PDB-5whu: Crystal structure of 3'SL bound ArtB

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5whu

タイトル

Crystal structure of 3'SL bound ArtB

要素

ArtB protein

キーワード

TOXIN / bacterial toxin / glycan

機能・相同性

機能・相同性情報

metal ion binding
類似検索 - 分子機能

生物種

Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT104 (サルモネラ菌)

手法

X線回折 /

分子置換 / 解像度: 2.2 Å

データ登録者

Gao, X. / Galan, J.E.

引用

ジャーナル: Nat Microbiol / 年: 2017
タイトル: Evolution of host adaptation in the Salmonella typhoid toxin.
著者: Gao, X. / Deng, L. / Stack, G. / Yu, H. / Chen, X. / Naito-Matsui, Y. / Varki, A. / Galan, J.E.

履歴

登録	2017年7月18日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2017年10月25日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2017年12月6日	Group: Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last
改定 1.2	2020年6月24日	Group: Data collection / Derived calculations カテゴリ: chem_comp / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _chem_comp.type
改定 2.0	2020年7月29日	Group: Atomic model / Data collection ...Atomic model / Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / entity / entity_name_com / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_molecule_features / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_struct_special_symmetry / struct_asym / struct_conn / struct_conn_type / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.name / _entity.formula_weight / _entity.pdbx_description / _entity.pdbx_number_of_molecules / _entity.src_method / _entity.type / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _pdbx_struct_special_symmetry.label_asym_id / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn_type.id 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation
改定 2.1	2023年10月4日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI ..._chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag
改定 2.2	2024年10月30日	Group: Structure summary カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5whu.cif.gz	516.6 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5whu.ent.gz	430.1 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5whu.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	5whu_validation.pdf.gz	3.5 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	5whu_full_validation.pdf.gz	3.5 MB	表示
XML形式データ	5whu_validation.xml.gz	55.8 KB	表示
CIF形式データ	5whu_validation.cif.gz	74.5 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/wh/5whu ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/wh/5whu	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	5whtC 5whvC 4rhrS S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	5whv-1 6ppn-1 6ppv-d 6p4m-d 6tyn-d 6p4t-d 6ppq-d 6tyo-d 4xq3-d 6p4q-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#69 - 2005年9月コレラ毒素 (Cholera Toxin) 類似性 (1) #113 - 2009年5月インフルエンザノイラミニダーゼ (Influenza Neuraminidase) 類似性 (1)

登録構造単位

A: ArtB protein

B: ArtB protein

C: ArtB protein

D: ArtB protein

E: ArtB protein

F: ArtB protein

G: ArtB protein

H: ArtB protein

I: ArtB protein

J: ArtB protein

ヘテロ分子

178 kDa, 10 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: ArtB protein

B: ArtB protein

C: ArtB protein

D: ArtB protein

E: ArtB protein

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: homology
89.1 kDa, 5 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

F: ArtB protein

G: ArtB protein

H: ArtB protein

I: ArtB protein

J: ArtB protein

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
89.3 kDa, 5 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	137.915, 94.213, 123.964
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 102.60, 90.00
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121

Components on special symmetry positions

ID	モデル	要素
1	1	B-342- HOH
2	1	H-348- HOH

-
タンパク質 , 1種, 10分子 ABCDEFGHIJ

#1: タンパク質	ArtB protein / Subtilase cytotoxin subunit B-like protein 分子量: 16910.010 Da / 分子数: 10 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT104 (サルモネラ菌) 遺伝子: ArtB, ERS157243_04891 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: Q404H3

-
糖 , 3種, 10分子

#2: 多糖

N-acetyl-alpha-neuraminic acid-(2-3)-beta-D-galactopyranose

タイプ: oligosaccharide / 分子量: 471.411 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現

記述子	タイプ	プログラム
DNeup5Aca2-3DGalpb1-ROH	Glycam Condensed Sequence	GMML 1.0
WURCS=2.0/2,2,1/[a2112h-1b_1-5][Aad21122h-2a_2-6_5*NCC/3=O]/1-2/a3-b2	WURCS	PDB2Glycan 1.1.0
[][b-D-Galp]{[(3+2)][a-D-Neup5Ac]{}}	LINUCS	PDB-CARE

