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Yorodumi- PDB-5vg6: Crystal structure of D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenas... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 5vg6 | ||||||
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Title | Crystal structure of D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase from Xanthobacter autotrophicus Py2 in complex with NADPH and MES. | ||||||
Components | D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding | ||||||
Keywords | OXIDOREDUCTASE / Structural Genomics / PSI-Biology / New York Structural Genomics Research Consortium / NYSGRC | ||||||
Function / homology | Function and homology information | ||||||
Biological species | Xanthobacter autotrophicus (bacteria) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.2 Å | ||||||
Authors | Lipowska, J. / Shabalin, I.G. / Kutner, J. / Gasiorowska, O.A. / Almo, S.C. / Minor, W. / New York Structural Genomics Research Consortium (NYSGRC) | ||||||
Funding support | United States, 1items
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Citation | Journal: to be published Title: Crystal structure of D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase from Xanthobacter autotrophicus Py2 in complex with NADPH and MES. Authors: Lipowska, J. / Shabalin, I.G. / Almo, S.C. / Minor, W. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 5vg6.cif.gz | 1.2 MB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb5vg6.ent.gz | 1004.7 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 5vg6.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 5vg6_validation.pdf.gz | 3 MB | Display | wwPDB validaton report |
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Full document | 5vg6_full_validation.pdf.gz | 3.1 MB | Display | |
Data in XML | 5vg6_validation.xml.gz | 133.8 KB | Display | |
Data in CIF | 5vg6_validation.cif.gz | 192.4 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/vg/5vg6 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/vg/5vg6 | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | 4xa8S S: Starting model for refinement |
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Similar structure data | |
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-Links
-Assembly
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
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