PDB-5sv0: Structure of the ExbB/ExbD complex from E. coli at pH 7.0

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5sv0

タイトル

Structure of the ExbB/ExbD complex from E. coli at pH 7.0

要素

Biopolymer transport protein ExbB

キーワード

TRANSPORT PROTEIN / ExbB / membrane proteins / pore / channel

機能・相同性

機能・相同性情報

ferrichrome import into cell / energy transducer activity / bacteriocin transport / cobalamin transport / intracellular monoatomic cation homeostasis / plasma membrane protein complex / protein import / transmembrane transporter activity / transmembrane transporter complex / cell outer membrane ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Escherichia coli DH1 (大腸菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.6 Å

データ登録者

Celia, H. / Botos, I. / Lloubes, R. / Buchanan, S.K. / Noinaj, N.

資金援助

米国,

フランス, 4件

組織	認可番号	国
National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)	1K22AI113078-01	米国
National Institutes of Health/National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Disease (NIH/NIDDK)	ZIA DK036139-10	米国
French National Research Agency	ANR-14-CE09-0023	フランス
Projets internationaux de cooperation scientifique	PICS05853	フランス

引用

ジャーナル: Nature / 年: 2016
タイトル: Structural insight into the role of the Ton complex in energy transduction.
著者: Celia, H. / Noinaj, N. / Zakharov, S.D. / Bordignon, E. / Botos, I. / Santamaria, M. / Barnard, T.J. / Cramer, W.A. / Lloubes, R. / Buchanan, S.K.

履歴

登録	2016年8月4日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2016年9月28日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2016年10月5日	Group: Database references
改定 1.2	2016年10月19日	Group: Database references
改定 1.3	2017年9月27日	Group: Author supporting evidence / Database references / Derived calculations カテゴリ: citation / pdbx_audit_support / pdbx_struct_oper_list Item: _citation.journal_id_CSD / _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation
改定 1.4	2017年10月4日	Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.5	2019年12月11日	Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

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PDB形式	pdb5sv0.ent.gz	732.6 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5sv0.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	5sv0_validation.pdf.gz	535.4 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	5sv0_full_validation.pdf.gz	576.8 KB	表示
XML形式データ	5sv0_validation.xml.gz	77.5 KB	表示
CIF形式データ	5sv0_validation.cif.gz	104.9 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sv/5sv0 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sv/5sv0	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	5sv1C C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	5sv1-2 5sv1-1 6tyi-d 5zfv-d 6d6s-d 4a97-2 2p2j-d 2xei-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

B: Biopolymer transport protein ExbB

C: Biopolymer transport protein ExbB

D: Biopolymer transport protein ExbB

E: Biopolymer transport protein ExbB

F: Biopolymer transport protein ExbB

G: Biopolymer transport protein ExbB

H: Biopolymer transport protein ExbB

I: Biopolymer transport protein ExbB

J: Biopolymer transport protein ExbB

A: Biopolymer transport protein ExbB

ヘテロ分子

264 kDa, 10 ポリマー
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1

B: Biopolymer transport protein ExbB

C: Biopolymer transport protein ExbB

D: Biopolymer transport protein ExbB

F: Biopolymer transport protein ExbB

A: Biopolymer transport protein ExbB

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
132 kDa, 5 ポリマー
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2

E: Biopolymer transport protein ExbB

G: Biopolymer transport protein ExbB

H: Biopolymer transport protein ExbB

I: Biopolymer transport protein ExbB

J: Biopolymer transport protein ExbB

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
132 kDa, 5 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	137.166, 104.779, 149.364
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 91.77, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

#1: タンパク質	Biopolymer transport protein ExbB 分子量: 26339.367 Da / 分子数: 10 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Escherichia coli DH1 (大腸菌) / 遺伝子: exbB / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P0ABU8, UniProt: P0ABU7*PLUS
#2: 化合物	ChemComp-EPE / 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID / HEPES / HEPES 分子量: 238.305 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₈H₁₈N₂O₄S / コメント: pH緩衝剤*YM
#3: 化合物	ChemComp-CA / CALCIUM ION / カルシウムジカチオン分子量: 40.078 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Ca
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 142 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
構成要素の詳細	Authors state that all of the experiments indicate that ExbD is present in the structure, but not ...Authors state that all of the experiments indicate that ExbD is present in the structure, but not well ordered. The density for it is not good enough to build into. This happens at neutral pH. However, at low pH, the ExbD helix can be seen clearly. Authors hypothesize that since this complex responds to the proton motive force (proton gradient), the order of the ExbD helix is modulated by pH.

