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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 5z8b | ||||||
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タイトル | Truncated N-acetylglucosaminyl transferase KfiA from E. coli K5 strain apo form | ||||||
![]() | KfiA protein | ||||||
![]() | TRANSFERASE / Glycosyltransferase | ||||||
機能・相同性 | Nucleotide-diphospho-sugar transferases / KfiA protein![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Hori, H. / Kakuta, Y. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crysta structure of N-acetylglucosaminyl transferase KfiA from E. coli K5 strain 著者: Hori, H. / Kakuta, Y. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 94.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 71.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 436.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 438.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 16 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 21.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 27774.979 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: KfiA, kfiA, A4T40_20310, A9X62_20115, APT94_25675, CCL28_04130, CT143_12180, CT144_09435, CUB98_02030, CUB99_17445, SM09_03227 発現宿主: ![]() 参照: UniProt: Q47332 #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.81 Å3/Da / 溶媒含有率: 31.88 % |
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結晶化 | 温度: 293.15 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / 詳細: PEG 3350 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 210r / 検出器: CCD / 日付: 2009年10月19日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.91→73.71 Å / Num. obs: 16958 / % possible obs: 99.5 % / 冗長度: 3.8 % / Net I/σ(I): 8.9 |
反射 シェル | 解像度: 2.91→3.08 Å |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 35.122 Å2
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精密化ステップ | サイクル: 1 / 解像度: 2.91→73.71 Å
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拘束条件 |
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