#3: 多糖

N-acetyl-alpha-neuraminic acid-(2-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose / 3'-sialyl-alpha-lactose

タイプ: oligosaccharide, Oligosaccharide / クラス: 栄養素 / 分子量: 633.552 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: oligosaccharide / 参照: 3'-sialyl-alpha-lactose

記述子	タイプ	プログラム
DNeup5Aca2-3DGalpb1-4DGlcpa1-ROH	Glycam Condensed Sequence	GMML 1.0
WURCS=2.0/3,3,2/[a2122h-1a_1-5][a2112h-1b_1-5][Aad21122h-2a_2-6_5*NCC/3=O]/1-2-3/a4-b1_b3-c2	WURCS	PDB2Glycan 1.1.0
[][a-D-Glcp]{[(4+1)][b-D-Galp]{[(3+2)][a-D-Neup5Ac]{}}}	LINUCS	PDB-CARE

#4: 糖

ChemComp-SIA / N-acetyl-alpha-neuraminic acid / N-acetylneuraminic acid / sialic acid / alpha-sialic acid / O-SIALIC ACID / N-アセチル-α-ノイラミン酸

タイプ: D-saccharide, alpha linking / 分子量: 309.270 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₁H₁₉NO₉

識別子	タイプ	プログラム
DNeup5Aca	CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0
N-acetyl-a-D-neuraminic acid	COMMON NAME	GMML 1.0
a-D-Neup5Ac	IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	PDB-CARE 1.0
Neu5Ac	SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0

-
非ポリマー , 6種, 527分子

#5: 化合物	ChemComp-PEG / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / ジエチレングリコ-ル分子量: 106.120 Da / 分子数: 12 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄H₁₀O₃
#6: 化合物	... ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド分子量: 35.453 Da / 分子数: 23 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#7: 化合物	ChemComp-MES / 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID / 2-モルホリノエタンスルホン酸分子量: 195.237 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₆H₁₃NO₄S / コメント: pH緩衝剤*YM
#8: 化合物	ChemComp-TRS / 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL / TRIS BUFFER / トリス(ヒドロキシメチル)メチルアンモニウム分子量: 122.143 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄H₁₂NO₃ / コメント: pH緩衝剤*YM
#9: 化合物	ChemComp-CA / CALCIUM ION / カルシウムジカチオン分子量: 40.078 Da / 分子数: 7 / 由来タイプ: 合成 / 式: Ca
#10: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 477 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
詳細

Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶	マシュー密度: 2.47 Å³/Da / 溶媒含有率: 50.25 %
結晶化	温度: 297 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 5.5 / 詳細: PEG 200, calcium chloride

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: 回転陽極 / タイプ: RIGAKU / 波長: 1.5418 Å
検出器	タイプ: RIGAKU SATURN 944 / 検出器: CCD / 日付: 2015年2月18日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1.5418 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.2→50 Å / Num. obs: 77088 / % possible obs: 98.02 % / 冗長度: 3.1 % / Net I/σ(I): 8.5

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.8.1_1168	精密化
HKL-2000		データ収集
HKL-2000		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 4RHR

4rhr

解像度: 2.2→50 Å / SU ML: 0.26 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.33 / 位相誤差: 25.54

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2302	3848	5.01 %
R_work	0.1738	-	-
obs	0.1767	76839	97.7 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.2→50 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	9505	0	577	477	10559

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.007	10327
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.109	13974
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	18.141	3679
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.071	1537
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.004	1747