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 4.07 Å³/Da / 溶媒含有率: 69.8 %
結晶化	温度: 288 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法詳細: 100 mM HEPES-NaOH, pH 7.0, 100 mM CaCl2, and 22% PEG MME 550

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 23-ID-D / 波長: 1 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS3 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2014年6月24日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.6→46 Å / Num. obs: 126321 / % possible obs: 96.3 % / 冗長度: 3.5 % / R_sym value: 0.12 / Net I/σ(I): 14.1
反射シェル	解像度: 2.6→2.69 Å / 冗長度: 3.1 % / R_merge(I) obs: 0.9 / Mean I/σ(I) obs: 1.2 / % possible all: 95.7

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	(1.10_2142: ???)	精密化
DENZO	HKL2000	データ削減
SCALEPACK	HKL2000	データスケーリング
PHASER	PHENIX	位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 2.6→46 Å / SU ML: 0.43 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 30.39
詳細: Authors state that all of the experiments indicate that ExbD is present in the structure, but not well ordered. The density for it is not good enough to build into. This happens at neutral pH. ...

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2576	2004	1.59 %
R_work	0.2111	-	-
obs	0.2118	126321	94.43 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.6→46 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	16649	0	47	142	16838

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.01	16953
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.13	22967
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	18.647	10076
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.06	2721
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.007	2959

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.6-2.6407	0.3738	101	0.3443	6528	X-RAY DIFFRACTION	70
2.6407-2.7121	0.3705	148	0.3275	8986	X-RAY DIFFRACTION	96
2.7121-2.7919	0.3538	151	0.3198	8959	X-RAY DIFFRACTION	96
2.7919-2.882	0.3201	140	0.3007	9026	X-RAY DIFFRACTION	96
2.882-2.9849	0.3144	144	0.2852	9075	X-RAY DIFFRACTION	96
2.9849-3.1044	0.3212	158	0.273	9013	X-RAY DIFFRACTION	97
3.1044-3.2457	0.3114	137	0.259	9096	X-RAY DIFFRACTION	97
3.2457-3.4168	0.3137	155	0.2345	9090	X-RAY DIFFRACTION	97
3.4168-3.6307	0.2621	140	0.2121	9092	X-RAY DIFFRACTION	96
3.6307-3.9109	0.2521	166	0.1933	9106	X-RAY DIFFRACTION	97
3.9109-4.3043	0.2331	132	0.1736	9081	X-RAY DIFFRACTION	97
4.3043-4.9265	0.1947	152	0.1623	9129	X-RAY DIFFRACTION	97
4.9265-6.2045	0.2658	141	0.2079	9123	X-RAY DIFFRACTION	96
6.2045-46.3303	0.2108	139	0.1789	9013	X-RAY DIFFRACTION	93

