PDB-6aud: PI3K-gamma K802T in complex with Cpd 8 10-((1-(tert-butyl)piperid...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 6aud

タイトル

PI3K-gamma K802T in complex with Cpd 8 10-((1-(tert-butyl)piperidin-4-yl)sulfinyl)-2-(1-isopropyl-1H-1,2,4-triazol-5-yl)-5,6-dihydrobenzo[f]imidazo[1,2-d][1,4]oxazepine

要素

Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma isoform

キーワード

TRANSFERASE/TRANSFERASE INHBITOR / p110 delta / SBDD / TRANSFERASE-TRANSFERASE INHBITOR complex

機能・相同性

機能・相同性情報

secretory granule localization / negative regulation of triglyceride catabolic process / natural killer cell chemotaxis / neutrophil extravasation / phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase / positive regulation of acute inflammatory response / respiratory burst involved in defense response / negative regulation of cardiac muscle contraction / regulation of calcium ion transmembrane transport / T cell chemotaxis ...secretory granule localization / negative regulation of triglyceride catabolic process / natural killer cell chemotaxis / neutrophil extravasation / phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase / positive regulation of acute inflammatory response / respiratory burst involved in defense response / negative regulation of cardiac muscle contraction / regulation of calcium ion transmembrane transport / T cell chemotaxis / negative regulation of fibroblast apoptotic process / phosphatidylinositol 3-kinase complex, class IB / sphingosine-1-phosphate receptor signaling pathway / phosphatidylinositol 3-kinase complex, class IA / dendritic cell chemotaxis / 1-phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase activity / 1-phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase activity / phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase / phosphatidylinositol 3-kinase / phosphatidylinositol-3-phosphate biosynthetic process / 1-phosphatidylinositol-3-kinase activity / mast cell degranulation / Erythropoietin activates Phosphoinositide-3-kinase (PI3K) / hepatocyte apoptotic process / positive regulation of Rac protein signal transduction / regulation of cell adhesion mediated by integrin / Synthesis of PIPs at the plasma membrane / phosphatidylinositol-mediated signaling / phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process / regulation of angiogenesis / T cell proliferation / cellular response to cAMP / GPVI-mediated activation cascade / T cell activation / ephrin receptor binding / positive regulation of endothelial cell migration / phosphatidylinositol 3-kinase/protein kinase B signal transduction / neutrophil chemotaxis / positive regulation of cytokine production / positive regulation of MAP kinase activity / platelet aggregation / endocytosis / G beta:gamma signalling through PI3Kgamma / Signaling by CSF1 (M-CSF) in myeloid cells / kinase activity / positive regulation of cytosolic calcium ion concentration / angiogenesis / adaptive immune response / positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase/protein kinase B signal transduction / non-specific serine/threonine protein kinase / protein kinase activity / inflammatory response / phosphorylation / immune response / G protein-coupled receptor signaling pathway / innate immune response / protein serine kinase activity / protein serine/threonine kinase activity / ATP binding / identical protein binding / membrane / plasma membrane / cytoplasm / cytosol
類似検索 - 分子機能