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.2-2.2279	0.2766	123	0.2368	2570	X-RAY DIFFRACTION	94
2.2279-2.2572	0.2931	140	0.2285	2612	X-RAY DIFFRACTION	94
2.2572-2.2881	0.2836	127	0.2259	2615	X-RAY DIFFRACTION	95
2.2881-2.3208	0.2806	131	0.2249	2662	X-RAY DIFFRACTION	95
2.3208-2.3554	0.2997	134	0.2174	2632	X-RAY DIFFRACTION	95
2.3554-2.3922	0.3059	143	0.2117	2642	X-RAY DIFFRACTION	96
2.3922-2.4315	0.2654	133	0.2142	2646	X-RAY DIFFRACTION	97
2.4315-2.4734	0.2894	140	0.214	2696	X-RAY DIFFRACTION	97
2.4734-2.5184	0.295	125	0.2101	2694	X-RAY DIFFRACTION	98
2.5184-2.5668	0.3018	136	0.2151	2674	X-RAY DIFFRACTION	97
2.5668-2.6192	0.307	157	0.2106	2719	X-RAY DIFFRACTION	98
2.6192-2.6761	0.2647	149	0.1902	2687	X-RAY DIFFRACTION	98
2.6761-2.7384	0.2634	138	0.1933	2681	X-RAY DIFFRACTION	98
2.7384-2.8069	0.2587	154	0.1943	2700	X-RAY DIFFRACTION	98
2.8069-2.8828	0.2764	157	0.2056	2729	X-RAY DIFFRACTION	98
2.8828-2.9676	0.2937	140	0.198	2698	X-RAY DIFFRACTION	98
2.9676-3.0634	0.2671	141	0.1934	2682	X-RAY DIFFRACTION	98
3.0634-3.1729	0.2531	143	0.1868	2741	X-RAY DIFFRACTION	98
3.1729-3.2999	0.2656	149	0.1816	2694	X-RAY DIFFRACTION	98
3.2999-3.4501	0.211	145	0.1678	2745	X-RAY DIFFRACTION	99
3.4501-3.632	0.2004	132	0.1506	2796	X-RAY DIFFRACTION	99
3.632-3.8595	0.1683	164	0.1341	2715	X-RAY DIFFRACTION	100
3.8595-4.1574	0.1922	152	0.1398	2762	X-RAY DIFFRACTION	99
4.1574-4.5757	0.144	142	0.1137	2762	X-RAY DIFFRACTION	100
4.5757-5.2376	0.1649	156	0.1211	2801	X-RAY DIFFRACTION	100
5.2376-6.5978	0.2099	151	0.1667	2781	X-RAY DIFFRACTION	100
6.5978-65.1857	0.1955	146	0.1649	2855	X-RAY DIFFRACTION	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	5.2573	2.8471	1.5001	6.9762	0.8689	1.815	0.1103	-0.1284	-0.439	-0.107	-0.0245	-0.0654	-0.1283	0.2134	-0.1215	0.3164	0.0341	0.0167	0.1747	-0.011	0.1142	116.2632	-227.8296	280.9708
2	1.682	-0.3701	-0.8709	0.1416	0.2545	2.8122	0.1203	0.0794	-0.1776	-0.0265	0.1111	-0.2307	0.3386	0.2547	-0.2341	0.1771	0.0541	-0.021	0.1345	-0.0012	0.1526	125.5804	-223.9407	263.2898
3	1.6284	0.5871	0.0447	3.0455	0.7678	1.5796	0.0978	-0.2949	-0.2609	0.3571	0.0533	-0.5421	0.2276	0.2586	-0.1743	0.2089	0.0587	-0.0492	0.1954	0.0164	0.1704	123.2878	-225.939	271.5926
4	0.707	-0.1718	0.2666	1.9539	1.121	0.8457	0.1047	0.1017	0.0077	-0.2723	0.1239	-0.1173	-0.2228	0.0393	-0.2055	0.1721	0.0031	0.0266	0.136	0.0162	0.0896	116.2492	-216.7291	266.8943