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	8.4056	2.0059	2.6561	1.8437	1.0367	1.5171	-0.3321	-0.4977	1.3945	0.0474	-0.0052	0.3027	-0.1414	-0.2532	0.3936	0.6671	0.0587	-0.0442	0.4899	0.0062	0.561	21.409	-3.9731	-57.8432
2	4.0093	-1.5766	5.3164	5.4773	-1.187	6.9818	0.439	-0.523	-1.2223	0.4646	-0.098	1.1033	0.074	-0.9063	-0.2598	0.4328	0.0156	0.0254	0.3845	-0.0047	0.5574	33.9062	-13.6381	-55.384
3	3.7588	1.5614	5.1321	5.7363	2.0891	6.6628	1.467	-0.8777	-0.2818	0.2427	-0.8564	0.8089	1.0132	-0.3981	-0.3973	0.4632	-0.0587	0.0004	0.4987	0.1464	1.0083	-11.9362	-20.6934	-72.2703
4	3.3057	1.0399	1.9031	1.1394	0.3597	1.0318	0.0488	-0.0722	0.6935	0.0145	-0.092	0.2683	0.0007	0.0353	0.0212	0.4722	0.0102	-0.1202	0.4988	-0.0695	0.5956	24.6454	-8.0556	-65.1973
5	8.2189	1.2746	3.5374	0.4328	0.4678	2.4797	-0.0548	-1.1647	0.2281	0.1314	0.0111	0.2296	-0.007	-0.5551	0.0539	0.5966	0.0853	0.0226	0.4325	0.064	0.6799	18.931	-30.979	-49.812
6	7.9069	-0.7958	3.803	0.8343	-0.1969	2.4652	0.0238	0.1506	-0.3446	0.0067	0.1277	0.4132	0.1149	-0.0371	-0.1397	0.45	-0.0294	0.0119	0.3525	0.1247	0.6327	12.7165	-29.7593	-63.8507
7	6.1273	1.0133	2.6362	2.3654	0.775	2.1891	0.0582	0.2806	-0.2931	-0.1287	0.0118	0.0858	0.0842	0.1101	-0.1166	0.363	0.0284	0.0029	0.3176	-0.0071	0.3986	32.5318	-46.2066	-70.1557
8	8.9872	-0.6593	0.8407	5.8389	-0.5039	5.7611	0.4509	0.6349	0.8648	-0.9098	-0.1607	0.7559	-0.0205	-0.8432	-0.2772	0.6183	0.0697	-0.1364	0.456	0.056	0.6321	-2.7391	-33.2252	-93.0368
9	6.0959	-1.0173	6.5866	1.2001	-0.5191	6.89	0.2672	-0.5222	0.1621	-0.0763	-0.0921	0.3068	0.3175	-0.4333	-0.2806	0.372	-0.0566	0.0071	0.2736	0.0911	0.574	21.7588	-39.7033	-70.077
10	0.6955	0.1536	1.8251	0.8101	1.1087	7.5192	-0.0474	0.1944	-0.1277	-0.3142	-0.136	0.407	-0.293	0.0559	0.1916	0.5576	-0.032	-0.0522	0.5289	0.0228	0.5691	54.8093	-15.1404	-120.7967
11	1.0017	-0.009	0.8692	2.1039	0.9122	2.6435	-0.0103	0.22	-0.1399	-0.5721	0.0469	0.2217	-0.6785	0.0636	-0.0913	0.3976	-0.0649	-0.0367	0.5231	0.032	0.4679	58.8747	-12.7932	-129.2681
12	8.1438	-1.5492	2.2522	1.8687	0.3802	1.8208	0.4098	0.5963	-0.5972	-0.2279	-0.1203	0.2994	0.2088	0.11	-0.3269	0.5171	-0.0778	0.0067	0.4845	0.1502	0.4706	36.3863	-31.3315	-91.7572
13	3.7307	1.0165	2.0805	-0.1963	0.3288	1.0999	-0.2355	-0.5331	1.3469	-0.1294	-0.1282	0.1084	-0.1848	-0.3336	0.2983	0.566	0.1214	-0.0944	0.5212	0.0247	0.6349	21.9051	-20.9979	-87.9841
14	1.9491	0.0455	0.0604	1.3903	0.4857	0.6728	0.0556	-0.5781	-0.059	-0.2269	-0.1492	0.2658	-0.0195	-0.3132	0.0529	0.379	-0.0185	0.0113	0.4805	-0.0157	0.3618	23.7933	-29.5381	-86.4086
15	6.4326	-1.9558	4.0085	7.1952	-4.991	4.6512	2.1746	-0.0528	-1.8215	-2.0631	-1.0131	2.5047	1.1665	0.3187	-1.3074	1.5733	0.0138	-0.2576	0.8486	-0.0794	1.352	55.089	-41.1101	-166.6372
16	-1.3754	0.4932	-0.3945	0.2096	2.1785	3.8429	-0.1173	0.0616	0.017	-0.176	-0.5466	0.3693	-0.1923	-1.5833	0.9777	1.0174	0.1574	-0.1866	1.2186	-0.1492	0.6504	57.5012	-38.4227	-127.8541
17	7.1115	2.0469	1.6179	4.8796	2.2641	8.0867	0.0215	0.3592	-0.7271	-0.1871	-0.1477	0.0035	0.773	-0.1188	0.128	0.4807	0.0745	0.0757	0.3308	-0.0074	0.4547	69.7256	-36.8951	-104.8227
18	4.7272	1.6543	-4.0368	2.2901	-1.793	3.254	-0.2057	0.1584	-0.1161	-0.3904	-0.2181	0.0201	-0.5655	0.4262	0.5574	1.2962	0.0634	-0.1368	0.3822	-0.0539	0.4524	67.0797	-32.4964	-159.5589
19	0.0955	0.1438	-0.9703	1.289	0.8748	2.4511	-0.2272	0.0622	-0.0096	-0.1744	-0.2003	0.2374	-0.9604	-0.6801	0.5673	0.5187	0.0705	-0.0856	0.5617	-0.0412	0.4688	62.8947	-29.9623	-121.05