PIK3 catalytic subunit gamma, adaptor-binding domain / PIK3 catalytic subunit gamma adaptor-binding domain / Phosphatidylinositol 3-/4-kinase, catalytic domain / Phosphatidylinositol 3-kinase, accessory domain (PIK) / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 4 / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 4 / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, Domain 5 / C2 domain / Phosphatidylinositol 3-kinase, adaptor-binding domain / Phosphatidylinositol 3-kinase adaptor-binding (PI3K ABD) domain profile. ...PIK3 catalytic subunit gamma, adaptor-binding domain / PIK3 catalytic subunit gamma adaptor-binding domain / Phosphatidylinositol 3-/4-kinase, catalytic domain / Phosphatidylinositol 3-kinase, accessory domain (PIK) / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 4 / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 4 / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, Domain 5 / C2 domain / Phosphatidylinositol 3-kinase, adaptor-binding domain / Phosphatidylinositol 3-kinase adaptor-binding (PI3K ABD) domain profile. / PI3-kinase family, Ras-binding domain / Phosphatidylinositol 3-kinase Ras-binding (PI3K RBD) domain / PI3-kinase family, ras-binding domain / Phosphatidylinositol 3-kinase Ras-binding (PI3K RBD) domain profile. / Phosphoinositide 3-kinase C2 / Phosphoinositide 3-kinase, region postulated to contain C2 domain / C2 phosphatidylinositol 3-kinase-type domain / C2 phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K)-type domain profile. / Phosphoinositide 3-kinase, accessory (PIK) domain superfamily / Phosphoinositide 3-kinase family, accessory domain (PIK domain) / Phosphoinositide 3-kinase family, accessory domain (PIK domain) / Phosphoinositide 3-kinase, accessory (PIK) domain / Phosphatidylinositol kinase / PIK helical domain profile. / Phosphatidylinositol 3- and 4-kinases signature 1. / Phosphatidylinositol 3/4-kinase, conserved site / Phosphatidylinositol 3- and 4-kinases signature 2. / Phosphatidylinositol 3-/4-kinase, catalytic domain superfamily / Phosphoinositide 3-kinase, catalytic domain / Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase / Phosphatidylinositol 3- and 4-kinases catalytic domain profile. / Phosphatidylinositol 3-/4-kinase, catalytic domain / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1 / C2 domain superfamily / Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat / Ubiquitin-like (UB roll) / Alpha Horseshoe / Armadillo-type fold / Ubiquitin-like domain superfamily / Roll / Protein kinase-like domain superfamily / Immunoglobulin-like / Sandwich / 2-Layer Sandwich / Orthogonal Bundle / Mainly Beta / Mainly Alpha / Alpha Beta
類似検索 - ドメイン・相同性

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.015 Å

データ登録者

Murray, J.M. / Ultsch, M.

引用

ジャーナル: ACS Med Chem Lett / 年: 2017
タイトル: Design of Selective Benzoxazepin PI3K delta Inhibitors Through Control of Dihedral Angles.
著者: Safina, B.S. / Elliott, R.L. / Forrest, A.K. / Heald, R.A. / Murray, J.M. / Nonomiya, J. / Pang, J. / Salphati, L. / Seward, E.M. / Staben, S.T. / Ultsch, M. / Wei, B. / Yang, W. / Sutherlin, D.P.

履歴

登録	2017年8月31日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2017年11月15日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2023年10月4日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	6aud.cif.gz	364.5 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb6aud.ent.gz	292.2 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	6aud.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	6aud_validation.pdf.gz	740.5 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	6aud_full_validation.pdf.gz	749.4 KB	表示
XML形式データ	6aud_validation.xml.gz	32.8 KB	表示
CIF形式データ	6aud_validation.cif.gz	47.5 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/au/6aud ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/au/6aud	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	3r7rS S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	3dbs-d 3r7q-d 4anx-d 4ezj-d 3l08-d 4xx5-d 1e90-d 3qaq-d 1e8x-d 3l54-d 4ezk-d 3nzu-d 3r7r-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#148 - 2012年4月 Rasタンパク質 (Ras Protein) 類似性 (35) #245 - 2020年5月スプライソソーム (Spliceosomes) 類似性 (1) #196 - 2016年4月鉛の毒 (Lead Poisoning) 類似性 (1) #239 - 2019年11月ホスホリパーゼA2 (Phospholipase A2) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma isoform

ヘテロ分子

111 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: gel filtration

単位格子

Length a, b, c (Å)	139.051, 66.065, 102.492
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 98.06, 90.00
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121