5	3.1341	0.445	-0.4467	3.0889	0.01	2.339	-0.0068	-0.4719	0.1267	0.1993	0.0819	-0.1892	0.4177	0.0734	-0.0509	0.1849	0.0549	-0.0149	0.1875	-0.0087	0.0973	118.1188	-221.5209	277.9369
6	3.0762	2.038	-1.6666	1.8531	0.0833	3.72	-0.1376	-0.3446	-0.5641	0.0552	0.067	-0.1733	0.4029	0.4555	0.0229	0.2048	0.125	0.0147	0.3025	0.067	0.1889	130.1315	-231.8151	268.471
7	3.8238	-1.3445	-0.0497	3.9445	1.3191	2.2819	0.0199	-0.4347	0.0182	0.3335	-0.0755	-0.1272	-0.2328	0.0923	0.0683	0.257	0.0082	0.0375	0.1663	0.0118	0.0963	113.5557	-221.7887	281.6223
8	3.5123	-0.9354	-2.1017	1.1439	0.3925	3.3269	-0.0561	0.5803	0.2734	-0.2563	-0.1722	-0.0423	-0.2021	-0.1363	0.1252	0.3353	-0.0629	0.0133	0.2438	0.0821	0.1597	120.4466	-202.7119	235.5414
9	4.6064	1.1444	-1.7308	3.9268	-1.1324	2.2075	-0.0928	0.201	0.4494	0.0978	0.0524	0.3747	-0.5254	-0.2272	-0.005	0.2024	0.0548	-0.0101	0.1344	0.0122	0.1383	101.491	-204.4794	244.7212
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52	1.197	0.4092	0.8303	1.2866	0.7858	2.2524	0.1382	0.0138	-0.2107	0.1211	0.0789	-0.3093	0.3306	0.1511	-0.1546	0.1464	0.0336	-0.057	0.1552	0.0221	0.2972	125.0855	-191.9854	291.0972
53	0.7795	0.6021	0.4186	0.4856	0.3327	1.422	0.0947	0.1425	-0.1988	0.0508	0.04	-0.2142	0.268	0.2168	-0.1076	0.1496	0.0207	-0.065	0.1283	-0.0269	0.2878	124.8152	-192.2982	285.5713
54	2.4203	2.9175	1.6381	8.5038	5.5944	3.8556	0.2094	0.2072	0.2011	-0.5848	-0.2211	0.038	-0.6575	-0.1135	-0.0328	0.4005	0.0601	0.052	0.1548	-0.0074	0.236	100.794	-151.2449	276.6985
55	5.386	3.7139	-3.0518	4.4895	-4.9092	5.8106	-0.1822	0.5331	0.1015	-0.4786	-0.0237	0.0468	-0.0927	-0.1956	0.0777	0.2625	0.0894	-0.0433	0.2458	-0.0092	0.1294	92.2658	-160.103	275.1976
56	0.2418	-0.2761	0.4034	1.6479	0.239	1.1066	-0.0117	0.1741	-0.0442	-0.2774	0.0514	0.0165	0.0584	0.0352	-0.0427	0.2692	0.0374	-0.0197	0.1296	-0.02	0.0886	105.48	-173.3765	268.6145
57	6.2422	-0.0738	-1.1177	1.7973	0.0216	1.9755	0.0628	0.6929	0.4785	-0.2511	0.0331	0.1843	-0.1207	-0.3559	-0.0923	0.2894	0.0553	-0.0747	0.1939	0.0224	0.144	100.0336	-169.3542	268.4633
58	0.5581	-0.4546	0.3174	0.8904	0.3054	0.9451	0.1331	0.1559	0.1003	0.0898	-0.0807	-0.1167	-0.1041	-0.1415	-0.0184	0.2477	0.0089	0.0366	0.1242	0.0059	0.0926	109.3913	-162.843	270.0323
