登録情報 | データベース: PDB / ID: 5wr6 |
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タイトル | Thermolysin, liganded form with cryo condition 2 |
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要素 | Thermolysin |
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キーワード | HYDROLASE / X-ray free-electron laser / Serial femtosecond crystallography / Microcrystal / Structure-based drug design |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
thermolysin / metalloendopeptidase activity / proteolysis / extracellular region / metal ion binding類似検索 - 分子機能 Elastase; domain 1 - #10 / Elastase; domain 1 / : / PepSY domain / Peptidase propeptide and YPEB domain / Peptidase M4, C-terminal / FTP domain / Peptidase M4 domain / Peptidase M4 / Thermolysin metallopeptidase, catalytic domain ...Elastase; domain 1 - #10 / Elastase; domain 1 / : / PepSY domain / Peptidase propeptide and YPEB domain / Peptidase M4, C-terminal / FTP domain / Peptidase M4 domain / Peptidase M4 / Thermolysin metallopeptidase, catalytic domain / Thermolysin metallopeptidase, alpha-helical domain / Fungalysin/Thermolysin Propeptide Motif / Neutral Protease Domain 2 / Neutral Protease; domain 2 / Peptidase M4/M1, CTD superfamily / Neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding region signature. / Roll / Orthogonal Bundle / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-aspartic acid / Thermolysin類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Geobacillus stearothermophilus (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.3 Å |
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データ登録者 | Kunishima, N. / Naitow, H. / Matsuura, Y. |
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引用 | ジャーナル: Acta Crystallogr D Struct Biol / 年: 2017 タイトル: Protein-ligand complex structure from serial femtosecond crystallography using soaked thermolysin microcrystals and comparison with structures from synchrotron radiation 著者: Naitow, H. / Matsuura, Y. / Tono, K. / Joti, Y. / Kameshima, T. / Hatsui, T. / Yabashi, M. / Tanaka, R. / Tanaka, T. / Sugahara, M. / Kobayashi, J. / Nango, E. / Iwata, S. / Kunishima, N. |
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履歴 | 登録 | 2016年11月29日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2017年8月16日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2023年11月8日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id |
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