20	0.4902	-0.4816	1.5428	0.9511	-2.0445	7.8217	0.092	0.0791	-0.0033	-0.3793	0.0394	0.0039	1.0721	0.2846	-0.1558	0.7647	0.0268	-0.1021	0.4633	-0.0482	0.567	88.7994	-37.5996	-128.8687
21	0.7025	-0.4541	1.907	0.2602	-1.255	3.3799	-0.4213	0.2732	0.3294	-0.4501	-0.2754	-0.1105	-0.4158	0.4671	0.735	1.0738	-0.0438	-0.0313	0.5282	0.0136	0.5291	83.6402	-24.1873	-139.6916
22	1.2656	-0.3556	1.6996	1.7581	0.0573	2.6279	0.0958	-0.0232	-0.0169	-0.2072	0.1068	0.0374	0.4938	0.0853	-0.143	0.5813	-0.0229	-0.0699	0.3374	-0.0089	0.4596	79.637	-31.9851	-133.4074
23	0.072	0.2907	0.854	4.0723	5.3839	9.7213	-0.2868	1.3023	0.9241	-1.4734	-0.0421	-1.1047	-0.4218	0.6298	0.3588	1.2915	-0.0826	0.1351	1.258	0.2353	0.9372	82.1271	-4.9494	-169.2453
24	6.814	-4.7996	5.5913	3.216	-3.8658	4.1008	0.3105	0.1796	-0.4005	-0.2677	0.2106	0.1476	0.5326	0.8733	-0.4266	0.8954	0.0614	0.0147	0.6483	-0.0837	0.6194	93.9833	-11.2474	-140.4821
25	3.368	-1.1114	2.5926	2.6806	0.9022	3.3676	-0.2366	-0.0538	0.4141	-0.264	-0.0352	-1.2349	0.5373	1.2262	0.7565	0.5977	0.1145	0.0675	0.7355	-0.1258	0.7324	107.4578	-14.5971	-114.1502
26	4.3419	-2.7592	-3.9995	4.999	4.9205	9.127	-0.1184	-0.4467	0.2458	0.0725	0.4647	-0.3849	-0.1211	0.809	-0.2708	0.5973	-0.0248	-0.0677	0.4199	-0.0637	0.503	97.0804	-8.059	-106.5676
27	5.5903	-1.4009	3.7062	3.0088	-0.1595	2.8041	-0.204	0.4708	0.2015	-0.6128	-0.0732	-0.292	-0.5273	-0.7908	0.3838	0.6396	-0.0287	-0.0366	0.3688	-0.0281	0.4706	89.4355	-9.0486	-116.9306
28	8.6793	-1.3488	5.7581	0.0692	-1.1281	8.4988	-0.2382	0.1958	0.5398	-0.5864	-0.3948	-0.0413	-0.6083	-0.3365	0.4574	1.4143	-0.0894	-0.2288	0.5216	0.0262	0.745	69.7553	-6.7562	-160.2811
29	2.5556	0.0053	3.009	1.3147	-0.1942	4.0741	0.3952	0.2781	-0.2761	-0.3355	0.2094	-0.0462	0.4519	0.5791	-0.7116	0.6454	-0.0319	0.0407	0.3412	-0.0645	0.4686	87.1686	-15.9282	-133.2915
30	4.7432	-0.0656	5.5218	2.317	0.1136	8.7879	-0.3004	0.412	0.1748	-0.449	-0.0264	0.3071	-0.4291	0.1048	0.4695	0.6704	-0.0556	-0.0293	0.4578	0.0436	0.4373	73.97	8.0778	-127.0704
31	5.814	2.2536	-3.4244	5.1283	-4.983	5.194	0.2902	-0.5884	0.004	1.0582	0.0742	0.616	-1.0789	-0.0651	-0.3347	0.5406	0.0459	-0.0585	0.5656	-0.0515	0.4406	75.6695	1.5975	-100.4847
32	8.2446	-3.5274	7.1281	7.8621	-6.3311	8.5873	0.5591	0.1172	-0.042	-0.9108	0.4895	1.1313	0.9836	-1.3961	-0.8715	0.4667	-0.0461	-0.0693	0.5299	0.0124	0.4684	72.0897	-3.1124	-112.0911
33	4.6066	0.1743	1.3918	1.1319	-1.4118	2.4663	-0.6316	0.6804	0.471	-1.1131	-0.1786	0.9404	0.5117	-0.6225	0.7315	1.2974	-0.0794	-0.5193	0.8097	-0.0639	0.8418	55.4652	-8.7819	-156.0434
34	4.1286	0.6502	4.8064	1.7368	1.2032	4.3451	-0.2743	0.3199	0.0912	-0.3802	0.086	0.1264	-0.4539	0.2898	0.2088	0.5141	-0.0559	0.0098	0.3464	-0.0122	0.3842	75.0382	-2.039	-129.5183
35	6.1403	-0.5556	0.5292	0.0646	-0.8611	-0.8732	0.4662	1.5092	0.3679	-0.2133	-0.3029	0.0637	0.0884	0.0767	-0.1579	0.5998	0.1032	-0.1614	1.0193	-0.1807	0.8112	11.9692	-3.1657	-91.2804
36	6.3185	0.5706	1.4193	4.7727	-1.1877	6.6494	-0.1741	0.056	0.5484	-0.1079	-0.0667	-0.0158	-0.6424	-0.1224	0.3036	0.3524	0.0088	0.0232	0.3113	-0.0086	0.4431	47.7639	-5.8162	-75.0293
37	4.8154	2.859	-3.7778	4.0777	-1.5877	4.0818	1.2138	-0.4139	-0.2723	-0.0168	-0.6304	0.3387	0.1077	-0.1516	-0.4109	0.4684	0.069	-0.1955	0.4865	-0.0271	1.0128	-7.9126	-9.7219	-82.7039
38	8.9456	-0.1727	1.6924	0.7669	-0.0846	0.7166	0.0348	0.1947	-0.175	-0.0363	-0.0434	0.1378	-0.0574	0.0053	-0.069	0.4212	0.0003	-0.0606	0.4815	0.0348	0.5455	31.0254	-12.465	-82.9443