Components on special symmetry positions

ID	モデル	要素
1	1	A-1557- HOH
2	1	A-1589- HOH

詳細

Monomer as determined bygel filtration

#1: タンパク質	Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma isoform / PtdIns-3-kinase subunit gamma / Phosphatidylinositol 4 / 5-bisphosphate 3-kinase 110 kDa catalytic ...PtdIns-3-kinase subunit gamma / Phosphatidylinositol 4 / 5-bisphosphate 3-kinase 110 kDa catalytic subunit gamma / p110gamma / Phosphoinositide-3-kinase catalytic gamma polypeptide / Serine/threonine protein kinase PIK3CG / p120-PI3K 分子量: 110699.023 Da / 分子数: 1 / 断片: p110 gamma, residues 144-1102 / 変異: K802T / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: PIK3CG 発現宿主: Spodoptera frugiperda (ツマジロクサヨトウ) 参照: UniProt: P48736, phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase, non-specific serine/threonine protein kinase
#2: 化合物	ChemComp-BWY / 10-[(S)-(1-tert-butylpiperidin-4-yl)sulfinyl]-2-[1-(propan-2-yl)-1H-1,2,4-triazol-5-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepine 分子量: 482.641 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₅H₃₄N₆O₂S
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 290 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.41 Å³/Da / 溶媒含有率: 48.89 % / Mosaicity: 1.255 °
結晶化	温度: 289 K / 手法: 蒸気拡散法 / pH: 8.5 / 詳細: PEG 3350, 0.2M NH4SO4, 0.1M Tris-HCl 8.5

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

APS

/ ビームライン: 22-BM / 波長: 0.999 Å

検出器

タイプ: MACSCIENCE / 検出器: CCD / 日付: 2010年8月21日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.999 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2→50 Å / Num. obs: 60464 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 3.6 % / B_iso Wilson estimate: 33.06 Å² / R_merge(I) obs: 0.063 / Χ²: 1.028 / Net I/σ(I): 11.6

反射シェル

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Num. unique obs	Χ²	Diffraction-ID	% possible all
2-2.07	3.5	0.555	5993	1.016	1	100
2.07-2.15	3.5	0.404	6006	1.042	1	100
2.15-2.25	3.5	0.313	6030	1.049	1	100
2.25-2.37	3.5	0.223	6040	1.041	1	100
2.37-2.52	3.5	0.17	6021	1.025	1	100
2.52-2.71	3.6	0.122	6035	1.033	1	100
2.71-2.99	3.7	0.085	6035	1.023	1	100
2.99-3.42	3.7	0.06	6066	1.02	1	99.9
3.42-4.31	3.7	0.048	6076	1.014	1	99.9
4.31-50	3.7	0.036	6162	1.019	1	99.3

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	(1.12-2829_final)	精密化
DENZO		データ削減
SCALEPACK		データスケーリング
PDB_EXTRACT	3.22	データ抽出
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 3r7r

3r7r

解像度: 2.015→28.119 Å / SU ML: 0.23 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 25.36 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2331	3017	4.99 %
R_work	0.2027	-	-
obs	0.2043	60446	99.09 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.015→28.119 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	6796	0	34	290	7120

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.002	6983
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.593	9454
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	16.218	4199
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.042	1062
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.004	1196

