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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6bdc | ||||||
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タイトル | Structure of Hcp1 from Flavobacterium johnsoniae | ||||||
![]() | Hcp1 | ||||||
![]() | PROTEIN TRANSPORT / Type VI secretion / Haemolysin coregulated protein / effector chaperone | ||||||
機能・相同性 | Hemolysin coregulated protein (Hcp) TssD / Hemolysin coregulated protein Hcp (TssD) / type VI protein secretion system complex / : / Uncharacterized protein![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Bohn, A.J. / Russell, A.B. / Robinson, H. / Mougous, J.D. / Whitney, J.C. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structure of Hcp1 from Flavobacterium johnsoniae 著者: Bohn, A.J. / Russell, A.B. / Robinson, H. / Mougous, J.D. / Whitney, J.C. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 57.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 45.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
| x 6||||||||
単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 15856.780 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 株: ATCC 17061 / DSM 2064 / UW101 / 遺伝子: Fjoh_3262 / 発現宿主: ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.4 Å3/Da / 溶媒含有率: 48.73 % |
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結晶化 | 温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: 21% PEG3350, 200mM sodium citrate, 10% glycerol |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K | |||||||||||||||||||||
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() | |||||||||||||||||||||
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2014年4月9日 | |||||||||||||||||||||
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray | |||||||||||||||||||||
放射波長 |
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反射 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.496→41.456 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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精密化 TLS | 手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION
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精密化 TLSグループ |
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