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'B' and (resid 10 through 105 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'B' and (resid 106 through 129 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'B' and (resid 130 through 170 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'B' and (resid 171 through 234 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'C' and (resid 11 through 105 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'C' and (resid 106 through 232 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'D' and (resid 19 through 129 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'D' and (resid 130 through 166 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'D' and (resid 167 through 233 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'E' and (resid 19 through 159 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'E' and (resid 160 through 234 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'F' and (resid 12 through 105 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'F' and (resid 106 through 159 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'F' and (resid 160 through 234 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'G' and (resid 7 through 20 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'G' and (resid 21 through 67 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'G' and (resid 68 through 129 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'G' and (resid 130 through 170 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'G' and (resid 171 through 235 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'H' and (resid 10 through 105 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'H' and (resid 106 through 161 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'H' and (resid 162 through 234 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'I' and (resid 10 through 21 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'I' and (resid 22 through 63 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'I' and (resid 64 through 82 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'I' and (resid 83 through 105 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'I' and (resid 106 through 129 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'I' and (resid 130 through 166 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'I' and (resid 167 through 232 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'J' and (resid 19 through 82 )
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'J' and (resid 83 through 105 )
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'J' and (resid 106 through 129 )
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'J' and (resid 130 through 167 )
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'J' and (resid 168 through 232 )
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'A' and (resid 2 through 64 )
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'A' and (resid 65 through 129 )
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'A' and (resid 130 through 170 )
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'A' and (resid 171 through 234 )

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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