登録情報 | データベース: PDB / ID: 5qcc |
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タイトル | Crystal structure of human Cathepsin-S with bound ligand |
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要素 | Cathepsin S |
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キーワード | HYDROLASE (加水分解酵素) / D3R / Cathepsin S / Ligand Docking (ドッキング (分子)) |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報 |
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生物種 | ![](img/tx_human.gif) Homo sapiens (ヒト) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 1.8 Å |
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Model details | Structures re-refined for D3R docking challenge |
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データ登録者 | Bembenek, S.D. / Ameriks, M.K. / Mirzadegan, T. / Yang, H. / Shao, C. / Burley, S.K. |
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引用 | ジャーナル: To be published タイトル: Crystal structure of human Cathepsin-S with bound ligand 著者: Bembenek, S.D. / Ameriks, M.K. / Mirzadegan, T. / Yang, H. / Shao, C. / Burley, S.K. |
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履歴 | 登録 | 2017年8月4日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2017年12月20日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2018年2月21日 | Group: Structure summary / カテゴリ: pdbx_deposit_group / Item: _pdbx_deposit_group.group_type |
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改定 2.0 | 2018年6月6日 | Group: Atomic model / Data collection ...Atomic model / Data collection / Derived calculations / Refinement description / Structure summary カテゴリ: atom_site / computing ...atom_site / computing / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_poly_seq_scheme / refine / refine_hist / refine_ls_restr / refine_ls_restr_ncs / refine_ls_shell / reflns / software / struct_ncs_dom / struct_ncs_dom_lim / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.occupancy / _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id ..._atom_site.occupancy / _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id / _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num / _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id / _refine.B_iso_max / _refine.B_iso_mean / _refine.B_iso_min / _refine.ls_R_factor_R_free / _refine.ls_R_factor_R_work / _refine.ls_R_factor_obs / _refine.ls_d_res_high / _refine.ls_d_res_low / _refine.ls_number_reflns_R_work / _refine.ls_percent_reflns_obs / _refine_hist.cycle_id / _refine_hist.d_res_high / _refine_hist.d_res_low / _refine_hist.pdbx_B_iso_mean_ligand / _refine_hist.pdbx_B_iso_mean_solvent / _refine_hist.pdbx_number_residues_total / _refine_ls_restr.dev_ideal / _refine_ls_restr.number / _refine_ls_restr.type / _refine_ls_restr_ncs.pdbx_rms / _refine_ls_restr_ncs.pdbx_type / _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error / _refine_ls_shell.number_reflns_all / _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used / _reflns.percent_possible_obs / _software.contact_author / _software.contact_author_email / _software.language / _software.location / _software.type / _struct_ncs_dom.details / _struct_site.pdbx_num_residues |
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改定 2.1 | 2021年2月10日 | Group: Database references / Structure summary / カテゴリ: audit_author / citation_author Item: _audit_author.identifier_ORCID / _citation_author.identifier_ORCID |
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改定 2.2 | 2021年11月17日 | Group: Advisory / Database references / Structure summary カテゴリ: database_2 / pdbx_deposit_group / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_deposit_group.group_description |
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