登録情報 | データベース: PDB / ID: 5v4d |
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タイトル | Crystal Structure of the Protein of Unknown Function of the Conserved Rid Protein Family YyfA from Yersinia pestis |
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要素 | Putative translational inhibitor protein |
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キーワード | Structural genomics / unknown function / alpha-beta fold / enamine/imine demainase (Rid) / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases / CSGID |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
: / deaminase activity / hydrolase activity / metal ion binding / cytosol類似検索 - 分子機能 RidA, conserved site / Uncharacterized protein family UPF0076 signature. / RidA family / YjgF/YER057c/UK114 family / Endoribonuclease L-PSP / RutC-like / RutC-like superfamily / 60s Ribosomal Protein L30; Chain: A; / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 ACETIC ACID / Putative translational inhibitor protein / Putative translational inhibitor protein類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Yersinia pestis (ペスト菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.6 Å |
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データ登録者 | Kim, Y. / Chhor, G. / Endres, M. / Krishnan, A. / Babnigg, G. / Schneewind, O. / Anderson, W.F. / Joachimiak, A. / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases (CSGID) |
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資金援助 | 米国, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Institutes of Health | | 米国 |
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引用 | ジャーナル: To Be Published タイトル: Crystal Structure of the Protein of Unknown Function of the Conserved Rid Protein Family YyfA from Yersinia pestis 著者: Kim, Y. / Chhor, G. / Endres, M. / Krishnan, A. / Babnigg, G. / Schneewind, O. / Anderson, W.F. / Joachimiak, A. / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases (CSGID) |
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履歴 | 登録 | 2017年3月9日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2017年4月5日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2017年9月20日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 1.2 | 2018年1月24日 | Group: Database references / Structure summary / カテゴリ: audit_author / citation_author |
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改定 1.3 | 2023年10月4日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr1_symmetry / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_symmetry |
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