59	2.7973	1.381	-0.5614	0.9445	-0.6713	0.6861	-0.2264	-0.1287	-0.2545	-0.1602	0.0663	-0.1416	0.0484	-0.105	0.1267	0.2518	0.0184	-0.0118	0.0934	-0.0142	0.1422	104.277	-171.6784	280.0891
60	1.4461	-1.4863	0.2144	4.2959	-0.8847	3.6367	0.19	0.3322	-0.1925	-0.1951	0.1512	0.2461	-0.1016	-0.4078	-0.2471	0.1683	0.0351	-0.0425	0.15	-0.0217	0.1047	95.6043	-163.4511	277.3402
61	1.6403	0.8169	-0.795	1.4286	1.2955	3.1963	-0.0389	0.4031	0.0681	-0.2911	-0.1081	0.1612	-0.1645	-0.3649	0.1079	0.3154	0.0544	-0.0339	0.2188	-0.0121	0.1209	103.4089	-164.7604	260.7533
62	0.3573	0.1892	0.0478	4.5183	-0.8321	4.6349	-0.0161	-0.0828	-0.1383	0.345	-0.0122	0.468	-0.2154	-0.5419	-0.0188	0.1878	0.0538	0.0152	0.1875	-0.0181	0.1046	94.1717	-160.2778	281.6083
63	8.4385	4.133	-1.8476	7.1045	0.4017	1.405	-0.0438	-0.2881	0.7495	0.2118	0.0797	-0.0346	-0.6382	-0.1373	-0.0728	0.402	0.0662	-0.0764	0.1592	-0.0242	0.159	107.9627	-156.6804	305.646
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65	1.5387	-0.9226	-0.2607	1.2535	-0.5597	3.1379	0.097	0.0381	0.3523	-0.2053	0.0424	-0.0662	-0.3325	0.093	-0.0736	0.2993	0.0012	-0.0066	0.0775	0.0087	0.1527	106.7657	-156.8666	285.5463
66	6.7396	3.8281	-3.9168	3.1446	-2.5542	2.3874	0.301	0.0996	0.5711	0.001	0.0396	0.4092	-0.6155	-0.1632	-0.2354	0.7347	0.1436	0.136	0.269	0.0974	0.3528	92.5893	-158.0853	300.5001
67	0.3882	-0.3266	0.6054	0.3993	-0.3286	1.2182	0.0404	0.0023	0.0774	0.0345	0.0162	0.0062	-0.3572	-0.0757	0.0129	0.3944	-0.0096	0.0246	0.13	0.0184	0.0743	112.5444	-155.5368	290.1753
68	2.7029	0.9417	-0.8072	0.3718	-0.2793	0.998	0.0294	-0.0655	-0.2376	-0.1016	-0.1322	-0.0719	0.1351	-0.0734	0.0837	0.2434	0.0177	-0.0138	0.0724	0.0025	0.13	106.677	-168.4968	291.8408
69	1.6263	0.2124	1.7447	2.1555	1.683	2.8686	0.0111	-0.3003	-0.0356	0.1423	0.0192	0.1934	-0.2826	-0.3241	0.0192	0.2839	0.0509	0.032	0.1775	0.0169	0.0815	104.0671	-161.7721	301.6802
70	1.2791	-0.0444	0.7292	0.6117	-0.6435	1.0428	0.0908	-0.2247	-0.0159	0.4457	0.1041	-0.0217	-0.098	-0.1412	0.7776	0.5651	0.1115	-0.0058	0.1312	0.0499	-0.1298	104.2871	-148.3359	289.1216
71	0.9945	0.1248	-0.1491	0.9249	-0.2809	0.0973	-0.2714	-0.1464	0.1049	0.1311	-0.0099	-0.0335	-0.1067	0.048	0.0723	0.355	0.0205	-0.0542	0.1102	0.0033	0.104	108.6205	-161.2678	298.9434
72	5.3208	2.8039	0.3592	1.8218	0.1225	0.079	0.1914	-0.6649	0.3035	0.7652	-0.2599	0.1895	0.0157	-0.3626	0.0359	0.3657	0.048	0.0193	0.3147	-0.037	0.1287	105.0047	-164.1774	310.8211

