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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6bqo | |||||||||
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タイトル | Structure of a dual topology fluoride channel with monobody S8 | |||||||||
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![]() | MEMBRANE PROTEIN / Fluoride channel / monobody / dual topology | |||||||||
機能・相同性 | ![]() fluoride channel activity / cellular detoxification of fluoride / metal ion binding / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | |||||||||
![]() | Stockbridge, R.B. / Newstead, S. / McIlwain, B.C. | |||||||||
資金援助 | ![]() ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Cork-in-Bottle Occlusion of Fluoride Ion Channels by Crystallization Chaperones. 著者: McIlwain, B.C. / Newstead, S. / Stockbridge, R.B. #1: ![]() タイトル: Structure of fluoride ion channel Fluc-Bpe in complex with monobody S8 著者: McIlwain, B.C. / Newstead, S. / Stockbridge, R.B. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 84.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 61.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 808.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 805.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 15.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 20.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 5nkqS S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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2 | ![]()
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単位格子 |
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要素
-タンパク質 , 2種, 3分子 ABC
#1: タンパク質 | 分子量: 13291.635 Da / 分子数: 2 / 変異: E94C, R29K / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 株: Tohama I / ATCC BAA-589 / NCTC 13251 / 遺伝子: crcB, BP1217 / 発現宿主: ![]() ![]() #2: タンパク質 | | 分子量: 10383.466 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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-非ポリマー , 4種, 53分子 ![](data/chem/img/F.gif)
![](data/chem/img/NA.gif)
![](data/chem/img/OLC.gif)
![](data/chem/img/HOH.gif)
![](data/chem/img/NA.gif)
![](data/chem/img/OLC.gif)
![](data/chem/img/HOH.gif)
#3: 化合物 | #4: 化合物 | ChemComp-NA / | #5: 化合物 | #6: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.25 Å3/Da / 溶媒含有率: 62.12 % |
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結晶化 | 温度: 293 K / 手法: 脂質キュービック相法 / pH: 5 / 詳細: 26% PEG 550MME, 0.1M sodium citrate, pH 5.0 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: DECTRIS PILATUS 6M-F / 検出器: PIXEL / 日付: 2014年10月5日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.98 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.8→27.969 Å / Num. obs: 11986 / % possible obs: 99.56 % / 冗長度: 8.3 % / Net I/σ(I): 11.68 |
反射 シェル | 解像度: 2.8→2.9 Å |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: 5NKQ 解像度: 2.8→27.969 Å / SU ML: 0.45 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 31.14
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.8→27.969 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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