登録情報 | データベース: PDB / ID: 5tg8 |
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タイトル | Crystal structure of H15 hemagglutinin from A/shearwater/WA/2576/1979 H15N9 influenza virus |
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要素 | - Hemagglutinin HA1 chain
- Hemagglutinin HA2 chain
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キーワード | VIRAL PROTEIN / Influenza virus / hemagglutinin / HA / H15N9 / Receptor specificity |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
viral budding from plasma membrane / clathrin-dependent endocytosis of virus by host cell / host cell surface receptor binding / apical plasma membrane / fusion of virus membrane with host plasma membrane / fusion of virus membrane with host endosome membrane / viral envelope / virion attachment to host cell / host cell plasma membrane / virion membrane類似検索 - 分子機能 Hemagglutinin; Chain A, domain 2 / Hemagglutinin Chain A, Domain 2 / Hemagglutinin Ectodomain; Chain B - #10 / Hemagglutinin Ectodomain; Chain B / Hemagglutinin (Ha1 Chain); Chain: A; domain 1 / Haemagglutinin, alpha/beta domain, HA1 chain / Haemagglutinin, influenzavirus A / Haemagglutinin, HA1 chain, alpha/beta domain superfamily / Haemagglutinin / Haemagglutinin, influenzavirus A/B ...Hemagglutinin; Chain A, domain 2 / Hemagglutinin Chain A, Domain 2 / Hemagglutinin Ectodomain; Chain B - #10 / Hemagglutinin Ectodomain; Chain B / Hemagglutinin (Ha1 Chain); Chain: A; domain 1 / Haemagglutinin, alpha/beta domain, HA1 chain / Haemagglutinin, influenzavirus A / Haemagglutinin, HA1 chain, alpha/beta domain superfamily / Haemagglutinin / Haemagglutinin, influenzavirus A/B / Viral capsid/haemagglutinin protein / Ribbon / Alpha-Beta Complex / Mainly Beta / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Influenza A virus (A型インフルエンザウイルス) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 3.1 Å |
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データ登録者 | Wilson, I.A. / Tzarum, N. |
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資金援助 | 米国, 2件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID) | R56 AI117675 | 米国 | National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID) | AI114730 | 米国 |
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引用 | ジャーナル: J. Virol. / 年: 2017 タイトル: Unique Structural Features of Influenza Virus H15 Hemagglutinin. 著者: Tzarum, N. / McBride, R. / Nycholat, C.M. / Peng, W. / Paulson, J.C. / Wilson, I.A. |
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履歴 | 登録 | 2016年9月27日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2017年4月12日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2017年4月26日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2017年6月7日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2017年9月20日 | Group: Author supporting evidence / Refinement description / カテゴリ: pdbx_audit_support / software / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 1.4 | 2019年12月11日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 2.0 | 2020年7月29日 | Group: Advisory / Atomic model ...Advisory / Atomic model / Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_validate_close_contact / struct_asym / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_entity_id / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _pdbx_entity_nonpoly.entity_id / _pdbx_entity_nonpoly.name / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 / _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 / _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 / _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 / _struct_conn.pdbx_role / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation |
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改定 2.1 | 2023年10月4日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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