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 22 through 33 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 34 through 58 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 59 through 81 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 82 through 95 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 96 through 104 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 105 through 120 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 121 through 140 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 22 through 33 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 34 through 45 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 46 through 58 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 59 through 67 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 68 through 104 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 105 through 110 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 111 through 120 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'B' and (resid 121 through 139 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resid 22 through 33 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'C' and (resid 34 through 58 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'C' and (resid 59 through 81 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'C' and (resid 82 through 95 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resid 96 through 104 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'C' and (resid 105 through 120 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'C' and (resid 121 through 139 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'D' and (resid 22 through 33 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'D' and (resid 34 through 58 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'D' and (resid 59 through 67 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'D' and (resid 68 through 81 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'D' and (resid 82 through 95 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'D' and (resid 96 through 120 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'D' and (resid 121 through 139 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'E' and (resid 22 through 33 )
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'E' and (resid 34 through 58 )
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'E' and (resid 59 through 67 )
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'E' and (resid 68 through 95 )
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'E' and (resid 96 through 110 )
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'E' and (resid 111 through 120 )
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'E' and (resid 121 through 140 )
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'F' and (resid 22 through 58 )
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'F' and (resid 59 through 67 )
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'F' and (resid 68 through 95 )
40	X-RAY DIFFRACTION	40	chain 'F' and (resid 96 through 104 )
41	X-RAY DIFFRACTION	41	chain 'F' and (resid 105 through 120 )
42	X-RAY DIFFRACTION	42	chain 'F' and (resid 121 through 139 )
43	X-RAY DIFFRACTION	43	chain 'G' and (resid 22 through 33 )
44	X-RAY DIFFRACTION	44	chain 'G' and (resid 34 through 58 )
45	X-RAY DIFFRACTION	45	chain 'G' and (resid 59 through 67 )
46	X-RAY DIFFRACTION	46	chain 'G' and (resid 68 through 81 )
47	X-RAY DIFFRACTION	47	chain 'G' and (resid 82 through 95 )
48	X-RAY DIFFRACTION	48	chain 'G' and (resid 96 through 104 )
49	X-RAY DIFFRACTION	49	chain 'G' and (resid 105 through 120 )
50	X-RAY DIFFRACTION	50	chain 'G' and (resid 121 through 127 )
51	X-RAY DIFFRACTION	51	chain 'G' and (resid 128 through 139 )
52	X-RAY DIFFRACTION	52	chain 'H' and (resid 22 through 67 )
53	X-RAY DIFFRACTION	53	chain 'H' and (resid 68 through 145 )
54	X-RAY DIFFRACTION	54	chain 'I' and (resid 22 through 26 )
55	X-RAY DIFFRACTION	55	chain 'I' and (resid 27 through 33 )
56	X-RAY DIFFRACTION	56	chain 'I' and (resid 34 through 45 )
57	X-RAY DIFFRACTION	57	chain 'I' and (resid 46 through 67 )
58	X-RAY DIFFRACTION	58	chain 'I' and (resid 68 through 81 )
59	X-RAY DIFFRACTION	59	chain 'I' and (resid 82 through 95 )
60	X-RAY DIFFRACTION	60	chain 'I' and (resid 96 through 104 )
61	X-RAY DIFFRACTION	61	chain 'I' and (resid 105 through 120 )
62	X-RAY DIFFRACTION	62	chain 'I' and (resid 121 through 139 )
63	X-RAY DIFFRACTION	63	chain 'J' and (resid 22 through 33 )
64	X-RAY DIFFRACTION	64	chain 'J' and (resid 34 through 45 )
65	X-RAY DIFFRACTION	65	chain 'J' and (resid 46 through 58 )
66	X-RAY DIFFRACTION	66	chain 'J' and (resid 59 through 67 )
67	X-RAY DIFFRACTION	67	chain 'J' and (resid 68 through 81 )
68	X-RAY DIFFRACTION	68	chain 'J' and (resid 82 through 95 )
69	X-RAY DIFFRACTION	69	chain 'J' and (resid 96 through 104 )
70	X-RAY DIFFRACTION	70	chain 'J' and (resid 105 through 120 )
71	X-RAY DIFFRACTION	71	chain 'J' and (resid 121 through 127 )
72	X-RAY DIFFRACTION	72	chain 'J' and (resid 128 through 140 )

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