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.0149-2.0463	0.309	111	0.2804	2102	X-RAY DIFFRACTION	82
2.0463-2.0799	0.319	131	0.2667	2664	X-RAY DIFFRACTION	100
2.0799-2.1157	0.2637	139	0.2598	2584	X-RAY DIFFRACTION	100
2.1157-2.1542	0.2644	140	0.2515	2602	X-RAY DIFFRACTION	100
2.1542-2.1956	0.2992	129	0.2471	2665	X-RAY DIFFRACTION	100
2.1956-2.2404	0.2671	135	0.2501	2581	X-RAY DIFFRACTION	100
2.2404-2.2891	0.3057	137	0.2381	2645	X-RAY DIFFRACTION	100
2.2891-2.3423	0.2813	139	0.2232	2621	X-RAY DIFFRACTION	100
2.3423-2.4009	0.2785	123	0.2266	2653	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4009-2.4657	0.2879	143	0.2316	2589	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4657-2.5382	0.2592	142	0.2293	2641	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5382-2.6201	0.2915	128	0.2291	2625	X-RAY DIFFRACTION	100
2.6201-2.7137	0.2837	124	0.2278	2645	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7137-2.8222	0.2799	152	0.2294	2595	X-RAY DIFFRACTION	100
2.8222-2.9506	0.2262	141	0.2261	2640	X-RAY DIFFRACTION	100
2.9506-3.1059	0.2622	151	0.2259	2642	X-RAY DIFFRACTION	100
3.1059-3.3002	0.2439	125	0.212	2644	X-RAY DIFFRACTION	100
3.3002-3.5546	0.2346	149	0.1967	2609	X-RAY DIFFRACTION	100
3.5546-3.9115	0.2105	136	0.1761	2676	X-RAY DIFFRACTION	100
3.9115-4.4755	0.1849	160	0.166	2628	X-RAY DIFFRACTION	100
4.4755-5.6312	0.1999	142	0.1674	2648	X-RAY DIFFRACTION	100
5.6312-28.1214	0.1945	140	0.1796	2730	X-RAY DIFFRACTION	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.5933	-0.4619	0.179	0.7651	0.2285	0.4692	0.0994	0.5107	-0.3895	-0.2409	-0.014	0.0321	0.4207	0.1279	0.0016	0.4332	0.038	-0.0412	0.3918	-0.017	0.3738	33.6206	-38.2775	7.721
2	2.1607	0.0982	0.615	1.953	-0.5508	2.1779	0.1327	-0.4345	-0.0345	0.2055	0.0401	0.3534	-0.0779	-0.7603	0.0139	0.3197	-0.0331	0.0803	0.5244	0.1112	0.4527	6.0114	-33.0973	32.4045
3	3.1376	0.2462	0.0162	0.7172	-0.2898	2.5899	0.0534	-0.2633	0.101	0.0722	-0.0565	0.0639	-0.0697	0.3311	-0.0001	0.2231	0.025	-0.0077	0.2808	-0.0397	0.218	60.2157	-22.873	12.1194
4	1.559	0.4464	-0.1583	0.4133	0.4737	0.9086	0.0028	-0.1897	-0.0306	-0.2121	-0.0536	0.2426	0.2706	0.1116	-0.0139	0.3542	0.0397	0.0487	0.3423	0.0206	0.2886	52.8618	-25.5946	10.2434
5	2.238	-0.2134	1.5525	0.1613	-0.1448	1.4775	0.0134	-0.3163	-0.1045	0.0715	0.01	-0.0482	0.0395	0.0015	0	0.2703	0.0357	0.0004	0.2854	0.0305	0.2814	41.8489	-30.7099	31.5402
6	1.5016	-1.3744	0.6186	2.0334	-0.8162	1.4914	-0.0257	0.1857	0.1006	-0.2487	0.0413	0.056	-0.2002	-0.0939	0.0004	0.3479	0.0067	-0.0299	0.3088	0.0328	0.3323	14.0051	-14.444	8.8709
7	0.7556	-0.008	0.4869	0.7883	0.3958	0.4514	-0.0876	0.0763	-0.2321	0.3863	-0.0608	0.1867	0.0662	0.0052	-0	0.3578	0.0563	0.0408	0.267	0.0196	0.2927	24.8379	-15.9339	32.5812
8	0.1295	-0.0694	0.1672	0.2189	0.0184	0.2125	-0.0503	0.1281	0.2697	-0.3596	0.1298	-0.2965	0.0072	0.4546	0	0.3175	0.0508	0.0232	0.2536	0.0195	0.3165	22.9547	-14.5983	16.2317
9	2.0161	-0.9143	0.3258	2.1889	-0.6019	2.0447	-0.0416	-0.1668	0.3078	0.23	0.0441	-0.2112	-0.3431	0.074	-0.002	0.3437	0.0143	-0.0046	0.264	-0.0245	0.2748	24.6445	-1.9535	35.3057

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	(chain A and resid 144:190)
2	X-RAY DIFFRACTION	2	(chain A and resid 191:321)
3	X-RAY DIFFRACTION	3	(chain A and resid 350:488)
4	X-RAY DIFFRACTION	4	(chain A and resid 495:533)
5	X-RAY DIFFRACTION	5	(chain A and resid 544:725)
6	X-RAY DIFFRACTION	6	(chain A and resid 726:836)
7	X-RAY DIFFRACTION	7	(chain A and resid 837:866)
8	X-RAY DIFFRACTION	8	(chain A and resid 867:881)
9	X-RAY DIFFRACTION	9	(chain A and resid 882:1090)

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)