomonas aeruginosa in complex with the reaction product NAG-anhNAMpentapeptide 要素NAG-anhNAMpentapeptide Probable soluble lytic transglycosylase 詳細キーワード LYASE / Lytic Transglycosylase機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds / periplasmic space 類似検索 - 分子機能 Lytic transglycosylase, superhelical linker / Soluble lytic murein transglycosylase L domain / Lytic transglycosylase, superhelical U-shaped / Lytic transglycosylase, superhelical linker domain superfamily / Transglycosylase SLT domain 1 / Transglycosylase SLT domain / Lysozyme-like domain superfamily 類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-AH0 / PHOSPHATE ION / polypeptide(D) / Probable soluble lytic transglycosylase 類似検索 - 構成要素生物種 Pseudomonas aeruginosa (緑膿菌)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.5 Å 詳細データ登録者 Batuecas, M.T. / Dominguez-Gil, T. / Hermoso, J.A. 資金援助 米国, 1件 詳細 詳細を隠す組織 認可番号 国 National Institutes of Health/National Human Genome Research Institute (NIH/NHGRI) AI104987 米国
引用ジャーナル : Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. / 年 : 2018タイトル : Exolytic and endolytic turnover of peptidoglycan by lytic transglycosylase Slt ofPseudomonas aeruginosa.著者 : Lee, M. / Batuecas, M.T. / Tomoshige, S. / Dominguez-Gil, T. / Mahasenan, K.V. / Dik, D.A. / Hesek, D. / Millan, C. / Uson, I. / Lastochkin, E. / Hermoso, J.A. / Mobashery, S. 履歴 登録 2017年12月19日 登録サイト : PDBE / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2018年4月18日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2018年5月2日 Group : Data collection / Database references / カテゴリ : citationItem : _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last改定 1.2 2020年7月29日 Group : Data collection / Derived calculations / Structure summaryカテゴリ : chem_comp / pdbx_chem_comp_identifier ... chem_comp / pdbx_chem_comp_identifier / struct_site / struct_site_gen Item : _chem_comp.name / _chem_comp.type / 解説 : Carbohydrate remediation / Provider : repository / タイプ : Remediation改定 1.3 2022年3月30日 Group : Author supporting evidence / Database references / Structure summaryカテゴリ : chem_comp / database_2 / pdbx_audit_supportItem : _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI ... _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_audit_support.funding_organization 改定 2.0 2022年12月21日 Group : Advisory / Atomic model ... Advisory / Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Polymer sequence / Source and taxonomy / Structure summary カテゴリ : atom_site / entity ... atom_site / entity / entity_name_com / entity_poly / entity_poly_seq / entity_src_gen / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_entity_src_syn / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_poly_seq_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_validate_close_contact / pdbx_validate_polymer_linkage / pdbx_validate_torsion / struct_asym / struct_conn / struct_ref / struct_ref_seq Item : _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ... _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.group_PDB / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.label_seq_id / _atom_site.pdbx_formal_charge / _atom_site.type_symbol / _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code / _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can / _entity_src_gen.pdbx_gene_src_gene / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref.db_code / _struct_ref.pdbx_db_accession / _struct_ref_seq.db_align_beg / _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg / _struct_ref_seq.pdbx_db_accession / _struct_ref_seq.seq_align_end 改定 3.0 2023年11月15日 Group : Advisory / Atomic model ... Advisory / Atomic model / Data collection / Derived calculations カテゴリ : atom_site / chem_comp_atom ... atom_site / chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_validate_close_contact / struct_conn Item : _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id ... _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id / _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id 改定 3.1 2024年1月31日 Group : Refinement description / カテゴリ : pdbx_initial_refinement_model
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